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生物技術(shù)專業(yè)生物化學(xué)課程教學(xué)教案-資料下載頁(yè)

2024-11-02 23:22本頁(yè)面

【導(dǎo)讀】本章是《生物化學(xué)》課程的第一章,主要目的是要讓學(xué)生了解生物化學(xué)的定。義、發(fā)展歷史、總體內(nèi)涵、在生命科學(xué)中所其的作用、以及目前所取得的最新進(jìn)。諾貝爾獎(jiǎng)獲得者的工作所起的歷史性作用,爭(zhēng)取體起學(xué)生學(xué)習(xí)《生物化學(xué)》的興。趣,介紹重要雜志和國(guó)內(nèi)外的教材。生物化學(xué)的基本定義。生物化學(xué)隨物理學(xué)、化學(xué)、生物學(xué)的發(fā)展而創(chuàng)生和發(fā)展。著名生物化學(xué)家的作用。生物化學(xué)技術(shù)的改進(jìn)。性、非極性、特殊氨基酸的特性、和兩羧基一氨基、兩氨基一羧集氨基酸的等電點(diǎn)。堿水解得色氨酸,其余氨基酸消旋破壞。酶水解不消旋破壞,但水解不徹底。生物體內(nèi)已發(fā)現(xiàn)氨基酸180種,常見氨基酸20種。每個(gè)氨基酸可用三個(gè)字母或單字母簡(jiǎn)寫表示。氨基酸或其它帶電顆粒處于凈電荷為零的兼性離子狀態(tài)時(shí)介質(zhì)的pH值,用pI表示,系等;4、蛋白質(zhì)測(cè)序的基本思路;5、蛋白質(zhì)

  

【正文】 61 年訂立), 1IU = 1μ mol/min。 酶活力國(guó)際單位,即 Katal(簡(jiǎn)稱 Kat)單位。在最適條件下,每秒鐘能催化 1mol 底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需的酶量,定為 1Kat 單位。 1 Kat = 1 = 60 106 IU ( 1972 年定)。 酶活力習(xí)慣沿用單位:每小時(shí)催化 1g 或 1mL 底物所需要的酶量。表示不夠嚴(yán)格,但方便。 (三) 酶的比活力: 每 mg 酶蛋白所具有的酶活力單位數(shù)。對(duì)同一種酶,比活力越大,酶的純度越高,一般用 U/mg 蛋白表示;對(duì)酶制劑為 U/g 酶制劑或 U/mL 酶制劑(表示酶含量)。 比活力大小表示單位蛋白質(zhì)的催化能力。 (四) 酶活力測(cè)定方法: 1. 分光光度法:底物和產(chǎn)物在紫外或可見光部分光吸收不同。 2. 熒光法:靈敏度高。 3. 同位素法:靈敏度極高,用 3H、 14C、 32P、 131I 等標(biāo)記化合物。 167。 2. 6 酶工程簡(jiǎn)介: P344 研究酶制劑在工業(yè)大規(guī)模生產(chǎn)及應(yīng)用,分為化學(xué)酶工程和生物酶工程。 (一) 天然酶已被廣泛應(yīng)用: 加酶洗衣粉(蛋白酶),食品飲料防腐(溶菌酶),紡織布褪漿(淀粉酶),皮革軟化脫毛(蛋白酶),澄清果汁(果膠酶)等;醫(yī)療上用 L門冬酰胺酶抗腫瘤,脲酶治尿毒癥等。 (二) 化學(xué)修飾酶: 對(duì)酶分子進(jìn)行化學(xué)修飾,改善酶的性能。如抗白血病藥物 L門冬酰胺酶游離氨基用HNO2 脫氨基或?;墒姑阜€(wěn)定性有很大提高;用葡聚糖修飾超氧化歧化酶 SOD,可使其半衰期幾十倍增長(zhǎng),抗原性消失,耐熱性提高。 (三) 固定化 酶: 將水溶性酶用物理或化學(xué)方法處理,使之成為不溶于水,但仍具有酶活性的制劑稱為固定化酶。 ( 1) 吸附法:將酶蛋白吸附在不溶性載體上,如活性炭,硅膠,分子篩,微孔玻璃,纖維素和離子交換樹脂上。 如用葡萄糖淀粉酶和葡萄糖異構(gòu)酶制備的固定化酶已大規(guī)模用于從淀粉經(jīng)葡萄糖制備果糖,用于替代蔗糖。 ( 2) 共價(jià)偶聯(lián)法:將酶蛋白上的非必需側(cè)鏈基團(tuán)與載體上的基團(tuán)通過(guò)化學(xué)反應(yīng)形成共價(jià)鍵結(jié)合。載體可用天然和合成高分子聚合物,將載體官能團(tuán)活化連接上間隔臂后,再在溫和條件下與酶偶聯(lián),間隔臂使酶分子與載體骨架有一定距離,使底物與酶易接近。 ( 3) 交聯(lián) 法:用雙功能試劑,如戊二醛等將酶分子交聯(lián)成網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),成為不溶性酶。 