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生物化學(xué)酶章節(jié)考點(diǎn)總結(jié)-資料下載頁

2025-08-21 15:42本頁面

【導(dǎo)讀】酶是一類具有高效率、高度專一性、活性可調(diào)節(jié)的高分子生物催化劑。1957巴斯德提出酒精發(fā)酵是酵母細(xì)胞活動(dòng)的結(jié)果。1分子Glc→2分子乙醇+2分子CO2從Glc開始,經(jīng)過12種酶催化,12步反應(yīng),生成乙醇。1897Buchner兄弟證明發(fā)酵與細(xì)胞的活動(dòng)無關(guān),不含細(xì)胞的酵母汁也能進(jìn)行乙醇發(fā)酵。1913Michaelis和Menten提出米氏學(xué)說—酶促動(dòng)力學(xué)原理。1926Sumner首次從刀豆中提出脲酶結(jié)晶,并證明具有蛋白質(zhì)性質(zhì)。1969化學(xué)合成核糖核酸酶。1967-1970從中發(fā)現(xiàn)第I、第II類限制性核酸內(nèi)切酶。1986Cech發(fā)現(xiàn)四膜蟲細(xì)胞大核期間26SrRNA前體具有自我剪接功能。沒有酶,生長、發(fā)育、運(yùn)動(dòng)等等生命活動(dòng)就無法繼續(xù)。酶對反應(yīng)的底物和產(chǎn)物都有極高的專一性,幾乎沒有副反應(yīng)發(fā)生。溫度低于100℃,正常大氣壓,中性pH環(huán)境。③降低反應(yīng)活化能。酶的專一性由酶蛋白的結(jié)構(gòu)決定,輔助因子傳遞電子或某些化學(xué)基團(tuán)。此某些調(diào)節(jié)因子可以比較特異地影響某細(xì)胞組分中的酶活性,而不使其它組分中的酶受影響。

  

【正文】 與底物的化學(xué)轉(zhuǎn)變,此類 殘基的一個(gè)或幾個(gè)原子與底物分子中一個(gè)或幾個(gè)原子的距離都在一個(gè)鍵距離之內(nèi)( )。 它們的側(cè)鏈起與底物結(jié)合作用的稱為結(jié)合基團(tuán),起催化作用的稱為催化基團(tuán)。 ( 2)輔助殘基 它不與底物接觸,而是在使酶與底物結(jié)合及協(xié)助接觸殘基發(fā)揮作用方面起作用。 上述兩類殘基構(gòu)成酶活性中心。 ( 3)結(jié)構(gòu)殘基 在維持酶分子正常三維構(gòu)象方面起重要作用,它 們與酶活性相關(guān),但不在酶活性中心范圍內(nèi),屬于酶活性中心以外的必需殘基 上述三類殘基統(tǒng)稱酶的必需基團(tuán),若被其它 取代,往往造成酶失活。 ( 4)非貢獻(xiàn)殘基(非必需基團(tuán)) 它們對酶活性的顯示不起作用,可由其它 代替,且在酶分子中占很大比例。 它們可能在免疫,酶活性調(diào)節(jié),運(yùn)輸轉(zhuǎn)移,防止降解等方面起作用。 結(jié)合底物作用(結(jié)合殘基) 31 接觸殘基 活性中心 催化作用(催化基團(tuán)) 必需基團(tuán) 輔助殘基 活性中心外(結(jié)構(gòu)殘基) 酶蛋白 非必需基團(tuán) 活性中心區(qū)域的一級結(jié)構(gòu) 由于一些酶的活性中心一級結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)與催化機(jī)理極其相似,可把它們歸為一族。 蛋白水解酶就有幾個(gè)族: ( 1)絲氨酸蛋白酶(胰凝乳蛋白酶、胰乳蛋白酶、彈性蛋白酶、枯草桿菌蛋白酶等) ( 2)鋅蛋白酶(羧肽酶等) ( 3)巰基蛋白酶(木瓜蛋 白酶等) ( 4)羧基蛋白酶(胃蛋白酶等) 在同一族酶中,活性中心一級結(jié)構(gòu)的 順序極相似。 酶 順序 胰蛋白酶(牛) AspSerCysGlnGlyAspSerGlyGlyProValValCysSerGlyLys 胰凝乳蛋白酶(牛) SerSerCysMetGlyAspSerGlyGlyProLeuValCysLys LysAsn 彈性蛋白酶(豬) SerGlyCysGlnGlyAspSerGlyGlyProLeuHisCysLeuValAsn 凝血酶(牛) ? AspAlaCysGluGlyAspSerGlyGlyProPheValMetLysSerPro 這 4 個(gè)源于哺乳動(dòng)物的酶活性中心,都含有一個(gè)包括 Ser 在內(nèi)的完全相同的六肽: ? GlyAspSerGlyGlyPro? ? 