20xx年醫(yī)學(xué)專(zhuān)題—5-蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)-資料下載頁(yè)
2025-10-22 13:13本頁(yè)面
【正文】 進(jìn)行建模 用動(dòng)力學(xué)方程跟蹤蛋白質(zhì)折疊時(shí)每個(gè)原子的位置 求解(qi jiě)這些方程的解析解是極其困難的 用離散動(dòng)力系統(tǒng)的方法來(lái)確定數(shù)值解 問(wèn)題 模擬蛋白質(zhì)折疊過(guò)程是非常消耗時(shí)間的 模擬 109 秒的蛋白質(zhì)折疊過(guò)程大約需要一天時(shí)間 蛋白質(zhì)的實(shí)際折疊時(shí)間大約在 104 秒的數(shù)量級(jí)或者更多 需要超級(jí)計(jì)算機(jī),第三十五頁(yè)，共四十頁(yè)。,新的趨勢(shì)(qūsh236。),混合(h249。nh233。)預(yù)測(cè)方法 在比較建模法和折疊識(shí)別法中使用從頭預(yù)測(cè)法來(lái)預(yù)測(cè)局部難以找到模板的片斷 在從頭預(yù)測(cè)法中使用二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的結(jié)果和其他結(jié)構(gòu)信息輔助建模 Metapredictor 使用多個(gè)預(yù)測(cè)方法 對(duì)收集的結(jié)果進(jìn)行綜合比較和分析 改進(jìn)收集的結(jié)果,第三十六頁(yè)，共四十頁(yè)。,本章(běn zhānɡ)小結(jié),重點(diǎn)介紹(ji232。sh224。o)一些常用的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析技術(shù) 獲取蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)方法 預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的理論方法 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)比對(duì) 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 隨著蛋白質(zhì)分析技術(shù)的不斷深入，將促進(jìn)我們從系統(tǒng)生物學(xué)的層次全面了解蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能,第三十七頁(yè)，共四十頁(yè)。,Thanks for your attention!,The end~,第三十八頁(yè)，共四十頁(yè)。,用Swissmodel分析如下序列，進(jìn)行三級(jí)結(jié)構(gòu)(ji233。g242。u)建模，取3個(gè)結(jié)果，并分析所得模型,MSSGQCRSANAEDAQEFISDVERAIETLIIKNFHQSYSSVESNLAIGGKESTLTPSELRDLVTLLLKSSKPHLMPSNCGLEEKIASNLGSCKKNDSKLEEFRSFWAELLIGEAAKKSSVKLERPVRGH。,第三十九頁(yè)，共四十頁(yè)。,內(nèi)容(n232。ir243。ng)總結(jié),蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。對(duì)于具有60%等同的序列，用上述方法所建立的三維模型非常準(zhǔn)確。一般如果序列的等同局部大于30%，那么可以期望得到比較好的預(yù)測(cè)結(jié)果?！?〕一種適合于進(jìn)行序列結(jié)構(gòu)比對(duì)的三維折疊信息的表示(biǎosh236。)方法。〔3〕一個(gè)序列結(jié)構(gòu)匹配函數(shù)，該函數(shù)對(duì)匹配程度進(jìn)行打分?！?〕建立最優(yōu)線索的策略，或者是進(jìn)行序列結(jié)構(gòu)比對(duì)的策略。Cij為第i個(gè)核心區(qū)域第j個(gè)氨基酸位置。g3 (?,t)評(píng)價(jià)環(huán)區(qū)，根據(jù)環(huán)區(qū)的大小進(jìn)行打分,第四十頁(yè)，共四十
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