常與吸附法或包埋法結(jié)合使用。 ( 4) 包埋法:將酶包裹在凝膠的細(xì)微格子中或被半透性聚合膜所包圍。小分子底物和產(chǎn)物可自由通過(guò),而酶固定其中。 包埋法還可包埋固定化細(xì)胞、細(xì)胞器、菌體等。 (四) 人工模擬酶: 根據(jù)酶的結(jié)構(gòu)、功能以及催化機(jī)制,用化學(xué)合成法合成具有酶催化活性的人工酶制劑。如環(huán)糊精模擬酶,見 P347 圖 817。 有的模擬酶作用方式,有的模擬酶的活性中心。 第 9 章、酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)( P351) 本章是酶學(xué)中的重點(diǎn),學(xué)生通過(guò)學(xué)習(xí)必須掌握酶的動(dòng)力學(xué)參數(shù) 、米氏方程、酶和底物之間的關(guān)系等。講授的主要內(nèi)容是: (一) 底物濃度對(duì)酶反應(yīng)速率的影響 用反應(yīng)初速度 v 對(duì)底物濃度 [S]作圖得 P355 圖 96。 曲線分以下幾段: ( 1) OA 段:反應(yīng)底物濃度較低時(shí) v 與 [S]成正比,表現(xiàn)為一級(jí)反應(yīng), v = k[S]。 根據(jù)酶底物中間絡(luò)合物學(xué)說(shuō),酶催化反應(yīng)時(shí),首先和底物結(jié)合生成中間復(fù)合物 ES,然后再生成產(chǎn)物 P,并釋放出 E。 E + S = ES → P + E OA 段上,底物濃度小,酶未被底物飽和,有剩余酶,反應(yīng)速率取決于 ES 濃度,與[S]呈線性關(guān)系, v 正比于 [S]。 ( 2) AB 段:反應(yīng)速度不再按正比升高,表現(xiàn)為混合級(jí)反應(yīng)。此時(shí)酶漸漸為底物飽和,[ES]慢慢增加, v 也慢慢增加,為分?jǐn)?shù)級(jí)反應(yīng)。 ( 3) BC 段:反應(yīng)速度趨于 Vmax,為零級(jí)反應(yīng),酶促反應(yīng)表現(xiàn)出飽和現(xiàn)象。此時(shí)底物過(guò)量 [S][E], [E]已全部轉(zhuǎn)為 [ES]而恒定,因此反應(yīng)速率也恒定,為最大反應(yīng)速率,Vmax為 [E]所決定。 非催化反應(yīng)無(wú)此飽和現(xiàn)象。 酶與底物形成中間復(fù)合物已得到實(shí)驗(yàn)證實(shí)。 (二) 酶促反應(yīng)力學(xué)方程式 ( 1) 米氏方程推導(dǎo) 1913 年 Michaelis 和 Menten 提出并推導(dǎo)出表示 [S]與 v之間定量關(guān)系的米氏方程 Vmax[S] V = Km + [S] Km:米氏常數(shù),物理意義為反應(yīng)速率為最大速率 Vmax 一半時(shí)底物的濃度,單位與底物濃度同。 推導(dǎo):酶促反應(yīng)分兩步進(jìn)行。 k1 k3 E + S ES → P + E k2 v = k3 [ES] 一般 k3 為限速步驟 v = k3 [ES] ? ① 1. [ES] 生成速率: d[ES]/dt = k1([E] [ES]) [S] 2. [ES]分解速率: d[ES] / dt = k2 [ES] + k3 [ES] = (k2 + k3) [ES] 3. 穩(wěn)態(tài)下 [ES]不變, ES 生成速率和分解速率相等: k1 ([E] [ES]) [S] = (k2+k3) [ES] 4. 引入 Km: 令 Km = k2+k3 / k1 代入 Km = ([E] [ES]) [S] / [ES] , Km [ES] = [E] [S] [S] [ES], [ES] (Km + S) = [E] [S], [ES] = [E] [S] / Km+[S], 5. 代入 ① 式: v = k3 [ES] = k3 [E] [S] / Km + [S] ? ② 6. 引入 Vmax:為所有酶都被底物飽和時(shí)的反應(yīng)速率,即此時(shí) [E]= [ES] Vmax = k3 [ES] = k3 [E] 代入 ② 式: v = Vmax [S] / Km + [S] 米氏方程表示 Km及 Vmax已知時(shí), v~[S]的定量關(guān)系。 ( 2) 米氏常數(shù)的意義 1. Km是酶的一個(gè)特性常數(shù), Km大 小只與酶性質(zhì)有關(guān),而與酶濃度無(wú)關(guān)。當(dāng)?shù)孜锎_定,反應(yīng)溫 度, pH 及離子強(qiáng)度一定時(shí), Km 值為常數(shù),可用來(lái)鑒別酶。 P359 表91 列出一些酶的 Km值。一般 Km在 1 106~101mol/L 之間。 不同的酶 Km值不同,測(cè)定 Km要在相同測(cè)定條件( pH、溫度、離子強(qiáng)度)下進(jìn)行。 2. Km 值可用于判斷酶的專一性和天然產(chǎn)物,若一個(gè)酶有幾種底物就有幾個(gè) Km值,其中 Km值最小的底物稱為該酶的最適底物,又稱天然底物。 3. 1 / Km可近似表示酶與底物親和力的大小。 真正表示酶與底物親和力為 Ks=k2 / k1 ,(注 Km= k2+k3 / k1)。 4. 已知 Km可由 [S]計(jì)算 v,或 由 v 計(jì)算 [S]。 5. Km可幫助推斷某一代謝反應(yīng)的方向和途徑。 Km小的為主要催化方向(正、逆兩方向反應(yīng) Km不同)。 ( 3) Vmax和 k3(kcat)的意義: 酶濃度 [E]一定,則對(duì)特定底物 Vmax為一常數(shù)。催化常數(shù) kcat 又稱酶的轉(zhuǎn)化數(shù),數(shù)值上與 k3 同,為酶被底物飽和時(shí),每秒鐘每個(gè)酶分子轉(zhuǎn)換底物的分子數(shù)。 大多數(shù)酶的 kcat 為 1~104/sec,見 P322 表 82,為每秒鐘酶促反應(yīng)每微摩爾酶分子轉(zhuǎn)換底物的微摩爾數(shù)。 kcat 越大,酶催化效率越高。 ( 4) kcat / Km的意義: 生理?xiàng)l件下 S Km, Vmax = kcat [E] 代入米氏方程 v = kcat [E] [S] / Km + [S] = kcat [E] [S] / Km 得出: v = kcat / Km[E][S] kcat / Km為 [E]和 [S]反應(yīng)形成產(chǎn)物的表觀二級(jí)速度常數(shù),單位: L/mol s??梢员容^不同酶或同一種酶催化不同底物的催化效率,見 P362 表 94。 kcat / Km大小可以比較不同酶或同一種酶催化不同底物的催化效率。 (三) 米氏常數(shù)求法: ( 1) 雙倒數(shù)法: 1 / v = Km / Vmax 1 /[S] + 1 / Vmax 以 1 / v ~ 1 / [S]作圖,見 P363 圖 910 縱軸截距: 1 / Vmax;橫軸截距: 1 / Km;斜率: Km / Vmax。 ( 2) v ~ v / [S]法 ( EadicHofstee): v = Km v / [S] +Vmax 以 v ~ v / [S]作圖,見 P363 圖 911。 斜率: Km;縱軸截距: Vmax;橫軸截距: Vmax / Km。 ( 3) [S] / v ~ [S]法 ( HanesWoolf): [S] / v = Km / Vmax + 1 / Vmax [S] 以 [S] / v ~ [S]作圖,見 P363 圖 912 斜率: 1 / Vmax;縱軸截距: Km / Vmax;橫軸截距: Km。 167。 酶的抑制作用 失活作用:使酶蛋白變性而引起酶活力喪失。 抑制作用:酶的必需基團(tuán)的化學(xué)性質(zhì)改變而引起酶活力降低或喪失,但不引起酶蛋白變性。 引起抑制作用的物質(zhì)稱為抑制劑。研究酶的抑制劑,可以研究酶的結(jié)構(gòu)與功能、酶催化機(jī)制,進(jìn)行藥物、農(nóng)藥的設(shè)計(jì)與篩選。 (一) 抑制作用的類型: ( 1) 不可逆抑制作用: 抑 制劑與酶必需基團(tuán)以共價(jià)鍵結(jié)合而引起酶活力喪失,不能用透析、超過(guò)濾等物理方法除去抑制劑而使酶復(fù)活,酶被化學(xué)修飾。 ( 2) 可逆抑制作用: 抑制劑與酶以非共價(jià)鍵結(jié)合而使酶活力降低或喪失,能用物理方法除去抑制劑而使酶復(fù)活。 可逆抑制又分為三種類型,如 P369 圖 917 所示。 1. 