北大生化課件cha(1)(編輯修改稿)
2025-05-26 04:24 本頁面
【文章內(nèi)容簡介】 系組合起來的結(jié)構(gòu)稱為 超二級結(jié)構(gòu) (supersecondary structure) 或 花樣 (motif)。 超二級結(jié)構(gòu)（花樣）的存在，既可能與某些特殊的生物功能相關(guān)聯(lián)，也可能僅僅作為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組裝模塊。 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中的若干個(gè)二級結(jié)構(gòu)和 /或結(jié)構(gòu)花樣（ motif）通常會依據(jù)特定的幾何位置排列形成較為致密的稱為 “ 結(jié)構(gòu)域 (domain)”的球形結(jié)構(gòu)。 三級結(jié)構(gòu)（ tertiary structure） 作為常用的術(shù)語有兩重含義： 其一，單條多肽鏈折疊形成的由一個(gè)或者多個(gè)結(jié)構(gòu)域組成的全部結(jié)構(gòu)； 其二，二級結(jié)構(gòu)和 /或結(jié)構(gòu)花樣排列形成的結(jié)構(gòu)域。 蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)域與三級結(jié)構(gòu) a helix (a 螺旋 ) a helix (a 螺旋 ) a螺旋 a螺旋中的氫鍵均指向相同的方向，即肽單位沿螺旋軸處于相同的取向。由于肽單位有來自不同的 NH和 C＝ O基團(tuán)的偶極運(yùn)動(dòng)，這些偶極運(yùn)動(dòng)也是沿著螺旋軸的方向，總體效應(yīng)是產(chǎn)生一個(gè)有意義的凈偶極。 a螺旋的氨基端可提供部分正電荷，羧基端可以提供部分負(fù)電荷，這些電荷可以攻擊反電荷的配基。 帶負(fù)電荷的配基尤其當(dāng)它們包含磷酸基團(tuán)時(shí)，通常結(jié)合到a螺旋的氨基端。這樣的配基相互作用在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中是比較常見的。 a螺旋在蛋白質(zhì)分子中的分布是有傾向性的。 在水溶性球蛋白結(jié)構(gòu)中， a螺旋的一般位置是處于蛋白質(zhì)分子的外部。螺旋的一面朝著溶液，另一面朝著蛋白質(zhì)的疏水內(nèi)核，沿著螺旋走向殘基發(fā)生周期性的疏水性轉(zhuǎn)變。但是， a螺旋也可以完全包埋于分子的內(nèi)部或完全暴露于分子的表面。 與細(xì)胞膜結(jié)合的 a螺旋通常處于疏水的環(huán)境中，此時(shí)大多數(shù)殘基的側(cè)鏈?zhǔn)鞘杷畟?cè)鏈。如果蛋白質(zhì)中有一段較長的疏水殘基序列，則可能是一段與細(xì)胞膜作用有關(guān)的螺旋。
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