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生物信息學實驗-資料下載頁

2025-04-04 23:37本頁面
  

【正文】 蛋白質結構域架構、獲取已知蛋白質的三維結構和點擊到其他數據庫的鏈接。重點:學會PSIBLAST的在線使用,和Pfam數據庫的檢索。難點:PSIBLAST程序的實現(xiàn)過程。其它教學環(huán)節(jié):實驗課剛開始,授課老師結合ppt,講授本次實驗課的主要內容,并布置本次實驗作業(yè)。在實驗過程中,授課老師提議同一個小組的學生一起討論,有問題向授課老師或助教提問。同時,學生可以在論壇中(專門為生物信息學試驗課設計的)發(fā)表自己的見解、交流學習心得。三、教材與學習資源教材:[1]BioinformaticsA Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, 3rd Edition》,Andreas (Editor), Ouellette (Editor). John Wiley amp。 Sons, Inc., Publication. 2004[2]Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis》. D. W. Mount. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001網上公共資源:[1]NCBI (Human) 網站:[2]UCSC (Human) 網站:[3]Ensembl (Human) 網站:[4]PubMed網站:[5]UniProt網站:[6]InterPro網站:[7]Gene Ontology網站:[8]Pfam網站:本地化數據庫資源:[1]Ensembl 本地化數據庫:[2]SPIDer本地化數據庫:教學課件:[1]Bioinformatics_Experiment_01_Genomic [2][3]Bioinformatics_Experiment_03_Genetic [4][5][6],[7][8]四、先修課要求及教學策略與方法建議先修課要求:計算機基本操作、生物化學或分子生物學(對基因組知識有一定的了解)。教學策略與方法建議:本課程采用多媒體教學與上機實習相結合的方式。主要強調利用各種公用的生物信息學資源進行上機實習過程的學習。五、考核方式采用作業(yè)與上機操作相結合的方式來考核學生所掌握到的知識,其中作業(yè)占50%、上機實習占50%。6 / 6
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