同源的趨異進(jìn)化 來自胰臟的胰凝乳蛋白酶( Phe、 Tyr、 Trp、 )、胰蛋白酶( Lys、 Arg )和彈性蛋白酶(疏水殘基),活性中心 Ser 附近的 順序相同,且分子一級結(jié)構(gòu)中有 40% 順序相同,三維結(jié)構(gòu)也相同,表明它們起源于共同的祖先,但是它們的底物專一性不同。 這種來源于共同祖先,經(jīng)基因突變而得出不同專一性的結(jié)果稱為同源的趨異進(jìn)化。 ? 異源的趨同進(jìn)化 來自枯草桿菌的 Ser 蛋白酶的結(jié)構(gòu)與上述三種酶很不同,且活性中心 Ser 附近的 ( GlyThrSerMetAlaSer)。 電荷中繼網(wǎng)的位置也不同: Asp102His57Ser195(胰凝乳 蛋白酶和彈性蛋白酶) Asp32His64Ser221(枯草桿菌蛋白酶) 這表明枯草桿菌蛋白酶與胰凝乳蛋白酶等三個(gè)酶來源不同,但它們的電荷中繼網(wǎng)相同,功能相同,這種情況稱異源的趨同進(jìn)化。 判斷和研究活性中心的主要方法 ( 1)通過酶的專一性( 2)酶的化學(xué)修飾法( 3)親合標(biāo)記法( 4) X 射線晶體衍射法 32 (二) 酶作用機(jī)理舉例 胰凝乳蛋白酶的作用機(jī)理: ( 1)、 專一性 圖 該酶需要底物有一個(gè)疏水基團(tuán)結(jié)合于酶上的疏水部位,這個(gè)結(jié)合起定位作用,使底物敏感鍵對準(zhǔn)酶的催化基團(tuán)。 疏水定位基團(tuán): Phe、 Tyr、 Trp ( 2)、 催化機(jī)理 ① 活性中心: Ser195— His57— Asp102,三者構(gòu)成一個(gè)氫鍵體系, His57 的咪唑基是 Ser195 的羥基和 Asp102 的羧基之間的橋梁,這個(gè)氫鍵體系稱為電荷中繼網(wǎng)( harge relay work)。通過電荷中繼網(wǎng),進(jìn)行酸堿催化及共價(jià)催化。 Ser195 由于 His57 和 Asp102 的影響而成為很強(qiáng)的親核基團(tuán),它是活性中心的底物結(jié)合部位, His57是活性中心的催化部位。 P P285 圖 427, P287 圖 430 胰凝乳蛋白酶中的電荷中繼網(wǎng) ② 胰凝乳蛋白酶對多肽的水解過 程 P288 圖 4— 31 胰凝乳蛋白酶對多肽的水解過程 第一階段 ?;? Ser195OH 中的氧攻擊肽鍵的羰基碳,形成四聯(lián)體過渡態(tài)( Ser195—OH、底物的酰基、底物的氨基、 His 的咪唑),敏感肽鍵斷裂,底物中的胺成分通過氫鍵與酶的 His57 咪唑基相連,底物的羧基部分酯化到 Ser195 的羥基上。 第二階段 脫酰 電荷中繼網(wǎng)從水中吸收一個(gè)質(zhì)子,結(jié)果產(chǎn)生的 OH攻擊連在 Ser195上底物的羧基碳原子,形成四聯(lián)體過渡態(tài),然后 His57 供出一個(gè)質(zhì)子給 Ser195 上的氧原子,結(jié)果底物中 的酸成分從 Ser195 上釋放。 除胰凝乳蛋白酶外,在催化中具有 AspHisSer 電荷中繼網(wǎng)的還有胰蛋白酶,彈性蛋白酶,枯草桿菌蛋白酶等,但它們的底物結(jié)合部位不同,底物專一性也不同。 P288 圖 432 三種胰臟中的蛋白酶的底物結(jié)合部位 33 胰凝乳蛋白酶 胰蛋白酶 彈性蛋白酶 可供芳香環(huán)及大 可供帶電荷的 只能讓 Ala 等小分子 的非極性側(cè)鏈伸入 Lys.、 Arg進(jìn)入 進(jìn)入 第五節(jié) 多酶體系與酶活性的調(diào)節(jié)控制 一、 多酶體系 (一) 多酶體 系及其分類 細(xì)胞中的許多酶,常常在一個(gè)連續(xù)的反應(yīng)鏈中起作用,前一個(gè)反應(yīng)的產(chǎn)物是后一個(gè)反應(yīng)的底物。 多酶體系: multienzyme system在完整細(xì)胞內(nèi)的某一代謝途徑中,由幾個(gè)酶形成的反應(yīng)鏈體系。 