【文章內(nèi)容簡介】
n i p p o n i c u s 5 5 E u f o r s i u s p i e l i 2 8 S 8 7 A n e u g m e n u s f r o n t a l i s 2 8 S 1 7 3 A n e u g m e n u s p t e r i d i i R u n a r i a r e d u c t a d o w n l o a d ) 14 圖 1:28S rDNA 基因部分序列經(jīng) MEGA 分析產(chǎn)生 NJ 樹擴樸結(jié)構(gòu)圖。 NJ 分析選用的模型是 Kimura 2parameter,在 NJ 分析樹中只有屬內(nèi)種形成了一個分支,構(gòu)成了單 系群, 結(jié)果表明: 28S DNA 平均堿基組成無明顯 T\A 的偏好,而 cytb 基因堿基組成有明顯 T\A的偏好。采用 NJ、 ME 和 MP 法建分子系統(tǒng)樹分析它們在分子水平的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,結(jié)果表明:各亞科內(nèi)均獨立形成一支,成為單系群。 5 8 Ta x o n u s a t t e n a t u s 2 8 S 6 3 L i n o m o r p h a f l a v a 2 8 S 1 5 3 A l l a n t u s n i g r o c a e r u l e u s 9 1 M e g a b e l e s e s l i r i o d e n d r o v o r a x 1 7 8 A b e l e s e s r u f o t i b i a l i s 2 1 9 B e l e s e s n i g r o a p i c a l i s 1 7 5 N e o s t r o m b o c e r o s n i p p o n i c u s 5 5 E u f o r s i u s p i e l i 2 8 S 8 7 A n e u g m e n u s f r o n t a l i s 2 8 S 1 7 3 A n e u g m e n u s p t e r i d i i R u n a r i a r e d u c t a d o w n l o a d ) 圖 2: 28S rDNA 基因部分序列經(jīng) PAUP 分析產(chǎn)生 MP 樹拓撲結(jié)構(gòu)圖。 5 8 Ta x o n u s a t t e n a t u s 2 8 S 1 5 3 A l l a n t u s n i g r o c a e r u l e u s 6 3 L i n o m o r p h a f l a v a 2 8 S 9 1 M e g a b e l e s e s l i r i o d e n d r o v o r a x 1 7 8 A b e l e s e s r u f o t i b i a l i s 2 1 9 B e l e s e s n i g r o a p i c a l i s 1 7 5 N e o s t r o m b o c e r o s n i p p o n i c u s 5 5 E u f o r s i u s p i e l i 2 8 S 8 7 A n e u g m e n u s f r o n t a l i s 2 8 S 1 7 3 A n e u g m e n u s p t e r i d i i R u n a r i a r e d u c t a d o w n l o a d ) 圖 3: 28S rDNA 基因部分序列經(jīng) PAUP 分析產(chǎn)生 ME 樹拓撲結(jié)構(gòu)圖。 15 結(jié) 論 葉蜂總科是廣腰亞目中最大的總科,長期以來,葉蜂總科昆蟲的系統(tǒng)學(xué)都是建立在形態(tài)學(xué)的基礎(chǔ)上,葉蜂總科昆蟲在亞科水平爭議 一直就比較大。分子數(shù)據(jù)有極強的遺傳學(xué)基礎(chǔ),是客觀、真實、可量化的,利用分子數(shù)據(jù)可以彌補形態(tài)學(xué)上的不足。目前 DNA 序列數(shù)據(jù)已廣泛應(yīng)用于昆蟲系統(tǒng)學(xué)研究中,并取得了一定的結(jié)果。 本文研究的類群為葉蜂總科昆蟲一小部分種類,用 NJ 法對 28S DNA 基因的部分片段以進行系統(tǒng)發(fā)育重建,結(jié)果發(fā)現(xiàn)不同方法對同一序列構(gòu)建的分子系統(tǒng)樹的拓撲結(jié)構(gòu)不太相同。 