生物化學(xué)——第一章蛋白質(zhì)-文庫吧資料
2025-01-22 12:43本頁面
【正文】 kink。 問： nm含幾個(gè)氨基酸殘基 ,螺旋上升幾圈？ 36個(gè)， 10圈 ? O …… （ 氫 鍵 ） ……… H ? — C— （ NH— CH— CO） 3— N— ? R ? 氫鍵由同一條肽鏈內(nèi) 每 3個(gè) 氨基酸殘基的 兩個(gè)肽鍵衍生而來，即 每個(gè)氨基酸殘基的NH與前面隔 3個(gè)氨基酸殘基的 C=O形成的。 ? 天然蛋白質(zhì)大部分為右手螺旋； ? α螺旋結(jié)構(gòu)模型特點(diǎn)： ? 螺旋樣盤卷前進(jìn) , AA/螺圈 ,上升 nm； AA間的距離為 nm。 α 螺旋 (α helix)（ 最常見的二級結(jié)構(gòu)形式 ） ?α — 螺旋是肽鏈的盤繞形式 ?有左右手之分 α 螺旋 ? (a)理想的右 α 螺旋。 （一）二級結(jié)構(gòu) (secondary structure) ? — 蛋白質(zhì)多肽鏈本身的折疊與盤繞方式 。 為什么？ 主要是因?yàn)殡逆溄Y(jié)構(gòu)的高度共振穩(wěn)定性。 答案： 肽鍵、二硫鍵（都屬于共價(jià)鍵） +二 硫 鍵 H2 半胱氨酸 半胱氨酸 胱氨酸 C HN H 2C O O HC H 2SHCHN H 2C O O HC H 2 S H CHN H 2C O O HC H 2 S C HN H 2C O O HC H2S二、蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu) （ 三維構(gòu)象，高級結(jié)構(gòu)或立體結(jié)構(gòu) ） 定義： 指蛋白質(zhì)分子中所有原子在三維空間排列分布和肽鏈的走向。 ? 20 19 我國 1965年在世界上第一個(gè)用化學(xué)方法人工合成的蛋白質(zhì)就是這種 牛胰島素 。 其中最重要的是多肽鏈的氨基酸順序，它是蛋白質(zhì)生物功能的基礎(chǔ)。 第五節(jié) 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu) 分四層次探討 一級結(jié)構(gòu) 二級結(jié)構(gòu) 三級結(jié)構(gòu) 四級結(jié)構(gòu) 一、一級結(jié)構(gòu)（線性結(jié)構(gòu)） ? 蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu) (primary structure) 指它的蛋白質(zhì)分子中各個(gè)氨基酸殘基的排列順序 。 ? 蛋白質(zhì)是由一條或多條多肽鏈以特殊方式結(jié)合而成的生物大分子。OH 腦肽是人在受到突然傷害，腦垂體自然分泌的“鴉片”。PheGlyOH 亮氨酸型 （ Leu腦啡肽）： HPheGly 腦啡肽 甲硫氨酸型（ Met腦啡肽）： H 肽的命名：通常從肽鏈的 N端開始 ， 稱為 某氨酰某氨酰 …… 某氨酸 如： HGluCysGlyOH 谷氨酰半胱氨酰甘氨酸 谷胱甘肽 (GSH)： 廣泛地存在于動(dòng)物、微生物的細(xì)胞中，是一個(gè)重要的三肽， 是某些酶的輔酶 。 ? 多個(gè)氨基酸形成的肽叫 多肽 ，呈鏈狀故又稱 多肽鏈。 （ 3） Edman反應(yīng) 1950年由 Edman設(shè)計(jì)的，首先用來鑒定多肽或蛋白質(zhì)的 N端氨基酸。 層析法鑒定 ， 確定 N端氨基酸種類 。 （ 2） Sanger反應(yīng) 與異硫氰酸苯酯（ PITC） 的反應(yīng) N C S N H C H COR 2N C H COR 1HHNHS :CC H COR 1H N N H C H COR 2SNHCN H OCR 1C HN H 2 C H COR 2NCO C HN HSCR 1(3) Edman反應(yīng) （ 3） Edman反應(yīng) 與異硫氰酸苯酯（ PITC） 的反應(yīng) 在弱堿性條件下，氨基酸中的 α 氨基與 PITC反應(yīng)，生成相應(yīng)的 PTC氨基酸，在無水酸中， PTC氨基酸環(huán)化成 PTH氨基酸。 