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2025-06-18 12:57本頁面
  

【正文】 應(yīng)板布局或反應(yīng)孔表(實(shí)驗(yàn))選項(xiàng)卡-為每個(gè)打開的實(shí)驗(yàn)顯示一個(gè)選項(xiàng)卡。2)如何選擇反應(yīng)孔要在分析屏幕上顯示特定反應(yīng)孔,在ViewPlateLayout(查看反應(yīng)板布局)選項(xiàng)卡上選擇相應(yīng)的反應(yīng)孔,操作如下:,使用SelectWellsWith(選擇反應(yīng)孔類型)下拉菜單:選擇Sample(樣本)、Target(靶)或Task(任務(wù)),然后選擇樣本、靶或任務(wù)名稱。,在反應(yīng)板布局中單擊該反應(yīng)孔。,按住CTRL鍵并單擊、或按住Shift鍵并單擊反應(yīng)板布局中的某反應(yīng)孔并拖移鼠標(biāo)覆蓋所需的反應(yīng)孔。,單擊反應(yīng)板布局的左上角。3)如何顯示多條曲線使用MultiplePlots(多曲線)屏幕可同時(shí)顯示最多4條曲線。要在MultiplePlots(多曲線)屏幕內(nèi)導(dǎo)航:(實(shí)驗(yàn)菜單)窗格中,選擇Analysis(分析)→MultiplePlotsView(多曲線視圖)。,單擊∷Showplotsina22matrix(以22窗格方式顯示曲線)。,單擊∶Showplotsintworows(以兩行顯示曲線)。,單擊‥Showplotsintwocolumns(以兩列顯示曲線)。,從每條曲線顯示上方的下拉菜單中選擇該曲線。查看標(biāo)準(zhǔn)曲線StandardCurve(標(biāo)準(zhǔn)曲線)屏幕顯示指定為標(biāo)準(zhǔn)品的樣本的標(biāo)準(zhǔn)曲線。StepOne軟件根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算未知靶的數(shù)量。在StandardCurve(標(biāo)準(zhǔn)曲線)屏幕上檢查以下回歸系數(shù)值:?Slope(斜率)/擴(kuò)增效率斜率/擴(kuò)增效率值-擴(kuò)增效率通過使用標(biāo)準(zhǔn)曲線中回歸線的斜率來計(jì)算。斜率接近?,即100%PCR擴(kuò)增效率。影響擴(kuò)增效率的因素包括:–標(biāo)準(zhǔn)品數(shù)量范圍,為了獲得更準(zhǔn)確及更精確的效率測(cè)量值,使用大范圍的標(biāo)準(zhǔn)品數(shù)量(5至6個(gè)對(duì)數(shù)級(jí)(105至106倍)。–標(biāo)準(zhǔn)品重復(fù)數(shù),為了獲得更準(zhǔn)確的效率測(cè)量值,包括重復(fù)數(shù)以降低移液誤差的影響。–PCR抑制劑-反應(yīng)中的PCR抑制劑可降低擴(kuò)增效率。?R2值(相關(guān)系數(shù))R2值表示標(biāo)準(zhǔn)曲線回歸線與標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)的單個(gè)CT數(shù)據(jù)點(diǎn)之間的擬合程度。R2值。?CT值閾值循環(huán)(CT)是熒光水平達(dá)到閾值時(shí)的PCR循環(huán)數(shù)。CT值8且35較理想。CT值8表明反應(yīng)中有太多模板。CT值35表明反應(yīng)中靶的數(shù)量太少;對(duì)于CT值35的情況,期望更高的標(biāo)準(zhǔn)偏差。1)從ExperimentMenu(實(shí)驗(yàn)菜單)窗格中,選擇Analysis(分析)StandardCurve(標(biāo)準(zhǔn)曲線)。注意:如果StandardCurve(標(biāo)準(zhǔn)曲線)屏幕中未顯示數(shù)據(jù),單擊Analyze(分析)。