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正文內(nèi)容

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能(2)(編輯修改稿)

2025-05-29 13:42 本頁(yè)面
 

【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 ? 無(wú)規(guī)卷曲 ( random coil ) ? 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要形式: 維系二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要化學(xué)鍵: 氫鍵 (一) 肽鍵是一個(gè)剛性的平面 參與肽鍵的 6個(gè)原子 C? C、 O、N、 H、 C?2位于同一平面 , C?1和 C?2在平面上所處的位置為反式 (trans)構(gòu)型 ,此同一平面上的 6個(gè)原子構(gòu)成了所謂的肽單元 (peptide unit) 。 肽鍵一分子 氨基酸 的 α-羧基和一分子氨基酸的 α-氨基脫水縮合形成的 酰胺 鍵,即 CONH。氨基酸借肽鍵聯(lián)結(jié)成多 肽鏈 。是 蛋白質(zhì) 分子中的主要共價(jià)鍵 ,性質(zhì)比較穩(wěn)定。它雖是單鍵,但具有部分雙鍵的性質(zhì),難以 自由旋轉(zhuǎn) 而有一定的剛性,因此形成 肽鍵平面 ,則包括連接肽鍵兩端的 C═O、N-H和 2個(gè) Cα共 6個(gè)原子的空間位置處在一個(gè)相對(duì)接近的平面上,而相鄰2個(gè)氨基酸的側(cè)鏈 R又形成反式構(gòu)型,從而形成肽鍵與肽鏈復(fù)雜的空間結(jié)構(gòu)。 (二) ?螺旋 是常見(jiàn)的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu) α螺旋 ? 連續(xù)排列的酰胺平面旋轉(zhuǎn)形成 面螺旋 ? 右手螺旋 ? 酰胺平面與螺旋的長(zhǎng)軸平行 ? 一個(gè) ,每 () ? 螺旋借助相鄰兩圈之 NHCO穩(wěn)定 ? AA的側(cè)鏈伸向螺旋外側(cè) ? AA的大小和電荷可以影響螺旋的形成 (三) ?折疊 使多肽鏈形成片層結(jié)構(gòu) ? 較為伸展 ,酰胺平面以鋸齒狀排列 ? 兩個(gè)片段可以是平行或反平行 ? AA間距 平行 ? 反平行 ? 只有片段間氫鍵 ,無(wú)片段內(nèi)氫鍵 ? AA的側(cè)鏈伸向鋸齒狀結(jié)構(gòu)的外側(cè) ? 小側(cè)鏈的 AA有利于 β折疊的生成 反平行 β 折疊 平行 β 折疊 (四) ? 轉(zhuǎn)角和無(wú)規(guī)卷曲 在蛋白質(zhì)分子中普遍存在 ??轉(zhuǎn)角 ?無(wú)規(guī)卷曲 是用來(lái)闡述沒(méi)有確定規(guī)律性的那部分肽鏈結(jié)構(gòu)。 ⑴ 主鏈骨架本身以大約 180176。 回折; ⑵ 回折部分通常由 4個(gè)氨基酸殘基構(gòu)成; ⑶ 構(gòu)象依靠第一殘基的 CO基與第四殘基的 NH基之間形成氫鍵 來(lái)維系。 (五)模體 是蛋白質(zhì)的超二級(jí)結(jié)構(gòu) 在許多蛋白質(zhì)分子中,可發(fā)現(xiàn)二個(gè)或三個(gè)具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個(gè)特殊的空間構(gòu)象 , 并發(fā)揮專一的功能 ,被稱為模體 (motif)。 超二級(jí)結(jié)構(gòu): 2個(gè)或 2個(gè)以上二級(jí)結(jié)構(gòu)組合, αα, βαβ, ββ ? 模體 (motif): 數(shù)個(gè)至數(shù)十個(gè) AA組成的具有自身相對(duì)獨(dú)立 構(gòu)象和功能 的小區(qū)域,模體可構(gòu)成結(jié)構(gòu)域,也可獨(dú)立存在。 DNA結(jié)合蛋白中的鋅指模體( αββ組合) 鈣調(diào)素中的 EF 手型模體( αα螺旋組合) 轉(zhuǎn)錄因子 MyoD的螺旋 環(huán) 螺旋模體 DNA結(jié)合蛋白中的同源異型模體 模體與功能 ? 相同的模體表現(xiàn)出相同的功能,因此,不同蛋白質(zhì)只要有部分相似功能就可能具有相似的模體。 ? 具有不同功能的蛋白質(zhì)其模體不同,即使是同一類蛋白質(zhì)也表現(xiàn)出不同的性質(zhì)。 (六) 氨基酸殘基的側(cè)鏈可影響二級(jí)結(jié)構(gòu)的形成 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)是以一級(jí)結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)的。 一段肽鏈其氨基酸殘基的側(cè)鏈適合形成 ?螺旋或 β折疊,它就
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