可分為三種類型:可溶性的(分散性的),結(jié)構(gòu)化的(多酶復(fù)合體),在細(xì)胞結(jié)構(gòu)上有定位關(guān)系的(結(jié)構(gòu)化程度更高)。 P297 圖 4— 42(分散性的多酶體系) 圖 443 (多酶復(fù)合體) (二) 多酶體系的自我調(diào)節(jié) ( 1)大部分具有自我調(diào)節(jié)能力的多酶體系,第一步反應(yīng)就是限速步驟,它控制著全部反應(yīng)序列的總速度。 ( 2)反饋抑制與底物激活 催化第一步反應(yīng)的酶,大多都是別構(gòu)酶,能被全部反應(yīng)序列的最終產(chǎn)物所抑制,有時(shí)則是反應(yīng)序列分叉處的酶受到最終產(chǎn)物的抑制,稱為反饋抑制;有的被底物激活 P299 圖 445 反饋抑制與底物激活 正調(diào)節(jié)物:一般是別構(gòu)酶的底物,可以激活別構(gòu)酶。 負(fù)調(diào)節(jié)物:可以抑制別構(gòu)酶,一般是代謝序列的最終產(chǎn)物。 通過多酶體系的自我調(diào)節(jié)(反饋抑制和底物激活),可使代謝過程得以協(xié)調(diào)地、有條不紊地合理進(jìn)行。 下面討論具體到每個(gè)酶是怎樣調(diào)節(jié)的 二、 酶活性的調(diào)節(jié)控制和調(diào)節(jié)酶 調(diào)節(jié)酶:活性可被調(diào)節(jié)的酶,主要是別構(gòu)酶和共 價(jià)調(diào)節(jié)酶。 (一) 別構(gòu)效應(yīng)的調(diào)控 別構(gòu)效應(yīng):調(diào)節(jié)物(效應(yīng)物)與別構(gòu)酶分子中的別構(gòu)中心(調(diào)節(jié)中心)結(jié)合后,誘導(dǎo)產(chǎn)生或穩(wěn) 34 定住酶分子的某種構(gòu)象,使酶活性中心對底物的結(jié)合催化作用受到影響,從而調(diào)節(jié)酶促反應(yīng)的速度。 ( 1)、 別構(gòu)酶的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)和性質(zhì) ( 1) 已知的別構(gòu)酶都是寡聚酶,含有兩個(gè)或兩個(gè)以上亞基 ( 2) 具有活性中心和別構(gòu)中心(調(diào)節(jié)中心),活性中心負(fù)責(zé)底物結(jié)合和催化,別構(gòu)中心負(fù)責(zé)調(diào)節(jié)酶反應(yīng)速度?;钚灾行暮蛣e構(gòu)中心處在不同的亞基上或同一亞基的不同部位上。 ( 3) 多數(shù)別構(gòu)酶不止一個(gè)活性中心,活性中心間有同種效應(yīng),底物就是調(diào)節(jié)物:有的別構(gòu)酶不止一個(gè)別構(gòu) 中心,可以接受不同的代謝物的調(diào)節(jié)。 ( 4) 別構(gòu)酶由于同位效應(yīng)和別構(gòu)效應(yīng),不遵循米式方程,動(dòng)力學(xué)曲線也不是典型的雙曲線型,而是 S 型(同位效應(yīng)為正協(xié)同效應(yīng))和壓低的近雙曲線(同位效應(yīng)為負(fù)協(xié)同效應(yīng))。 ( 2)、 別構(gòu)酶的動(dòng)力學(xué)曲線 ① 同位效應(yīng)為正協(xié)同效應(yīng)的別構(gòu)酶是 S 型曲線 P303 圖 446 447 這種 S 形曲線體現(xiàn)為,當(dāng)?shù)孜餄舛劝l(fā)生較小變化時(shí),別構(gòu)酶可以極大程度地控制反應(yīng)速度,這是別構(gòu)酶可以靈活地調(diào)節(jié)反應(yīng)速度的原因。 米氏酶: [S][S]=81 別構(gòu)酶: [S][S]=3 表明當(dāng)?shù)孜餄舛?發(fā)生較小變化時(shí),如上升 3 倍,別構(gòu)酶的酶促反應(yīng)速度可以從 升至 。 當(dāng)增加正調(diào)節(jié)物濃度時(shí) Km減小,親和力增大,協(xié)同性減?。寒?dāng)增加負(fù)調(diào)節(jié)物的濃度時(shí) Km增加,親和力減小,協(xié)同性增大(對底物濃度的反應(yīng)靈敏度增加)。 ② 同位效應(yīng)為負(fù)協(xié)同效應(yīng)的別構(gòu)酶是近似雙曲線 P304 圖 448 負(fù)協(xié)同效應(yīng)時(shí)酶的反應(yīng)速度對底物濃度的變化不敏感 ( 3)、 別構(gòu)酶調(diào)節(jié)活性的機(jī)理 ① 序變模型: 酶分子中亞基結(jié)合底物后,構(gòu)象逐個(gè)地依次變化。 ② 齊變模型: ( 4)、 別構(gòu)酶的鑒定 ① S 型曲線是必要但不充分條件 ② 脫敏作用 ③ [S]/ [S] Rs=81 米氏酶 35 Rs< 81 正協(xié)同 Rs> 81 負(fù)協(xié)同 ④ Hill 系數(shù)法 (二) 可逆共價(jià)修飾的調(diào)控(共價(jià)調(diào)節(jié)酶) 共價(jià)調(diào)節(jié)酶:酶分子被其它的酶催化進(jìn)行共價(jià)修飾,從而在活性形式與非活性形式之間相互轉(zhuǎn)變。 舉例:糖原磷酸化酶 P313 圖 457 信號的級聯(lián)放大: 1 分子磷酸化酶激酶,活化生成幾千個(gè)磷酶化酶 a 1 分子磷酸化酶 a,催化生成幾千個(gè) 1PG 共價(jià)調(diào)節(jié)酶的兩種常見類型 ①磷酸化 去磷酸化 OH ATP ②腺苷酰化 脫腺苷?;? 腺苷?;?ATP 提供 (三) 酶原的激活 具有不可逆性。屬于此類的有消化系統(tǒng)中的酶(胰蛋白酶,胰凝乳蛋白酶,胃蛋白酶)和血液凝固系統(tǒng)中的酶。 ( 1)、 胰凝乳蛋白酶原的激活(由胰蛋白酶激活) P314 圖 458 ( 2)、 胰蛋白酶對胰臟蛋白酶原的激活 腸激酶 胰蛋白酶原 胰蛋白酶 胰凝乳蛋白酶原 彈性蛋白酶原 胰蛋白酶 胰凝乳蛋白酶 彈性蛋白酶 羧肽酶原 羧肽酶 36 (四) 專一性調(diào)控蛋白(調(diào)控因子)對酶活性的調(diào)節(jié)控制 鈣調(diào)蛋白、激素結(jié)合蛋白,促進(jìn)或抑制特異的酶活性 第六節(jié) 酶與抗體 —— 抗體酶 abzyme(antibody enzyme) 參閱 P293 又稱催化性抗體( catalytic antibody),是一種具有催化功能的抗體分子。 過渡態(tài)理論:酶與底物不是在基態(tài),而是在過渡態(tài)結(jié)構(gòu)互補(bǔ),親和力最強(qiáng),釋放出的結(jié)合能使過渡態(tài)結(jié)合物能級降低,利于反應(yīng)物分子越過能壘,加速反應(yīng)。 而抗體與抗原是基 態(tài)結(jié)合。 第七節(jié) 同工酶、誘導(dǎo)酶 同工酶 能催化同一種化學(xué)反應(yīng),但其酶蛋白本身的分子結(jié)構(gòu)不同的一組酶,存在于生物的同一種屬或同一個(gè)體的不同組織中,甚至同一組織、同一細(xì)胞中。 哺乳動(dòng)物乳酸脫氫酶有 5 種 CH3CHOHCOO+NAD+ LDH CH3COCOO+NADH+H+ 均由 4 個(gè)亞基組成 HHHH 在心肌中占優(yōu)勢 HHHM HHMM HMMM MMMM 在骨骼肌中占優(yōu)勢 誘導(dǎo)酶 酶可相對地區(qū)分為結(jié)構(gòu)酶和誘導(dǎo)酶。 結(jié)構(gòu)酶:指正常細(xì)胞內(nèi)存在的酶,它的含量較穩(wěn)定,受外界因素影響很小。 誘 導(dǎo)酶:在正常細(xì)胞中含量極少或沒有,當(dāng)細(xì)胞中加入特定誘導(dǎo)物后,誘導(dǎo)產(chǎn)生的酶,含量在誘導(dǎo)物存在下顯著增高,誘導(dǎo)物往往是該酶的底物或底物類似物。 如:大腸桿菌中的β 半乳糖苷酶 在含 Glc 的培養(yǎng)基中 在只含乳糖的培養(yǎng)基中: Glcβ (1→ 4)Gal 苷 37 第八節(jié) 酶工程 計(jì)劃: 8 學(xué)時(shí) 第五章 維生素與輔酶 3 學(xué)時(shí) 定義: 維持生物正常生命過程必需的一類小分子有機(jī)化合物,它在生物體內(nèi)含量極少,大多數(shù)由食物供給,人體自身不能合成它們。 脂溶性: A、 D、 E、 K,單獨(dú)具有生理功能。 水溶性: B B B B1 C 等,輔
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