蛋白質(zhì)組學修ppt課件-資料下載頁
2025-01-15 09:39本頁面
【正文】 技術(shù)分析生物體內(nèi)盡可能多乃至接近所有的蛋白質(zhì)。 1. “ 功能法 ” ：即研究不同時期細胞蛋白質(zhì)組成的變化，如蛋白質(zhì)在不同環(huán)境下的差異表達，以發(fā)現(xiàn)有差異的蛋白質(zhì)種類為主要目標。 蛋白質(zhì)組學的應用與發(fā)展趨勢 ? 隨著整合樣品處理、分級分離、質(zhì)譜鑒定以及數(shù)據(jù)分析軟件平臺為一體的蛋白組學研究系統(tǒng)的不斷推陳出新，以及適于大規(guī)模蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析的生物信息學平臺的建立，蛋白組學己經(jīng)成為生命科學研究中的重要支撐技術(shù)。 ? 蛋白質(zhì)組學與其它大規(guī)?？茖W如基因組學，生物信息學等領(lǐng)域的交叉，所呈現(xiàn)出的 系統(tǒng)生物學（ system biology） 研究模式，將成為未來生命科學最令人激動的新前沿。 蛋白質(zhì)組學的應用 ? 在應用研究方面，蛋白質(zhì)組學研究顯示出廣泛的應用前景。蛋白質(zhì)組學研究特別是定量蛋白質(zhì)組學研究，標志著蛋白質(zhì)組學研究正由定性向準確的定量方向發(fā)展。它將為人們更加完整地揭示生長、發(fā)育和代謝調(diào)控等生命活動的規(guī)律和嚴重疾病的發(fā)生機理，為人類進行疾病的診斷、防治和新藥開發(fā)提供重要的理論基礎。 在原核及簡單真核生物的蛋白質(zhì)組研究方面 ? 流感嗜血桿菌的蛋白質(zhì)組學研究 (Haemophilus influenzae) ? 大腸桿菌的蛋白質(zhì)組學研究 ? 致病微生物的蛋白質(zhì)組學研究 ? 釀酒酵母的蛋白質(zhì)組學研究 在多細胞真核生物的蛋白質(zhì)組研究方面 ? 線蟲的蛋白質(zhì)組學研究 ? 果蠅的蛋白質(zhì)組學研究 ? 人類的蛋白質(zhì)組學研究 ? 植物的蛋白質(zhì)組學研究 蛋白質(zhì)組學研究現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢 ? 蛋白質(zhì)組學已成為重要的前沿領(lǐng)域之一。各個國家和地區(qū)都已將蛋白質(zhì)組學作為優(yōu)先支持發(fā)展的領(lǐng)域，相繼啟動各具特色的大型蛋白質(zhì)組學研究計劃，大力推動本國蛋白質(zhì)組學的發(fā)展，力圖在這場新世紀最激烈的生命科學競爭中取得先機，搶占一席之地。 國外研究現(xiàn)狀： ? 美國 NCI－肺、直腸、乳腺和卵巢等腫瘤的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫 ? NCI與 FDA－有關(guān)癌癥不同發(fā)病階段和治療階段的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫 ? 歐共體－酵母蛋白質(zhì)組研究 ? 英國、法國、德國、澳大利亞、日本等國也分別投入巨資進行蛋白質(zhì)組學的研究 此外， Celera公司、日內(nèi)瓦蛋白質(zhì)組公司與布魯克質(zhì)譜儀制造公司 國內(nèi)研究現(xiàn)狀： ? 國家自然科學基金委于 1997年設立了重大項目 “ 蛋白質(zhì)組學技術(shù)體系的建立 ” ? 中國科學院生物化學研究所、軍事醫(yī)學科學院與湖南師范大學已啟動蛋白質(zhì)組研究 ? 中國科學院上海生命科學研究院、軍事醫(yī)學科學院與復旦大學相繼成立了專門的蛋白質(zhì)組學研究中心 國內(nèi)研究現(xiàn)狀： 在 “ 重大疾病的功能蛋白質(zhì)組學 ” 方面取得了良好的起步 ? 已進行肝癌細胞系及正常肝細胞蛋白質(zhì)組的比較分析研究，發(fā)現(xiàn)了兩者間不同的蛋白表達群 ? 進行了我國自行建立的肝癌高 /低轉(zhuǎn)移細胞系、肺癌高 /低轉(zhuǎn)移細胞系、原位食管癌 /轉(zhuǎn)移食管癌間的比較蛋白質(zhì)組研究，初步發(fā)現(xiàn)一批與腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)的蛋白質(zhì)群 ? 