【正文】 SERNAKYNRLLEIELEAGEFLGDNI。登陸網(wǎng)頁版Clustal W（），將以上內(nèi)容粘貼至對話框運算，默認參數(shù)，得到如下結(jié)果。SeqA Name Len(aa) SeqB Name Len(aa) Score=================================================================================================1 416 2 419 63 1 416 3 | 438 43 1 416 4 439 47 1 416 5 416 40 2 419 3 | 438 46 2 419 4 439 48 2 419 5 416 40 3 | 438 4 439 60 3 | 438 5 416 54 4 439 5 416 55 =================================================================================================用Clustal W得到的多序列對比結(jié)果中，所有序列排列在一起，并以特定的符號代表各個位點上的殘跡的保守型，“*”號代表保守性極高的殘基位點；“：”號代表較相似的殘基位點；“.”號代表保守性略低的殘基位點。 X構建生物進化樹 將ST1212的氨基酸序列連同blastp搜索出的五個相似基因粘貼到文本文檔。用Clustal X計算做進化樹如下。BA圖8 ST1212的進化樹 從圖上可以看出，古細菌ST1212蛋白主要分為兩個群，其中ST1212分布于B群，與Sulfolobus islandicus islandicus 。進入SwissModel網(wǎng)站（），選擇左側(cè)目錄的First Approach mode，將ST1212蛋白粘貼至對話框中運算得到如圖結(jié)果。參考文獻[1] 劉波，倪金鳳， horikoshii幾丁二糖脫乙酰酶的克隆、表達及性質(zhì)研究[J].，46(2)：255–258[2] 張曉東，張傳富，[J].生物信息學，2006，（3）:143145[3] 張成崗，賀福初．生物信息學方法與實踐[M].北京：科學出版社，2006[4] 劉蓉，劉軍萬．生物信息學中途徑研究進展[J].，（1），8387[8] [J].大連大學學報，2004，25(4)：7578[6] [J].，102（06）：57[7] 曹順良，張忠平，——一個生物信息學數(shù)據(jù)集成系統(tǒng)[J].微計算機應用，2005，(1)：5962[8] 蔣彥，王小行，[M].北京：清華大學出版社，2003[9] 蔡小寧，陳茜，[J].安徽農(nóng)業(yè)科學2008 ，36(3) :914916[10] 孫志茹，韓濤，[J].圖書情報工作，2008，52(2):8891[11] 蔣明， [J].浙江大學學報(農(nóng)業(yè)與生命科學版)，2008，34(1)：16[12] 謝民主，[J]：吉首大學學報(自然科學版)，2008，29（3）：4244[13] 陳銘. 整合生物信息學[J].計算機教育 , 2006,(09)[14] [M].北京：第四軍醫(yī)大學出版社,2002[15] [M].北京：科技出版社，2004[15] Schwede T,Kopp J ,Guex N, Peitsch MC. SWISSMODEL[J].An automated protein homologymodeling Acids ,31(13):3335[14] Peitsch MC,Jongeneel model for the CD40 ligand predicts that it is a pact trimer similar to the tumor necrosis factors. Int. Immunol. 5:233238.[16] Peitsch MC (1995) ProMod: automated knowledgebased protein modelling tool. PDB Quarterly Newsletter 72:4.[17] BENSON D A ,KARSCH2MIZRACHI I ,LIPMAN D J ,et al. GenBank :Update [J ] .Nucl. Acids Res. ,2004 ,32 :23 26.[18] KULIKOVA T,ALDEBERT P ,ALTHORPE N ,et al. The EMBL Nucleotide Sequence Database [J ] . Nucl. Acids Res. ,2004 ,32 :2730.[19] MIYAZAKI S ,SUGAWARA H ,IKEO K,et in the Stream of Various Biological Data [J ] . Nucl. Acids Res. ,2004 ,32 :31 34.[20] BOECKMANN B ,BAIROCH A ,APWEILER R ,et al. The SWISS2PROT Protein Knowledgebase and Its Supplement TrEMBL in 2003[J ].Nucl. Acids Res. ,2003 ,31 (1) :365 370.致 謝經(jīng)過半年的忙碌和工作，本次畢業(yè)設計已經(jīng)接近尾聲，作為一個本科畢業(yè)生，由于經(jīng)驗的匱乏，畢業(yè)設計難免有許多考慮不周全的地方。如果沒有老師的督促指導，以及一起工作的同學們的幫助支持，想要完成這篇論文是難以想象的。本論文是在導師劉波老師的悉心指導下完成的。導師嚴謹?shù)闹螌W態(tài)度，誨人不倦的高尚師德將積極影響我今后的學習和工作。劉老師平日里工作繁多，但在我做畢業(yè)論文的每個階段，從外出實習到查閱資料，草案的確定和修改，中期檢查，后期畢業(yè)論文的修改等整個過程中都給予了我悉心的指導。老師淵博的知識、嚴謹?shù)膶W風、敏銳的洞察力和對事業(yè)孜孜不倦的追求深深地感染著我，將使我受益終生。我在此謹向劉老師表示崇高的敬意和衷心的感謝！本論文的順利完成，離不開各位老師、同學和朋友的關心和幫助。在論文工作期間，山東輕工業(yè)學院食品與生物工程學院的各位老師給予了大力的支持和幫助，在此也向他們表示衷心的感謝。然后還要感謝大學四年來所有的老師，為我們打下專業(yè)知識的基礎；同時還要感謝同學們的關心和鼓勵，正是因為有了你們的幫助和支持，此次畢業(yè)設計才會順利完成。在山東輕工業(yè)學院的這段經(jīng)歷，使我學到了很多東西，同時也使我明確了以后努力的方向，我將終生難忘。向評審論文的老師致以深深的感謝！25