實驗四蛋白質序列、結構的獲取和顯示(編輯修改稿)
2024-09-01 05:29 本頁面
【文章內容簡介】 tidebinding。 Transferase. ? SQ SEQUENCE 301 AA。 34675 MW。 E839F1A5EA0D5CB5 CRC64。 ? MDLAQSEERY QKLEKIGEGT YGLVYKARDN QTGDIVALKK IRMDHEDEGV PSTAIREISL ? LKEVQHPNIV PLKDVVYDES RLYLIFDFVD LDLKKYMESV PQLDRMQVKK FINQMIQALN ? YCHQNRVIHR DLKPQNILVD IKNTQIAD FGLARAFGLP LKTYTHEVIT LWYRAPEILL ? GQRQYSTPVD IWSLGCIFAE MAQKRPLFCG DSEIDQLFKI FKIMGTPKES TWPGVSTLPD ? FKSTFPRWPT PTNPAATLGK DITNLCPLGL DLLSKMITYD PYARITAEEA LKHAYFDELN ? N ? // ? 18 與序列相關的關鍵詞 氨基酸統(tǒng)計數 DNA代碼 氨基酸代碼 19 20 FASTA文件格式 tr|Q9XYV1|Q9XYV1_PARTE Cyclindependent protein kinase Cdk2 OS=Paramecium tetraurelia GN=CDK2 PE=4 SV=1 ID 號 名稱，基本性質簡要說明 21 1. 在 Uniprot中查詢擬南芥的光敏色素 phyE編碼蛋白的詳細信息 ， 閱讀序列格式的解釋 ， 列 出共包含哪幾個部分 ？ 標出 頭部區(qū)主要字段 的 含義 。 2. 在 Uniprot中查詢 （ 1） 擬南芥 油菜素內酯受體gibberellin receptor GID1C 、 （ 2） 水稻 獨角金內酯水解酶 strigolactone hydrolase D14的蛋白質序列 ， 這兩個蛋白包含多少個氨基酸 ？ 寫出它們所對應的mRNA檢索號 （ 類似于這樣的格式 N*_*****） 、GeneID號 。 作 業(yè) 二 蛋白質 結構數據庫 ? PDB Protein DataBank， 美國 Brookhaven國家實驗室管理生物大分子三維空間結構 原 子 坐 標 數 據 庫 ? NCBI STRUCTURE： MMDB (Molecular Modelling DataBase)， 包含了從 PDB獲取的實驗確定的生物高聚物結構分子模型數據庫 。 PDB數據庫 ( protein data bank ) 1. 簡介 美國 Brookhaven實驗室 1971年建立的 大分子結構數據庫 PDB 蛋白質晶體結構資料數據庫 (Protein Data Bank)。 PDB數據庫的維護由 結構生物信息學研究合作組織 （ Research Collaboration for Structural Bioinformatics, RCSB） 負責 。 通過實驗 （ X射線晶體衍射 ， 核磁共振 ，電子顯微鏡方法等 ）
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