基因芯片分析的理論與方法(已修改)
2025-03-05 21:50 本頁面
【正文】 基因芯片分析的理論與方法ericexist@163. :7049971基因芯片概論基因芯片分析的概念n 基因芯片 (Gene chip)技術(shù)是指通過 微陣列 (Microarray)技術(shù)將高密度 DNA片段陣列通過高速機器人或原位合成方式以一定的順序或排列方式使其附著在如玻璃片等固相表面，以熒光標記的 DNA探針，借助堿基互補雜交原理，進行大量的基因表達及監(jiān)測等方面研究的技術(shù)。基因芯片分析的優(yōu)點n快速n高通量 (104 106)n自動化n使用的試劑少n低成本基因芯片分析的應用范圍n Academic research of geic diseasesnCancernPrenatal geics（ 產(chǎn)前遺傳學研究）nGeneral geic diseasesn Infectious diseasesn Drug discoveryn Animal farming/veterinary n Industrial (fermentation)n Environmental發(fā)展的方向 :從多角度研究揭示生命現(xiàn)象n Stages: developmental,transformation, time fter treatment, etc.n Treatments (stimuli, drugs, nutrients, etc.) n Physiological states (stressed, fasting, etc.)n Tissue distributionn (position, 3D)基因芯片的發(fā)展是推動系統(tǒng)生物學發(fā)展的動力利用基因芯片研究生命現(xiàn)象的測略n Factors involved = Componentsn Order of events = Pathwaysn Interactions = Circuit KEGGGO基因芯片的分類 根據(jù)用途分類根據(jù)用途分類 gene expression patternBiologicalSample Functional Information基因芯片的分類n Oligonucleotide arrayn – Synthesized on a chip（ Affymetrix）n – Spot on a solid matrix（ Compugen）n cDNA array（ Incyte ） 根據(jù)探針類型分類根據(jù)探針類型分類 expression genomic analysiscDNAChip Genomic Chip 2,000 n 50,000 n一些發(fā)展中的基因芯片技術(shù)平臺n 利用生物分子的電物理特性進行基因表達監(jiān)測：監(jiān)測速度很快，適用于基因表大，蛋白質(zhì)組及基因型的研究n 利用電場原理進行高密度芯片生產(chǎn)：基于適合用于生物學的集成電路，集成電路包含可以獨立尋址的微電極陣列，結(jié)合特殊的液體流動系統(tǒng)，可以使大部分生物分子按照來自于計算機的數(shù)字指令運動。n 噴墨點樣技術(shù)：以高度定位的形式把合成好的寡核苷酸分子噴點倒玻璃表面。n 寡核苷酸包被的微珠芯片n 平行信號測序技術(shù)：對基因表達進行定量分析基因芯片分析試驗方法基因芯片分析的主要步驟cDNA基因芯片分析的主要步驟cDNA芯片分析的主要步驟n Spot by Array spottercDNA芯片分析的主要步驟Hybridizing by Automatic hybridization processorcDNA芯片分析的主要步驟n Laser scannerOligonucleotide array （ GeneChip?）L L L LLLL LcDNAAAAA總 RNA的制備 反轉(zhuǎn)錄體外轉(zhuǎn)錄生物素標記的 cRNA片段化處理帶 標記的 cRNA片斷35200 bases ug/ul起始用量 510u
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