【正文】 終止轉(zhuǎn)錄。pursuit）模型 抗終止? 破壞終止位點 RNA的莖－環(huán)結(jié)構(gòu)? 依賴于蛋白質(zhì)因子的轉(zhuǎn)錄抗終止破壞終止位點 RNA的莖－環(huán)結(jié)構(gòu)? 一些控制氨基酸合成的操縱子結(jié)構(gòu)基因前有一段前導(dǎo)序列，帶有終止信號并有串聯(lián)的編碼某一氨基酸的密碼子 。ρ追上在終止位點暫停的 RNA ρ結(jié)合到 RNA鏈終止子上游的某一點 pol的一種輔助因子，當(dāng)其濃度為 RNAρ因子ρ因子 是一個相對分子質(zhì)量為 105的 六聚體 蛋白。?ρ因子與 ssRNA的特定位點結(jié)合 (C豐富， G缺乏 )。因子的參與。? 其終止需要 終止效率與二重對稱序列和寡聚 U的長短有關(guān)，隨著發(fā)卡式結(jié)構(gòu)和寡聚 U序列長度的增加，終止效率逐步提高。一半的基因含有內(nèi)部終止子。強(qiáng)終止子 3′端上有 46個 U，由于它和模板形成的連續(xù) UA配對較易打開，從而便于釋放出 RNA。(固有終止子 ) ?pol的前進(jìn)。?其后是一段大約 8個 A：T堿基對的序列。TATA boxHogness boxpromoter gene50 40 30 20 10 1 10 5’CAAT boxGC box原核和真核生物基因轉(zhuǎn)錄起始位點上游區(qū)的結(jié)構(gòu)比較 ?不依賴于 ρ因子的終止?依賴于 ρ因子的終止3.（ 4）有的有遠(yuǎn)距離的調(diào)控元件存在，如增強(qiáng)子；（ 5）這些元件常常起到控制轉(zhuǎn)錄效率和選擇起始位點的作用；（ 6）不直接和 RNA Pol結(jié)合。（ 1）有多種元件： TATA框， GC框， CATT框， OCT等；（ 2）結(jié)構(gòu)不恒定。 ⑦ 有的增強(qiáng)子可以對外部信號產(chǎn)生反應(yīng)。④ 無物種和基因的特異性 ，⑤ 具有組織的特異性。② 無方向性。已在 SV40的轉(zhuǎn)錄單元上發(fā)現(xiàn)其轉(zhuǎn)錄起始位點上游約 200bp處有兩段 72bp長的重復(fù)序列，它們不是啟動子的一部分，但能增強(qiáng)或促進(jìn)轉(zhuǎn)錄的起始，因此，稱這種能強(qiáng)化轉(zhuǎn)錄起始的序列為增強(qiáng)子或強(qiáng)化子（ enhancer）。 upstream增強(qiáng)子 (enhancer)1981年由 Benerji,研究 SV40晚期基因啟動子發(fā)現(xiàn)，上游激活區(qū)的存在與否，對該啟動子的生物活性有著根本性的影響。TATA區(qū) 使轉(zhuǎn)錄精確地起始 :如果除去 TATA區(qū)或進(jìn)行堿基突變，轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物下降的相對值不如 CAAT區(qū)或 GC區(qū)突變后明顯，但發(fā)現(xiàn)所獲得的 RNA產(chǎn)物起始點不固定。 上游啟動子元件（ upstream promoter element， UPE）： 將 TATA區(qū)上游的保守序列稱為上游啟動子元件或稱上游激活序列（ upstream activating sequence， UAS）。–80～ –110含有 GCCACACCC： –70～ –80區(qū) CCAAT序列GC上游啟動子元件（ UPE） CAAT–25～ –30box:真核生物啟動子的結(jié)構(gòu)特點1.bp處還有另一段共同序列 CCAAT，稱為 CAAT區(qū)（ CAAT bp處，保守序列為TATAAA，也稱 TATA區(qū)。真核生物 RNA聚合酶 II所識別的啟動子區(qū) 4080bp1 2 3（ 1）結(jié)構(gòu)典型，都含有識別（ R），結(jié)合（ B）和起始（ I）三個位點；（ 2）序列保守，如 35序列， 10序列結(jié)構(gòu)都十分保守；（ 3）位置和距離都比較恒定；（ 4）直接和多聚酶相結(jié)合；（ 5）常和操縱子相鄰；（ 6）都在其控制基因的 5′端；（ 7）決定轉(zhuǎn)錄的啟動和方向。sitePribnow5’Recognition110304050initiation 這可能是因為 RNA Pol本身的大小和空間結(jié)構(gòu)有關(guān)。－ 10區(qū)和－ 35區(qū)的最佳距離大約是 16～ 19 bp。 bp處的 TTGACA區(qū)，它們是 RNA聚合酶與啟動子的結(jié)合位點 ,能與 σ因子相互識別而具有很高的親和力。–10區(qū)……T 85T83G81A61C69A52……T 89A89T50A65A100…… 現(xiàn)已證實大部分啟動子都存在這兩段共同序列，即位于 –10 功能 : (1)為 RNA Pol的識別位點。－ 35區(qū)的發(fā)現(xiàn)35序列 科學(xué)家又從噬菌體的左、右啟動子 PL及 PR和 SV40啟動子的 –35?提純被保護(hù)的片段后卻發(fā)現(xiàn)， RNA聚合酶并不能重新結(jié)合或并不能選擇正確的起始點，表明在保護(hù)區(qū)外可能還存在與 RNA聚合酶對啟動子的識別有關(guān)的序列。mutation)；如果增加 Pribnow區(qū)的共同序列，將乳糖操縱子的啟動子中的 TATGTT變成 TATATT，就會提高啟動子的效率，稱為 上升突變 (up(2) 形成開放啟動復(fù)合體；(3) 使 RNA Pol定向轉(zhuǎn)錄。? 它和轉(zhuǎn)錄起始位點 I一般相距 5bp。原核基因啟動子10序列 (Pribnow框盒 )? 其保守序列為 TATAAT，位于 10bp左右，其中 3′端的 “T”十分保守。－ 10區(qū) (Pribnow區(qū) )的發(fā)現(xiàn)序列分析發(fā)現(xiàn)，在被保護(hù)區(qū)內(nèi)有一個由 5個核苷酸組成的保守序列，是聚合酶結(jié)合位點，稱為 Pribnow區(qū)，其中央大約位于起點上游 10bp處，所以又稱為 –10區(qū)。 啟動子區(qū)的基本結(jié)構(gòu)啟動子是一段位于結(jié)構(gòu)基因 5’端上游區(qū)的保守的 DNA序列，能活化 RNA聚合酶，使之與模板DNA準(zhǔn)確地相結(jié)合并具有轉(zhuǎn)錄起始的特異性。轉(zhuǎn)錄單元（ transcription轉(zhuǎn)錄起點是指與新生 RNA鏈第一個核苷酸相對應(yīng)DNA鏈上的堿基，通常為嘌呤。能RNA聚合酶 II 12 10220 催化 RNA的生物合成TBP真核生物 RNA聚合酶 II所形成的轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物蛋白質(zhì) 亞基數(shù) 亞基的分子量（ kDa）功 三磷酸核苷酸（ NTP）填補(bǔ)了開放的底物位點并在活性位點形成磷脂鍵；此時，處于 RNA聚合酶 II活性位點的核酸發(fā)生 “移位 ”，其中連接區(qū)的 α螺旋結(jié)構(gòu)從筆直變?yōu)閺澱墼倩謴?fù)為筆直狀態(tài)，為下一輪的 RNA合成留出了空的底物位點。cycle——translocationplex）；，第一個 rNTP轉(zhuǎn)錄開始， σ因子釋放，形成酶 啟動子 rNTP三元 復(fù)合體。plex）；1. 10序列處，模板 DNA局部變性，形成 “開放 的啟動子二元復(fù)合體 ”（ openRNA合成的起始 1. 核心酶在 σ因子參與下與模板 DNA接觸，生成非專一、不穩(wěn)定的復(fù)合物在模板上移動；2. ：全酶與模板的啟動子結(jié)合，產(chǎn)生 封閉 的 “酶 啟動子二元復(fù)合物 ”（ closed轉(zhuǎn)錄復(fù)合物開放復(fù)合物與最初的兩個 NTP相結(jié)合并在這兩個核苷酸之間形成磷酸二酯鍵后即轉(zhuǎn)變成包括 RNA聚合酶 、 DNA和 新生 RNA的 三元復(fù)合物 (ternaryplex） :聚合酶全酶所結(jié)合的 DNA序列中有一小段雙鏈被解開 ,封閉復(fù)合物轉(zhuǎn)變成開放復(fù)合物 啟動子選擇階段包括 RNA聚合酶全酶對啟動子的識別，聚合酶與啟動子可逆性結(jié)合形成封閉復(fù)合物，此時， DNA仍處于雙鏈狀態(tài)。DNA封閉復(fù)合物（ closedRNAbp/secExonucleasent/polTemplate dsDNA dsDNARequirepolymerase/replicationRNAandcleftRNAactivetheoutintoribonucleotidesRNAallowingvariousThere雙螺旋 DNA用傾斜的圓筒表示， TF II轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點用虛圈表示；（ B）后視圖。模板 DNA進(jìn)入轉(zhuǎn)錄復(fù)合體的路徑 線粒體和葉綠體 RNA聚合酶活性不受 α鵝膏蕈堿所抑制。真核生物線粒體和葉綠體中存在不同的 RNA聚合酶線粒體中 RNA聚合酶：? 只有一條多肽鏈，相對分子量小于 7 X 104，是已知最小的 RNA聚合酶之一；? 與 T7噬菌體 RNA聚合酶有同源性。相對分子質(zhì)量超過 5105。6其它 9個亞基 其它 7個亞基 其它 11個亞基注：亞基按照分子量由大到小的順序排列。69RPB115RP