ab第十七章ppt課件(參考版)
2025-05-15 13:49本頁面
【正文】 …or this 基因組序列 Illumina BeadArray 50萬個(gè)不同的磁珠 不同排列類型的 Illumina芯片 磁珠隨機(jī)分布在芯片上 每個(gè)磁珠附有大量探針（ Taq ＋ Reporter） 探針與基因組DNA結(jié)合 雙脫氧核苷酸與特定 SNP連接 SNP分型 基因組系譜 SNP 系譜 atagatcgatcg ctgtagcttagg agggcgcgcagt cgatctagatcg cggtagatcagt agagatcgatct atggcgcgaacg ctatcgctcagg ctgtagcgatcg agatctagatcg agagatcgcagt atgtcgctcacg ctgtctagatcg atgtcgcgcagt 基因型系譜 121101011110 111211120200 101121101111 122221121111 101101111102 011111012022 121120221010 0 = homozygous for first allele (alphabetically) 1 = heterozygous 2 = homozygous for second allele (alphabetically) What is a GWAS? 生產(chǎn)性狀表型值 基因型（ 50K） 基因型（ 50K） 建立模型，通過基因型預(yù)測個(gè)體育種值 預(yù)測個(gè)體育種值進(jìn)行選種 The End 。 這就是標(biāo)記輔助選擇（ markerassisted selection,MAS） Implementation logistics of MAS/GAS Phenotypic Database Selection Pedigree Phenotyping Farms Analytical tools Genotyping DNA collection Genotypic Database 候選基因分析 候 選基因分析是從若干可能是 QTL的基因（即候選基因）中篩選 QTL 侯選基因是已知在性狀的發(fā)展或生理過程中具有某種生物學(xué)功能并經(jīng)過測序的基因，可以是結(jié)構(gòu)基因或者是在調(diào)控或生化路徑中影響性狀表達(dá)的基因 候選基因分析 候選基因分析的基本流程 ? 選擇候選基因 ? 獲得用于擴(kuò)增基因的引物序列 ? 揭示候選基因內(nèi)的多態(tài)性 ? 建立對所揭示的多態(tài)位點(diǎn)進(jìn)行大規(guī)模的測定基因型的實(shí)用方法 ? 選擇用于進(jìn)行候選基因分析的群體 ? 研究候選基因與性狀的關(guān)系 ? 證實(shí)所發(fā)現(xiàn)的候選基因與性狀的關(guān)系 QTL 1 RNA 1 PROTEIN 1 Growth RNA 2 Growth hormone hormone gene PHENOTYPE QTL 3 RNA 3 PROTEIN 3 QTL 4 RNA 4 PROTEIN 4 侯選基因策略 MC4R RNA 1 MC4R QTL 2 RNA 2 PROTEIN 2 Leptin RNA X PROTEIN X Fat% NPY RNA Y NPY QTL 3 RNA 3 PROTEIN 3 QTL 4 RNA 4 PROTEIN 4 Nature of Complex
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