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核酸分子雜交ppt課件(2)-在線瀏覽

2025-06-29 04:01本頁面
  

【正文】 ?掌握植物總 RNA提取的方法并熟練操作 ?用甲醛變性凝膠進(jìn)行電泳,檢測總 RNA提取質(zhì)量 ?對于不同的植物組織,選取不同的提取方法,提取植物的總 RNA 實(shí)驗(yàn)原理 ? 細(xì)胞破碎,核酸溶出 – 液氮速凍后,對植物組織進(jìn)行 研磨 可以破碎細(xì)胞。 – 細(xì)胞 提取液 可溶出核酸。 – 多糖、次生代謝物 ? 核酸的保護(hù)( 內(nèi)源 RNA酶) – 低溫、苯酚、氯仿、 SDS可以部分抑制 RNA酶的活性,保護(hù) RNA不被酶解。L的 β巰基乙醇(終濃度 5%)。 3. 加入苯酚 /氯仿 /異戊醇( 25:24:1)各 350181。 4. 取上清,加入等體積的氯仿 /異戊醇( 24:1),搖床震蕩 10min,4℃ 8000rpm離心 10min。 20℃ 放置 20min后 4℃ , 12022 rpm離心 10 min。 7. 棄上清,通風(fēng)櫥內(nèi)干燥沉淀。L滅菌水中,備用。g/ml單鏈 RNA,以此來計(jì)算樣品含量。 實(shí)驗(yàn)步驟 ? RNA電泳 – RNA變性處理 ? 1ul RNA樣品加入 上樣緩沖液,混勻后 65℃ 溫育510min置于冰上冷卻( 20ul RNA+50ul上樣緩沖液) – 檢測 RNA的凝膠要配制 ? MOPS ? 甲醛 – 電泳緩沖液為 1 M0PS 實(shí)驗(yàn)步驟 ? 用透明膠帶將膠板的兩端封好。 – 10 MOPS( MOPS , NaAC 50mM, EDTA 10mM, ) ? 待溶液冷卻至 60℃ 左右,加入10ml甲醛, 4ulEB替代品充分混勻。 注意事項(xiàng) ? 特別要注意的是在所有器具嚴(yán)格消毒,實(shí)驗(yàn)過程中需要帶手套,減少說話和走動等防止 RNase的污染,來保證RNA不被降解。 – 屬于蛋白質(zhì)分子“雜交”的 Western雜交。 ? 雜交的雙方是待測核酸及探針( probe) – 待測核酸序列可以是克隆的基因片段,也可以是基因組 DNA或總 RNA – 被人為標(biāo)記上,該標(biāo)記可以通過某種特定方法檢出,即成為所謂的探針。 ? 要證明外源基因在植物染色體上整合的最可靠的方法是,只有經(jīng)分子雜交鑒定過的植物才可以稱為轉(zhuǎn)基因植物。 實(shí)驗(yàn)原理-分子雜交 ? Northern雜交是以 DNA或 RNA為 探針 ,檢測 RNA鏈,用于外源基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物特異 mRNA的檢測。 ? 利用探針中的 digoxigenin和 antidigoxigeninAp抗體結(jié)合,再通過堿性磷酸酶 AP與 CDPstar底物作用,檢測 CDPstar的化學(xué)發(fā)光間接進(jìn)行定量分析。 實(shí)驗(yàn)原理- Northern雜交 實(shí)驗(yàn)原理- RNA提取 ? 細(xì)胞破碎,核酸溶出 – 液氮速凍后,對植物組織進(jìn)行 研磨 可以破碎細(xì)胞。 ? 核酸的純化 – DNA的去除 – 酚、氯仿抽提使 蛋白質(zhì) 變性、沉淀,可去除蛋白。 ? 探針 – 探針序列需與感興趣的基因互補(bǔ) – 探針需要有熒光或同位素標(biāo)記以利于檢測 – 長度一般為 252022bp的 DNA或 RNA 實(shí)驗(yàn)原理- 探針制備 gene X PCR probe U 堿性磷酸酶 OPO3 HPO4 O O 目標(biāo) mRNA Spacer Digoxigenin探針 AntiDigoxigenin Antibody Digoxigenin Hapten Alkali
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