競(jìng)爭(zhēng)性抑制:抑制劑( I)和底物( S)競(jìng)爭(zhēng)酶的結(jié)合部位,從而影響了底物與酶的正常結(jié)合。 抑制劑結(jié)構(gòu)大多與底物類似,許多底物過(guò)渡態(tài)類似物為抑制劑。抑制劑與酶活性部位結(jié)合形成 EI 復(fù)合物,抑制酶與底物的結(jié)合。競(jìng)爭(zhēng)性抑制可以通過(guò)增加底物濃度而解除,如丙二酸或 戊二酸對(duì)琥珀酸脫氫酶的抑制。 2. 非競(jìng)爭(zhēng)性抑制:底物和抑制劑同時(shí)和酶結(jié)合,兩者無(wú)競(jìng)爭(zhēng)作用。 I 與 S 結(jié)構(gòu)無(wú)共同之處,酶活性降低或被抑制,不能用增加底物濃度來(lái)解除抑制,如 Leu 是精氨酸酶非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑。 3. 反競(jìng)爭(zhēng)性抑制:酶只有與底物結(jié)合后才能與抑制劑結(jié)合。常見于多底物反應(yīng)中,如肼類化合物抑制胃蛋白酶。 (二) 可逆抑制作用和不可逆抑制作用動(dòng)力學(xué)鑒別 加入一定量抑制劑,以 v 與酶濃度 [E]作圖,見 P370 圖 98。 加不可逆抑制劑使直線原點(diǎn)右移,斜率不變,加入酶使?jié)舛却笥诓豢赡嬉种苿?,才表現(xiàn)酶活力;加可逆抑制劑,直線原點(diǎn)不動(dòng),斜 率變小。 (三) 可逆抑制作用動(dòng)力學(xué) ( 1) 競(jìng)爭(zhēng)性抑制: 1 /v ~ 1 /[S]作圖見 P371 圖 920, Vmax不變, Km變大。 縱軸截距: 1 /Vmax不變, Vmax不變,底物濃度足夠高,可克服抑制作用;橫軸截距: 1 /Km變小, Km變大;斜率: Km / Vmax變大。 ( 2) 非競(jìng)爭(zhēng)性抑制: 1 /v ~ 1 /[S]作圖見 P372 圖 921, Vmax變小, Km不變。 縱軸截距: 1 /Vmax變大, Vmax變小;橫軸截距: 1 /Km不變, Km不變;斜率:Km / Vmax變大。 ( 3) 反競(jìng)爭(zhēng)性抑制: 1 /v ~ 1 /[S]作圖見 P373 圖 922, Km, Vmax都變小。 (四) 一些重要的抑制劑: ( 1) 不可逆抑制劑: 1. 有機(jī)磷化合物:與脂酶活性部位 Ser–OH 共價(jià)結(jié)合,如抑制膽堿酯酶,使乙酰膽堿不能分解而積累,使一些以乙酰膽堿為傳導(dǎo)介質(zhì)的神經(jīng)系統(tǒng)處于過(guò)于興奮狀態(tài),引起神經(jīng)中毒。 如神經(jīng)毒劑和有機(jī)磷農(nóng)藥,結(jié)構(gòu)式見 P374。 可用能與磷酸根有更強(qiáng)結(jié)合力的化合物將酶游離出,從而解毒,如用肟類化合物解磷定,結(jié)構(gòu)式見 P374。 2. 有機(jī)砷化合物:與酶中 CysSH 作用使人畜中毒。如有機(jī)砷化合物路易斯毒氣(結(jié)構(gòu)式見 P375),可用含 SH 的化合物作解 毒劑,使酶恢復(fù)活性。 3. 氰化物、 CO、 H2S 與含鐵卟啉的酶,如細(xì)胞色素氧化酶中的 Fe2+絡(luò)合,使酶失活,阻止呼吸。 4. 青霉素:與糖肽轉(zhuǎn)肽酶活性部位 SerOH 共價(jià)結(jié)合,使酶失活,( P375 圖 924)抑制細(xì)菌細(xì)胞壁合成。青霉素與轉(zhuǎn)肽酶的底物之一的酰基 DAlaDAla 結(jié)構(gòu)類似,見 P546。 5. TLCK:根據(jù)底物的化學(xué)結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)的專一性不可逆抑制劑。以胰蛋白酶底物對(duì)甲苯磺酰 L賴氨酰甲酯( TLME)為模板,設(shè)計(jì)底物結(jié)構(gòu)類似物對(duì)甲苯磺酰 L賴氨酰氯甲酮( TLCK)(結(jié)構(gòu)見 P376 圖 925),與胰蛋白酶活性 部位 His57共價(jià)結(jié)合,引起不可逆失活。 ( 2) 可逆抑制劑: 磺胺藥:四氫葉酸( THF)是合成核酸和蛋白質(zhì)酶的必需物質(zhì)(輔酶)。根
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