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第三章dna多態(tài)性分析基礎(chǔ)-資料下載頁

2025-07-20 13:13本頁面
  

【正文】 DNA指紋技術(shù)的理論基礎(chǔ) 發(fā)現(xiàn): 1985年 Jeffreys報告 人肌紅蛋白基因第一內(nèi)含子 重復(fù)單位 33個堿基,重復(fù) 4次 核心序列 16個堿基 探針: 篩選出 8個陽性克隆 核心序列 GGAGGTGGGCAGGAXG 確定探針 : AGGGCTGGAGG AGGTGGGCAGGTGG 分析: DNA酶切片段( HinfI) 電泳分析 轉(zhuǎn)移印跡 探針雜交 RFLP圖譜( 20條左右的片段) **偶合幾率 10111012 ?小衛(wèi)星變異重復(fù)多態(tài)性 部分重復(fù)單位內(nèi)部的出現(xiàn)堿基替換 重復(fù)單位 AGGTCGG 變異單位 AGGTTGG 等位基因 A 等位基因 B 酶切分析: PCR擴(kuò)增 ( short tandem repeats, STR) 特征: 重復(fù)單位 2bp6bp 不宜用 RFLP方法分析 實質(zhì)也是一種 VNTR PCR擴(kuò)增沒有優(yōu)勢擴(kuò)增 重復(fù)次數(shù) 5次 60次,總序列長度 400bp 微衛(wèi)星 DNA 適用于降解 DNA的鑒定 最常見是二核苷酸,法醫(yī)常用的是四核苷酸重復(fù) 必須用高分辨率的電泳方法分離 分布廣泛,人類基因組的 5%,估計 2050萬個 檢出 8000多個, 遺傳標(biāo)記數(shù)目多 絕大多數(shù)分布非編碼區(qū),極少三核苷酸位于編碼區(qū) 類型 :根據(jù)重復(fù)單位的堿基組成分為以下三類: 重復(fù)單位長度 重復(fù)單位組成 簡單重復(fù)序列 基本一致 基本一致 復(fù)合重復(fù)序列 基本一致 組成不同 復(fù)雜重復(fù)序列 長度不同 組成不同 篩選 基本條件: 多態(tài)性程度高 、擴(kuò)增穩(wěn)定性好 300bp 4核苷酸 ,無非重復(fù)單位堿基 812個 ,個人識別能力 、突變率低 命名 基 因 座 ?結(jié)構(gòu)基因 內(nèi)含子 中 STR基因座 GenBank注冊基因名稱命名 例: TH01 酪氨酸羥化酶基因第 1內(nèi)含子 ?非編碼 區(qū) /定位不清的 STR基因座 Genome Database原始序號 例: D3S1359 3號染色體 。單拷貝 。1359號 等位基因 不同實驗室檢驗結(jié)果的可比性和重復(fù)性 ?按照重復(fù)單位次數(shù)命名 5’GGTCATCATCATGG3’ “TCA TCA TCA” “CAT CAT CAT” ** 從離 5’端最近的核苷酸開始定義 ?含有不完全重復(fù)的等位基因 (完整重復(fù)等位基因數(shù)) (不完全堿基數(shù)) 例 :TH01基因座 [ATG]4ATG[AATG]5 ( 1) 同源重組 概念: 發(fā)生在聯(lián)會復(fù)合體內(nèi)的,同源染色體的兩條非姊妹染 色單體之間的遺傳物質(zhì)交換 條件 ,重組發(fā)生在同樣基因座 機(jī)制 : 不等交換 交換雙方地位平等,但數(shù)量不一定相等 證據(jù): 核心序列 G/C含量與堿基序列和大腸桿菌 χ 序列類似 χ 序列原核生物基因組 DNA重組的信號 以核心序列為探針與減數(shù)分裂中期的人染色體雜交 信號集中在染色體著絲點及附近 意義: 法醫(yī)學(xué) 形成 DNA片段長度多態(tài)性 遺傳學(xué) 減輕編碼區(qū)選擇壓力,維持物種穩(wěn)定 ( 2)基因的結(jié)構(gòu)重排 概念: 通過基因的轉(zhuǎn)座, DNA的斷裂錯接使正?;蝽樞虬l(fā) 生改變 機(jī)制 :結(jié)構(gòu)重排是一種 DNA雙鏈斷裂的修復(fù)過程。 