對心肌細胞與應激損傷的心肌細胞的比較蛋白質(zhì)組研究也有了一定的基礎 我國 “ 蛋白質(zhì)組研究計劃 ” 應關(guān)注的重點基礎科學問題 ? 一是 “ 人類基因組 ” 、 “ 水稻基因組 ” 等的系統(tǒng)注解、破譯，對應蛋白質(zhì)組的建立，繪制其蛋白質(zhì) “ 全組分譜 ” 等； ? 二是對人類、水稻等重要生物蛋白質(zhì)作用網(wǎng)絡及重要病原體與宿主相互作用網(wǎng)絡等的結(jié)構(gòu)及其組裝、遷移、識別、調(diào)控規(guī)律的系統(tǒng)揭示； ? 三是對具重要生理功能或重大病理意義的微生物、細胞、組織器官、系統(tǒng)中，蛋白質(zhì)組及蛋白質(zhì)作用網(wǎng)絡的生物學功能的認識； ? 四是生物信息學等系統(tǒng)生物學理論與技術(shù)體系的建立； ? 五是人類重大疾病、作物重要農(nóng)藝性狀與重要微生物等的分子標志及藥物、疫苗、診斷與作物、工業(yè)微生物改良等系列靶標的規(guī)模篩查與確認； ? 六是突破制約蛋白質(zhì)科學發(fā)展的技術(shù)瓶頸，培育一批生產(chǎn)尖端蛋白質(zhì)組研究設備與產(chǎn)品并能占領(lǐng)國際市場的高技術(shù)企業(yè)。 蛋白質(zhì)組學相關(guān)組織 ? 國際人類蛋白質(zhì)組組織（ Human Proteome Organization, HUPO）， 2022成立。 ? 亞太地區(qū)人類蛋白質(zhì)組組織（ AOHUPO） ? 北美地區(qū)人類蛋白質(zhì)組組織（ AHUPO） ? 中國人類蛋白質(zhì)組組織（ CNHUPO） 存在的問題 ? 以肝臟疾病為例，由于肝臟疾病問題的復雜性和目前研究手段的不夠完善，科學家發(fā)現(xiàn)，不同實驗室用蛋白質(zhì)組學技術(shù)尋找到的肝臟疾病的分子標記物和藥物靶標還有較大的差異。 ? 用蛋白質(zhì)組學技術(shù)發(fā)現(xiàn)的分子標記物和藥物靶標，和用基因組學技術(shù)和轉(zhuǎn)錄組學技術(shù)發(fā)現(xiàn)的也有較大的離散性。直到現(xiàn)在，國內(nèi)外科學家對這種離散性尚沒有一個很好的解釋。 ? 現(xiàn)有的技術(shù)只能分析和鑒定約 l/3的高豐度和中豐度蛋白質(zhì)。高豐度背景下的低豐度蛋白質(zhì)的高效分離與富集和特效鑒定與分析問題、規(guī)模化蛋白質(zhì)后修飾譜的選擇性鑒定和結(jié)構(gòu)分析問題、通量化蛋白質(zhì)相互作用和連鎖圖以及功能驗證等研究問題仍然是一個艱巨的任務。 ? 另外，重大疾病發(fā)生發(fā)展的蛋白質(zhì)組學研究方面尚未形成系統(tǒng)。在疾病發(fā)生發(fā)展的病生理機制方面，尚缺乏對疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的功能群分析和對疾病發(fā)展不同階段蛋白質(zhì)表達變化規(guī)律的關(guān)注，因此為其病理生理機制的闡明所提供的信息還不夠充分。 ? 針對有基因組或轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫的生物體或組織 /細胞，建立其蛋白質(zhì)組或亞蛋白質(zhì)組（或蛋白質(zhì)表達譜）及其蛋白質(zhì)組連鎖群，即positional proteomics 研究 ? 以重要生命過程或人類重大疾病為對象，進行重要生理 /病理體系或過程的比較蛋白質(zhì)組學研究，即 parative proteomics 研究 ? 蛋白質(zhì)組學支撐技術(shù)平臺和生物信息學的研究 蛋白質(zhì)組學的前沿研究方向： 2022/2/12 基因組學 (genomics) 轉(zhuǎn)錄組學 (transcriptomics) 蛋白質(zhì)組學 (proteomics) 代謝組學 (metabolomics) 系統(tǒng)生物學 展望 謝 謝！
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