基因序列建樹比較表明:測得的 28S DNA 基因部分序列構(gòu)建的分子系統(tǒng)樹不能推斷葉蜂總科昆蟲之間的明確關(guān)系,原因是這段序列 過于保守,沒有足夠的簡約信息位點, 不適合作為葉蜂科昆蟲科 級及科級以下階元系統(tǒng)發(fā)育的分子標(biāo)記。葉蜂總科中 6 個科的演化關(guān)系復(fù)雜。 在進一步的研究中,應(yīng)增加樣本的種類和數(shù)量,使分類單元更具代表性, 本文研究的葉蜂總科昆蟲只有 5 屬,以后可以增加更多的研究類群。本實驗所用的是核糖體的基因,測得的序列長度不夠長,在未來的工作中我們可以延長核酸序列的長度,使其包含更大的遺傳信息;可以加入一些編碼蛋白質(zhì)的基因,如 COⅠ和 EF1a 基因這些分子標(biāo)記,把更多的基因聯(lián)合起來分析;另外,本文僅用了NJ 一種方法構(gòu)建分子系統(tǒng)樹,還可結(jié)合 Baysain 和 ML 多種統(tǒng)計學(xué)方法來綜合討論這 些類群之間的關(guān)系。 16 致謝 這篇論文是在 老師的悉心指導(dǎo)和嚴格要求下完成的。從論文的選題、實驗操作、研究方法、結(jié)果分析、直至論文的審定都飽含著她眾多的辛勞。老師嚴謹?shù)闹螌W(xué)態(tài)度、忘我的工作精神、敏銳的學(xué)術(shù)洞察力、謙遜平和的性格、誨人不倦的育人風(fēng)格是我做人和學(xué)習(xí)的楷模,也是我今后努力和學(xué)習(xí)的方向。在此,特向老師致以崇高的敬意和衷心的感謝 ! 本文自開題至成文,除受老師指導(dǎo)外,特別要感謝 在我們的實驗操作、論文撰寫及生活各個方面的幫助。同時跟我一起實驗的同學(xué)對我的幫助也是我實驗及論文能完成不可缺少的,對他們也表 示內(nèi)心的感謝。 最后,深深感謝在工作和求學(xué)之路上,所有關(guān)心和幫助過我的人。 17 參考文獻 [1] Schulmeister, analysis of basal Hymenoptera (Insecta) : introducing robustchoise sensitivity analysis [J]. Biol J Linn Soc, 2020, 79: 245275. [2] Schulmeister , S.. Review of morphological evidence on the phylogeny of basal Hymenopera ( Insecta ), with a discussion of the ordering of characters [J]. Biol J linn Soc, 2020, 79: 209243. [3] Vilhelmsen, L. Phylogeny and classification of the extant basal lineages of the Hymenoptera (Insecta) [J]. Zoological Journal of the Linnean Society, 2001, 131: 393442 [4] 程家安 , 唐振華 . 昆蟲分子學(xué) [M]. 北京 :科學(xué)出版社 . 2001. 2 [5] Avise J C, Amold J, Ball RM et al. 1987. Intraspecific phylogeography : The mitochondrial DNA bridge between population geics and systematics. Ann. Rev. Ecol. Syst., 18: 489~522 [6] Gray M W . 1989. Origin and evolution of mitochondrial DNA. Ann. Rev. Cell Bio., 5: 25~50 [7] Lansman R A, Shade R O, Shapiro J F et al. 1981. The use of restriction endonucleases to measuure nitochondrial sequence relateness in natural populations. III. Techniques and potential applications. J. Mol. Evol., 17: 214~226 [8] Simon C, Franke A, Martin A. 1991. The polymerase chain reaction: DNA extraction and amplification. In: Hewitt GM, Johnston W, Young J P W eds. Molecular Techniques in Taxonomy . Berlin: SpringerVerlag. 