蛋白質(zhì)結構與功能(2)(編輯修改稿)
2025-05-29 13:42 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 ? 無規(guī)卷曲 ( random coil ) ? 蛋白質(zhì)二級結構的主要形式： 維系二級結構的主要化學鍵： 氫鍵 （一） 肽鍵是一個剛性的平面 參與肽鍵的 6個原子 C? C、 O、N、 H、 C?2位于同一平面 ， C?1和 C?2在平面上所處的位置為反式 (trans)構型 ，此同一平面上的 6個原子構成了所謂的肽單元 (peptide unit) 。 肽鍵一分子 氨基酸 的 α－羧基和一分子氨基酸的 α－氨基脫水縮合形成的 酰胺 鍵，即 CONH。氨基酸借肽鍵聯(lián)結成多 肽鏈 。是 蛋白質(zhì) 分子中的主要共價鍵 ，性質(zhì)比較穩(wěn)定。它雖是單鍵，但具有部分雙鍵的性質(zhì)，難以 自由旋轉 而有一定的剛性，因此形成 肽鍵平面 ，則包括連接肽鍵兩端的 C═O、Ｎ－Ｈ和 2個 Cα共 6個原子的空間位置處在一個相對接近的平面上，而相鄰2個氨基酸的側鏈 R又形成反式構型，從而形成肽鍵與肽鏈復雜的空間結構。 （二） ?螺旋 是常見的蛋白質(zhì)二級結構 α螺旋 ? 連續(xù)排列的酰胺平面旋轉形成 面螺旋 ? 右手螺旋 ? 酰胺平面與螺旋的長軸平行 ? 一個 ,每 () ? 螺旋借助相鄰兩圈之 NHCO穩(wěn)定 ? AA的側鏈伸向螺旋外側 ? AA的大小和電荷可以影響螺旋的形成 （三） ?折疊 使多肽鏈形成片層結構 ? 較為伸展 ,酰胺平面以鋸齒狀排列 ? 兩個片段可以是平行或反平行 ? AA間距 平行 ? 反平行 ? 只有片段間氫鍵 ,無片段內(nèi)氫鍵 ? AA的側鏈伸向鋸齒狀結構的外側 ? 小側鏈的 AA有利于 β折疊的生成 反平行 β 折疊 平行 β 折疊 （四） ? 轉角和無規(guī)卷曲 在蛋白質(zhì)分子中普遍存在 ??轉角 ?無規(guī)卷曲 是用來闡述沒有確定規(guī)律性的那部分肽鏈結構。 ⑴ 主鏈骨架本身以大約 180176。 回折； ⑵ 回折部分通常由 4個氨基酸殘基構成； ⑶ 構象依靠第一殘基的 CO基與第四殘基的 NH基之間形成氫鍵 來維系。 （五）模體 是蛋白質(zhì)的超二級結構 在許多蛋白質(zhì)分子中，可發(fā)現(xiàn)二個或三個具有二級結構的肽段，在空間上相互接近，形成一個特殊的空間構象 ， 并發(fā)揮專一的功能 ，被稱為模體 (motif)。 超二級結構： 2個或 2個以上二級結構組合， αα， βαβ， ββ ? 模體 (motif)： 數(shù)個至數(shù)十個 AA組成的具有自身相對獨立 構象和功能 的小區(qū)域，模體可構成結構域，也可獨立存在。 DNA結合蛋白中的鋅指模體（ αββ組合） 鈣調(diào)素中的 EF 手型模體（ αα螺旋組合） 轉錄因子 MyoD的螺旋 環(huán) 螺旋模體 DNA結合蛋白中的同源異型模體 模體與功能 ? 相同的模體表現(xiàn)出相同的功能，因此，不同蛋白質(zhì)只要有部分相似功能就可能具有相似的模體。 ? 具有不同功能的蛋白質(zhì)其模體不同，即使是同一類蛋白質(zhì)也表現(xiàn)出不同的性質(zhì)。 （六） 氨基酸殘基的側鏈可影響二級結構的形成 蛋白質(zhì)二級結構是以一級結構為基礎的。 一段肽鏈其氨基酸殘基的側鏈適合形成 ?螺旋或 β折疊，它就
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