2)在ViewPlateLayout(查看反應(yīng)板布局)選項(xiàng)卡上單擊反應(yīng)板布局的左上角,以在StandardCurve(標(biāo)準(zhǔn)曲線)屏幕上顯示全部48個(gè)反應(yīng)孔。3)從Target(靶)下拉菜單中,選擇All(全部)。4)從PlotColor(曲線顏色)下拉菜單中,選擇Default(默認(rèn))。5)單擊Show/Hidetheplotlegend(顯示/隱藏曲線圖例)。6)查看標(biāo)準(zhǔn)曲線下面顯示的值。在示例實(shí)驗(yàn)中,靶(RNaseP)的值在可接受范圍之內(nèi):–斜率為?。–R2值為1。–擴(kuò)增效率(Eff%)%。7)檢查所有樣本均在標(biāo)準(zhǔn)曲線內(nèi)。在示例實(shí)驗(yàn)中,所有樣本(藍(lán)點(diǎn))均在標(biāo)準(zhǔn)曲線(紅點(diǎn))內(nèi)。8)檢查CT值:(查看反應(yīng)孔表)選項(xiàng)卡。(分類方式)下拉菜單中,選擇Replicate(重復(fù))。在示例實(shí)驗(yàn)中,CT值在預(yù)期范圍(8且35)內(nèi)。查看擴(kuò)增曲線①AmplificationPlot(擴(kuò)增曲線)屏幕上顯示所選反應(yīng)孔內(nèi)所有樣本的擴(kuò)增情況。有三種曲線可供選擇:??Rn隨循環(huán)變化-?Rn是PCR運(yùn)行生成的歸一化熒光信號(hào)的量值,且是計(jì)算CT所依據(jù)的數(shù)據(jù)。此曲線將?Rn作為循環(huán)數(shù)的一個(gè)函數(shù)顯示。您可通過此曲線來識(shí)別并檢查不規(guī)則擴(kuò)增,并查看運(yùn)行的閾值和基線值。?Rn隨循環(huán)變化-Rn是歸一化報(bào)告熒光染料。此曲線將Rn作為循環(huán)數(shù)的一個(gè)函數(shù)顯示。您可通過此圖來識(shí)別和檢查不規(guī)則擴(kuò)增。?CT隨反應(yīng)孔變化-閾值循環(huán)(CT)是熒光水平達(dá)到閾值時(shí)的PCR循環(huán)數(shù)。此曲線將閾值循環(huán)(CT)作為反應(yīng)孔位置的函數(shù)顯示。您可使用此曲線查找異常擴(kuò)增(異常值)。每條曲線可采用圖形方式查看:線性或log10。②可在AmplificationPlot(擴(kuò)增曲線)屏幕上查看靶,以檢查:?正確的基線值和閾值正確的基線值和閾值-StepOne軟件自動(dòng)計(jì)算基線值和閾值(基于數(shù)據(jù)顯示典型擴(kuò)增曲線的假定)。典型擴(kuò)增曲線包含:(幾何級(jí)增長期)。切記!實(shí)驗(yàn)性錯(cuò)誤(如污染物或移液錯(cuò)誤)可產(chǎn)生非典型擴(kuò)增曲線,從而導(dǎo)致StepOne軟件計(jì)算出錯(cuò)誤的基線值和閾值。因此,建議在分析完成后檢查AmplificationPlot(擴(kuò)增曲線)屏幕,并查看為每個(gè)反應(yīng)孔指定的基線值和閾值。?異常值如果您的實(shí)驗(yàn)不符合上述指南,則進(jìn)行下列故障排除:手動(dòng)調(diào)整基線和/或閾值忽略反應(yīng)孔1)從ExperimentMenu(實(shí)驗(yàn)菜單)窗格中,選擇Analysis(分析)AmplificationPlot(擴(kuò)增曲線)。注意:如果AmplificationPlot(擴(kuò)增曲線)屏幕上未顯示數(shù)據(jù),單擊Analyze(分析)。2)在AmplificationPlot(擴(kuò)增曲線)屏幕上顯示RNaseP(示例)反應(yīng)孔:(查看反應(yīng)板布局)選項(xiàng)卡。(選擇反應(yīng)孔)下拉菜單中,選擇Target(靶),然后選擇RNaseP(示例)。