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正文內(nèi)容

ab第十七章ppt課件(編輯修改稿)

2025-06-08 13:49 本頁(yè)面
 

【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 非蛋白質(zhì)水平上的)分子標(biāo)記(或稱(chēng) DNA標(biāo)記)對(duì)生物群體進(jìn)行遺傳改良的技術(shù)。 現(xiàn)階段 DNA標(biāo)記輔助育種技術(shù)一般需要與常規(guī)育種技術(shù)特別是數(shù)量遺傳學(xué)方法相結(jié)合,故在名稱(chēng)中有“輔助”二字。 DNA標(biāo)記同樣可應(yīng)用于選擇、近交、雜交、保種等各個(gè)方面。 遺傳標(biāo)記( geic marker) : 能夠遺傳的、可以識(shí)別的并能明確反映遺傳多態(tài)性的生物特性。 遺傳標(biāo)記主要包括形態(tài)標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記、蛋白質(zhì)標(biāo)記和 DNA標(biāo)記等四類(lèi)。 DNA標(biāo)記的類(lèi)型: ? 基于單堿基突變的 DNA標(biāo)記 ? 基于重復(fù)序列變異的 DNA標(biāo)記 ? 基于隨機(jī)擴(kuò)增的多態(tài) DNA標(biāo)記 數(shù)量性狀基因座定位 ? 數(shù)量性狀基因座位( quantitative trait locus, QTL) : 在基因組中占據(jù)一定染色體區(qū)域,控制同一性狀的一組微效多基因的基因簇。 ? 一般認(rèn)為, QTL是指影響數(shù)量性狀變異的染色體區(qū)段,而不是一個(gè)確定的基因座( locus),通常該區(qū)段包含了數(shù)十到數(shù)百個(gè)不等的基因座。 ? 在控制一個(gè)性狀的所有 QTL中,通常都存在一個(gè)或數(shù)個(gè)效應(yīng)較大的 QTL,它們能單獨(dú)解釋表型總變異的10~50%甚至更多,當(dāng)其中一個(gè)位置明確的基因座效應(yīng)達(dá)到一定閾值時(shí),即可將該位置處的基因稱(chēng)為主基因( major gene)。 遺傳連鎖圖譜 (geic map) 遺傳連鎖圖譜是利用多態(tài)性遺傳標(biāo)記進(jìn)行遺傳連鎖分析得到的反應(yīng)遺傳標(biāo)記間相對(duì)關(guān)系的圖譜。 建立遺傳連鎖圖譜的理論基礎(chǔ)是染色體的交換和重組 , 即通過(guò)計(jì)算連鎖的遺傳標(biāo)記間的重組頻率 , 確定它們的相對(duì)距離 , 一般用厘摩 (centiMan, cM )表示 , 1 厘摩即每次減數(shù)分裂的重組頻率為1%。 遺傳連鎖圖譜 (geic map) 數(shù)量性狀位點(diǎn)定位 (QTL作圖 ) 通過(guò)連鎖分析確定出 QTL在圖譜上的位置與特定連鎖標(biāo)記之間的遺傳距離 , 進(jìn)而確定 QTL的表型效應(yīng)。 QTL 定位的策略 : 利用 QTL 與遺傳標(biāo)記之間的連鎖關(guān)系 , 在一個(gè)大群體中進(jìn)行標(biāo)記基因型和被測(cè)數(shù)量性狀表型值記錄 , 通過(guò)統(tǒng)計(jì)方法進(jìn)行連鎖分析 , 確定連鎖關(guān)系。 作圖群體數(shù)量性狀數(shù)據(jù)標(biāo)記數(shù)據(jù)連鎖遺傳圖 統(tǒng)計(jì)分析 QTL 定位標(biāo)記 QTL連鎖分析的基本步驟 3. 構(gòu)建標(biāo)記連鎖圖譜 4. QTL的檢測(cè)與參數(shù)估計(jì) 試驗(yàn)設(shè)計(jì) ( 1)基于近交系或品系雜交的試驗(yàn)設(shè)計(jì) 回交( Back Cross)設(shè)計(jì): 用雜交所得的 F1個(gè)體與兩個(gè)親本中的一個(gè)回交,利用回交后代的標(biāo)記基因型信息和數(shù)量性狀的表型信息進(jìn)行標(biāo)記 QTL的連鎖分析 F2設(shè)計(jì): 是將 F1個(gè)體互交產(chǎn)生 F2代個(gè)體,利用 F2代個(gè)體的標(biāo)記基因型信息和數(shù)量性狀的表型信息進(jìn)行標(biāo)記 QTL的連鎖分析 F2 intercross: Informative pig pedigree X qq Qq qq q q q q q q q q q X X X Large White Large White Meishan Meishan F1 F2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 22 2 2 2 2 2 q 1 2( 2)基于分離群體的試驗(yàn)設(shè)計(jì) 半同胞家系 全同胞家系 混合家系 三代家系資料及 DNA F2代性狀測(cè)定數(shù)據(jù) QTL檢測(cè) Unobserved QTL alleles q m Q M Observed marker alleles pair of chromosomes QTL detection Two approaches: ?Candidate genes ? Close linkage with QTL in outbred population ?QTL genome scan ? Loose linkage with QTL in cross or w/in families
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