329~355 [9] Satta Y, Takahata N. 1990. Evolution of Drosophila mitochondrial DNA and the history of the melanogaster subgroup Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87: 9558~9562 [10] Pashley D P, Ke L D. 1992. Sequence evolution in mitochondrial ribosomal and ND1 genes in Lepidoptera: Implication for phylogeic analyses. Mol. Biol. Evol., 9: 1061~1075 [11] 印紅 , 張道川 , 畢智麗 . 蝗總科部分種類 16SrDNA 的分子系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系 [J]. 遺傳學(xué)報, 2020. 30(8):766772. [12] 胡婧 , 劉艷 , 黃原 . 網(wǎng)翅蝗科部分種類全基因組提取及基因和基因測序 [J]. 陜西師范大學(xué)學(xué)報 , 2020. 3034. [13] 劉殿鋒 , 蔣國芳.應(yīng)用 16S rDNA 序列探討斑腿蝗科的單系性及其亞科的分類地位 [J].昆蟲學(xué)報 , 2020. 48(5):759769. [14] 劉曉麗 , 任國棟 . 9種擬步甲 16S rDNA 部分序列及其親緣關(guān) 系 [J]. 河北大 18 學(xué)報 , 2020. 24(4): 399405. [15] 劉曉麗 . 部分擬步甲 16SrDNA和和 18SrDNA基因序列與分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 河北大學(xué) . 2020. [16] Fredrik Ronquist. Bayesian inference of character evolution [J]. Trends in Ecology and Evolution, 2020. 19(9):475481. [17] Swofford D L. PAUP: Phylogeic AnalysisUsing Parasimony, . Champaign: Illinois Natural History Survey. 1993. [18] 朱弘復(fù) , 王林瑤 . 中國殘青葉蜂亞科 (Athaliinae)研究 (膜翅目:葉蜂科 )[J]. 動物學(xué)報, 1962. 14(4). [19] 周淑芷 , 黃孝運 . 葉蜂科兩新種記述 (膜翅目:廣腰亞目 )[J]. 林業(yè)科學(xué) , 1980. 第 2 期 : 124126. [20] 蕭剛?cè)?. 云南腮扁葉蜂亞科兩新種 (膜翅 目:扁葉蜂科 ) [J]. 昆蟲分類學(xué)報 , 1984. 6(2):137139. [21] 蕭剛?cè)?, 周淑芷 , 黃孝運 . 云南松葉蜂科七新種 (膜翅目:廣腰亞目 ) [J]. 昆蟲分類學(xué)報 , 1984. 6(23):141148. [22] 蕭剛?cè)?.中國葉蜂科一新屬 (膜翅目:廣腰亞目 )[J]. 林業(yè)科學(xué) , 1987. 23(3):299301. [23] 蕭剛?cè)?.一種危害鵝掌楸的新葉蜂 [J]. 林業(yè)科學(xué)研究 , 1993. 6(2): 148150. [24] 周淑芷 , 張真 . 葉蜂科一新種和一新 記錄 (膜翅目:廣腰亞目 )[J]. 林業(yè)科學(xué)研究 , 1993. 第 6 卷增刊 . [25] 黃孝運 , 周淑芷 . 錘角葉蜂亞科兩新種 (膜翅目:錘角葉蜂科 )[J]. 林業(yè)科學(xué)研究, 1997. 10(2): 170172. [26] 王鳳葵 . 中國錘角葉蜂科一新記錄種 [J]. 昆蟲分類學(xué)報 , 1994. 16(3):233234. [27] 蕭剛?cè)?. 兩種危害松類的新葉蜂 (膜翅目,廣腰亞目,松葉蜂科 )[J]. 林業(yè)科學(xué)研究 , 1992. 5(2):193195. [28] 蕭剛?cè)?.中國森林昆蟲 [M]. 中 國林業(yè)出版社 , 1991. 11601191. [29] [30] [31] Thompson,., Gibson,., Plewniak,F., Jeanmougin,F. and Higgins,. The ClustalX windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools[J]. Nucleic Acids Research. 1997, 24: