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正文內(nèi)容

第三章dna多態(tài)性分析基礎(chǔ)(編輯修改稿)

2025-08-16 13:13 本頁(yè)面
 

【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 2 自發(fā)損傷 堿基脫嘌呤~ A或 G被切下來(lái) → 導(dǎo)致突變 堿基脫氨基~ C 脫氨成為 U→U 與 A配對(duì) 外界 物理因素 紫 外 線(xiàn) 嘧啶間誘導(dǎo)形成共價(jià)鍵 → 嘧啶二聚體( TT) 嘌呤間形成異?;瘜W(xué)鍵 電離輻射 機(jī)理~構(gòu)成基因的化學(xué)物質(zhì)電離 結(jié)果~堿基破壞、核糖分解、 DNA分子斷裂 化學(xué)因素 烷 化 劑 烷基置換堿基的氫原子 堿基被烷化,造成基因改變 類(lèi) 似 物 替代正常堿基摻入 DNA鏈中引起錯(cuò)配 5溴尿嘧啶、 2氨基嘌呤 切除修復(fù) —恢復(fù)正常結(jié)構(gòu) 重組修復(fù) 損傷可以保留 第二節(jié) 人 類(lèi) 基 因 組 基因組概念 廣義概念: 一個(gè)生物體的所有基因或遺傳物質(zhì) 狹義概念: 一大組基因、一個(gè)染色體或幾個(gè)染色體的基因 ** 基因組包含 基因序列 (2030%) + 非基因序列 (7080%) 基因組構(gòu)成 核 基 因 組: 單倍體細(xì)胞內(nèi)的全部 DNA分子, 3 109 bp 體細(xì)胞~ 22對(duì)常染色體和 1對(duì)性染色體 性細(xì)胞~ 22條常染色體和 1條型染色體 ** 每個(gè)細(xì)胞含相同的基因組拷貝(特殊除外) ** 平均每個(gè)細(xì)胞含有 6~ 10pg的 DNA 線(xiàn)粒體基因組: 線(xiàn)粒體內(nèi)包含的全部 DNA分子, 16569bp ** 每個(gè)細(xì)胞平均有 800個(gè)線(xiàn)粒體 ** 每個(gè)線(xiàn)粒體含有 10個(gè) DNA拷貝 一、人類(lèi)核基因組 DNA 基因組成: 包括合成有功能的多肽鏈或 RNA所必需的全部序列 真核生物 斷裂基因 基因中編碼序列被若干個(gè)插入序列分隔的不連續(xù)的鑲嵌結(jié)構(gòu) 編碼序列 外顯子 ( n ) 10%~50% 插入序列 內(nèi)含子 (n1) 50%~90% 決定基因長(zhǎng)度 編 碼 率 編碼序列長(zhǎng)度占整個(gè)基因序列的比例 外顯子 內(nèi)含子 轉(zhuǎn)錄 :模板 DNA 初級(jí) RNA 成熟 RNA 剪接方式: 特定外顯子 +不同外顯子 表達(dá)多種產(chǎn)物 表現(xiàn)為外顯子 /或 內(nèi)含子 表現(xiàn)多種功能 由同一 DNA序列可以得到不同的 mRNA,從而編碼多種 具有部分重疊序列的蛋白質(zhì)的基因稱(chēng)為 重疊基因 GT AG GT AG 基因分類(lèi) 結(jié)構(gòu)基因: 合成結(jié)構(gòu)蛋白、催化生化反應(yīng)的酶 調(diào)節(jié)基因: 阻遏蛋白或激活蛋白,控制基因活性 ◆ 既可以轉(zhuǎn)錄成 RNA,又可以翻譯成蛋白質(zhì) rRNA基因: 產(chǎn)物是核糖體的核糖體 RNA tRNA基因: 產(chǎn)物是轉(zhuǎn)移 RNA ◆ 只轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生相應(yīng) RNA,而不翻譯成蛋白質(zhì) 相關(guān)序列 前導(dǎo)序列和尾隨序列 能被轉(zhuǎn)錄,但不被翻譯 啟 動(dòng) 子: RNA聚合酶與 DNA結(jié)合起始部位 位置 :基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)上游( 5’1kb) 作用 :能與 RNA酶結(jié)合,調(diào)控基因表達(dá) 增 強(qiáng) 子: 調(diào)節(jié)基因產(chǎn)物與 DNA結(jié)合的部位 位置 :基因上游,促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄活性 作用 :促進(jìn)轉(zhuǎn)錄活性,增強(qiáng)啟動(dòng)子 DNA 功能不清,多拷貝或低拷貝形式; 30%串聯(lián)重復(fù) 概念: 在基因組中反復(fù)出現(xiàn),在基因組中含有一個(gè)以上相同 順序拷貝的 DNA序列稱(chēng)為 重復(fù)序列 DNA多態(tài)性基礎(chǔ) 分類(lèi): 反向重復(fù)序列 兩個(gè)序列相同的拷貝在 DNA上呈反向排列 重復(fù)序列間有間隔 位于基因調(diào)控區(qū)內(nèi) 重復(fù)序列間無(wú)間隔 與基因的轉(zhuǎn)錄、復(fù)制有關(guān) 串聯(lián)重復(fù)序列 相對(duì)恒定的序列為重復(fù)單位,首尾相接 大衛(wèi)星 DNA( macrosatellite DNA) 主要在在非編碼區(qū) 小衛(wèi)星 DNA ( minisatellite DNA ) 與染色體折疊壓縮 微衛(wèi)星 DNA (microsatellite DNA) 和染色體配對(duì)有關(guān) 散在重復(fù)序列 相同序列的重復(fù)單位散在分布 短散布元件 〈 500bp Alu序列 序列長(zhǎng)平均 250bp,含有 Alu I酶切位點(diǎn) ( AGCT) 同源性高達(dá) 80%,但具有 種屬特異性 人類(lèi) Alu序列長(zhǎng) 300bp( 130bp+31bp+130bp) 長(zhǎng)散布元件 〉 67kb Kpn序列 約 6500bp 衛(wèi)星 DNA 發(fā)現(xiàn): DNA主帶以外有多個(gè)小的衛(wèi)星帶 分類(lèi): 大衛(wèi)星 根據(jù)浮力密度不同 Ⅰ 衛(wèi)星 DNA( 2548bp) Ⅱ 衛(wèi)星 DNA( 5bpATTCC) Ⅲ 衛(wèi)星 DNA( 5bpATTCC) Ⅳ 衛(wèi)星 DNA(隱蔽的衛(wèi)星 DNA) α 衛(wèi)星 DNA 171bp 靈長(zhǎng)類(lèi)特有 β 衛(wèi)星 DNA 68bp 富含 GC γ 衛(wèi)星 DNA 220bp 成分: GC含量少于主帶中的 DNA 特征: DNA呈串聯(lián)重復(fù)形式 各類(lèi)型家族成員序列 G/C含量近似 具有相同的浮力密度 但是重復(fù)序列特征有明顯差異 所有串聯(lián)重復(fù) DNA序列都稱(chēng)為 衛(wèi)星 DNA 根據(jù)重復(fù)序列長(zhǎng)度和序列特征分類(lèi) 小衛(wèi)星 DNA 微衛(wèi)星 DNA ( minisatellite DNA ) (microsatellite DNA) 重復(fù)單位 15bp30bp 2bp6bp 重復(fù)次數(shù) 數(shù)次至數(shù)百次 10bp60次 序列總長(zhǎng) 100bp20kd 300bp 序列特征 核心序列 單拷貝 多態(tài)原因 VNTR STR 形成機(jī)制 不等交換,重組 復(fù)制滑動(dòng) 主要分布 近端粒處,著絲點(diǎn) 內(nèi)含子、間隔 DNA 有特定的基因座定位 有特定的基因座定位 核心序列 富含 G/C或 A/T的保守序列 不同小衛(wèi)星高度同源性 DNA指紋技術(shù) 基 因: 與正常功能基因在核苷酸序列上相似,但不能轉(zhuǎn)錄或 轉(zhuǎn)錄后生成無(wú)功能基因產(chǎn)物的 DNA序列。 突變: 復(fù)制 失去調(diào)控; 轉(zhuǎn)錄 拼接信號(hào); 翻譯 終止信號(hào) 其他: 丟失 5’ 或 3’ 端部分而失去活性 — 基因片段 : 基因組中來(lái)源相同,結(jié)構(gòu)相似,功能相關(guān)的一組基因 產(chǎn)物: 編碼 R N A ~ snRNA, tRNA, rRNA 編碼蛋白質(zhì) ~ 組蛋白、珠蛋白、生長(zhǎng)激素 位置: 同一個(gè)染色體上或不同染色體上 分類(lèi): 多 基 因 家 族 ( rRNA基因家族) 散在基因家族 (珠蛋白基因家族) 超 基 因 家 族( 免疫球蛋白、組織相容性復(fù)合體)
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