DNA斷裂( 5’端的重復(fù)序列內(nèi)) 形成兩個游離末 修復(fù)過程中:末端的因擺動或錯位 —基因轉(zhuǎn)移移動 部位 : 基因內(nèi)重排 單鏈末端的堿基率先復(fù)復(fù)性 然后合成空缺的堿基,形成插入重復(fù)單位 TCC TCC TCC TCC TCC TCC TCC TCC AGG AGG AGG AGG AGG AGG AGG AGG 基因間重排 游離單鏈末端侵入對應(yīng)染色單體基因 形成同源染色單體基因移動 ( 1)部分重復(fù)單位的轉(zhuǎn)移 ( 2)基因共轉(zhuǎn)移(部分重復(fù)單位 +側(cè)翼 SNP) ( 3)基因間重組交換 ( 3)復(fù)制滑動 類型: 正向鏈 3’5’的滑動錯配 在正向鏈中 插入 1個重復(fù)單位 反向鏈 3’5’的滑動錯配 正向復(fù)制鏈中 缺失 1個重復(fù)單位 特點 : ,更傾向較短重復(fù)序列 是 STR多態(tài)性那個的主要原因 ,衛(wèi)星序列有自我加速復(fù)制、延長 該序列可以減輕編碼區(qū)承受的選擇壓力 DNA半保留復(fù)制的關(guān)系 只要出現(xiàn)不對稱環(huán),多為滑動錯配 二、 DNA序列多態(tài)性 概念: 是指一個基因座上,因不同個體 DNA序列有一個或多 個堿基的差異而構(gòu)成的多態(tài)性。 即:同一基因座上所有的等位基因 DNA長度相同 但它們之間的序列存在差異。 原因: 點突變 物種進(jìn)化 —對自然選擇的回應(yīng) 法 醫(yī) 學(xué) —提供大量的遺傳標(biāo)記 單核苷酸多態(tài)性( single nucleotide polymorphism,SNP) 在人類基因范圍內(nèi),如果任何單堿基突變使特定核苷酸位置上 出現(xiàn)兩種堿基,其中最少的一種在群體中的頻率不少于 1%。 特點: 二態(tài)基因 利于信息的自動化分析 含量豐富 在基因組中至少有 300萬個 SNP 期望: 高通量分型檢測的技術(shù)難題 遺傳標(biāo)記 分析方法 VNTR DNA指紋技術(shù) STR PCR擴(kuò)增技術(shù) SNP DNA芯片技術(shù) 概念: 半保留復(fù)制 DNA變性 DNA降解 DNA復(fù)性 分子雜交 Tm值 基因表達(dá) 斷裂基因 重疊基因 重復(fù)序列 串聯(lián)重復(fù)序列 多基因家族 端粒 異質(zhì)性 DNA多態(tài)性 DNA長度多態(tài)性 DNA序列多態(tài)性 核心序列 小衛(wèi)星變異單位多態(tài)性 同源重組 VNTR STR 小衛(wèi)星 DNA和微衛(wèi)星 DNA的主要區(qū)別 線粒體 DNA復(fù)制的特點 線粒體 DNA的主要特征 。 DNA一級結(jié)構(gòu)的生物學(xué)意義主要有 和 。 堿基配對原則的生物學(xué)意義 , 和 。 影響復(fù)性的主要因素是 和 。 DNA復(fù)制的過程包括 、 和 。 DNA聚合酶具有 、 和 功能。 聚合酶實現(xiàn) DNA復(fù)制的條件是 、 、 和 。 保證復(fù)制忠實性有 和 兩種機(jī)制 基因表達(dá)包括 和 兩個過程。 主要的 DNA修復(fù)方式是 和 。 基因分為 、 、 和 三。 真核生物基因的特點是 。 重復(fù)序列分 、 、和 三類。 線粒體 DNA突變率高的原因有 、 、 和 。 線粒體 DNA 的特點 、 、 、 和 。 基因突變的后果 、 、 、 和 。 STR的三種結(jié)構(gòu)類型有 、 和 。 STR篩選條件 、 、 、 、 和 長度多態(tài)性形成的機(jī)制
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