3)在AmplificationPlot(擴(kuò)增曲線)屏幕上:(曲線類型)下拉菜單中,選擇?RnvsCycle(?Rn隨循環(huán)變化)。(標(biāo)記曲線顏色方式)下拉菜單中,選擇Well(按反應(yīng)孔)。(顯示/隱藏曲線圖例)。4)查看基線值:(圖形類型)下拉菜單中,選擇Linear(線性)。(基線)復(fù)選框,以顯示開始循環(huán)和結(jié)束循環(huán)。在示例實(shí)驗(yàn)中,基線在擴(kuò)增開始之前設(shè)置。5)查看閾值:(圖形類型)下拉菜單中,選擇Log(對(duì)數(shù))。(靶)下拉菜單中,選擇RNaseP。(閾值)復(fù)選框以顯示閾值。在示例實(shí)驗(yàn)中,閾值位于指數(shù)級(jí)擴(kuò)增階段。6)查找任何異常值:(曲線類型)下拉菜單中,選擇CTvsWell(CT隨反應(yīng)孔變化)。在示例實(shí)驗(yàn)中,無RNaseP異常值。查看反應(yīng)孔表WellTable(反應(yīng)孔表)顯示反應(yīng)板中每個(gè)反應(yīng)孔的數(shù)據(jù),包括:?樣本名稱、靶名稱、任務(wù)和染料?計(jì)算的閾值循環(huán)(CT)值、歸一化熒光(Rn)值和量值?注釋?標(biāo)記查看反應(yīng)孔表以檢查:?數(shù)量值?標(biāo)記?CT值(包括CT標(biāo)準(zhǔn)偏差)1)從ExperimentMenu(實(shí)驗(yàn)菜單)窗格中,選擇Analysis(分析),然后選擇ViewWellTable(查看反應(yīng)孔表)選項(xiàng)卡。注意:如果反應(yīng)孔表中未顯示數(shù)據(jù),單擊Analyze(分析)。2)使用(分類方式)下拉菜單,以按特定類別將反應(yīng)孔分類。將反應(yīng)孔按重復(fù)、標(biāo)記或CT值分類。(注意:一次只能選擇一個(gè)類別)(分類方式)下拉菜單中,選擇Replicate(重復(fù))。軟件將重復(fù)反應(yīng)的反應(yīng)孔分為:陰性對(duì)照、標(biāo)準(zhǔn)品和樣本。請(qǐng)注意每個(gè)重復(fù)反應(yīng)組內(nèi)的數(shù)量相同。Replicate(重復(fù))-軟件按重復(fù)反應(yīng)將反應(yīng)孔分為:陰性對(duì)照、標(biāo)準(zhǔn)品和樣本。查看Quantity(數(shù)量)列以確保每個(gè)重復(fù)反應(yīng)組的數(shù)量值相同。這表明嚴(yán)格的精確度。(分類方式)下拉菜單中,選擇Flag(標(biāo)記)。軟件將反應(yīng)孔分為標(biāo)記反應(yīng)孔和未標(biāo)記反應(yīng)孔。無標(biāo)記反應(yīng)孔。Flag(標(biāo)記)-軟件將反應(yīng)孔分為標(biāo)記反應(yīng)孔和未標(biāo)記反應(yīng)孔。標(biāo)記表示軟件已在標(biāo)記反應(yīng)孔內(nèi)找到錯(cuò)誤。(分類方式)下拉菜單中,選擇CT。軟件將反應(yīng)孔按CT值分為:低、中、高和未確定。CT-閾值循環(huán)(CT)是熒光水平達(dá)到閾值時(shí)的PCR循環(huán)數(shù)。CT值8且35較理想。CT值8表明反應(yīng)中有太多模板。CT值35表明反應(yīng)中靶的數(shù)量太少;對(duì)于CT值35的情況,期望更高的標(biāo)準(zhǔn)偏差。公布數(shù)據(jù)可以下列幾種方式公布實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù):?將曲線另存為圖像文件?打印曲線?打印反應(yīng)板布局?創(chuàng)建幻燈片?打印報(bào)告?導(dǎo)出數(shù)據(jù)
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