可用熒光光度計(jì)快速測定出來 。 近年來測定 N端氨基酸 ， 廣泛使用 5二甲氨基萘磺酰氯 。 應(yīng)用： 比色分析（定量氨基酸） 、 顯色劑 、 氣體分析法 與 2， 4二硝基氟苯（ DNFB） 反應(yīng) O 2 N FN O 2+ H 2 N C H CR OH N C H CR OO 2 NN O 2H+H 2 OO 2 NN O 2H N C H CR OO H + 氨基酸D N F B N 端氨基酸 DNP 衍生物D N P 氨基酸（ 2） Sanger反應(yīng) 應(yīng)用：該反應(yīng)常用于多肽鏈或蛋白質(zhì)的 N端氨基酸的分析。 ?氨基和羧基共同參與的反應(yīng) CCCOOO茚三酮 CCCOOO HO HH 2 OH 2 O 水合茚三酮 C O 2N H 2R C H O ++++CCCOOHO HH 2 N C H C O O HRCCCOOO HO H+2 N H 3CCCOOCCCOO N H 4 +N H 2 O2++CCCOOOCCCOOHH O 所有的游離 α — 氨基酸都有此反應(yīng)，并產(chǎn)生 藍(lán)紫色物質(zhì) ，但脯氨酸與茚三酮反應(yīng)產(chǎn)生的為 黃色物質(zhì) 。 氨基酸的化學(xué)反應(yīng) 氨基酸的化學(xué)反應(yīng)主要是指它的 α 氨基和 α 羧基以及側(cè)鏈上的功能團(tuán)所參與的那些反應(yīng)，因此可以發(fā)生的反應(yīng)很多，以下介紹幾種反應(yīng)。 ?側(cè)鏈不含解離基團(tuán)的中性氨基酸，其等電點(diǎn)是它的 pK1和 pK2的平均值： pI = (pK1 + pK2 )/2 甘氨酸： （ pK1=） 一羧基 （ pK2=） 一氨基 pI=(pK1+pK2)/2= ?對于側(cè)鏈含有可解離基團(tuán)的氨基酸，其 pI值也決定于兩性離子兩邊的 pK值的平均值。 這一 pH值即為氨基酸的等電點(diǎn) （ pI） 。+H+H+C O O HC HH 3 N+R H+H++p K 2 39。 純晶體狀態(tài) C H COOH H 2 N R COO 3 + 水溶后 等電荷 狀態(tài) 總電荷 0 加 酸 H+ H+ H+ H “ +” C H COOH H 3 N R COO H3N+ 水溶后 等電荷 狀態(tài) 總電荷 0 加 堿 OH－ OH－ OH－ “ ” 2 H2O ? 氨基酸是個(gè)兩性電解質(zhì) ， 既可進(jìn)行酸解離也可進(jìn)行堿解離 ， 氨基酸在水溶液中就可能帶 +電或 電 ， 以及呈電中性 ， 由溶液的 pH值來決定 。 ? 平均 ?max＝ 280nm 氨基酸的光吸收 兩性解離和等電點(diǎn) 光譜分析證明 ,氨基酸在結(jié)晶形態(tài)或在水溶液中，并不是以游離的羧基或氨基形式存在，而是離解成兩性離子。 ? 在近紫外區(qū) (220300nm)只有 Tyr、 Phe和 Trp有吸收光的能力。 H 2 N C H CHO HO二、氨基酸的理化性質(zhì) 一般物理性質(zhì) 無色結(jié)晶 ， 熔點(diǎn)：均大于 200℃ ，味道，溶解性：溶解于水，特別是稀酸稀堿溶液，不溶于乙醚、氯仿等有機(jī)溶劑。 絲氨酸 Serine 蘇氨酸 Threonine 天冬酰胺 Asparagine 谷氨酰胺 Glutamine 半胱氨酸 Cysteine 甘氨酸 Glycine 極性不帶電荷氨基酸 H 2 N C H CC H 2O HOS H巰基 比非極性 R基氨基酸易溶于水，側(cè)鏈中含有不 解離的極性基。 絲氨酸 Serine 蘇氨酸 Threonine 天冬酰胺 Asparagine 谷氨酰胺 Glutamine 半胱氨酸 Cysteine 甘氨酸 Glycine 極性不帶電荷氨基酸 H2N C H CC H2O HOCN H2O酰胺 比非極性 R基氨基酸易溶于水，側(cè)鏈中含有不 解離的極性基。 吲哚 精氨酸 Argini 賴氨酸 Lysine 組氨酸 Histidine 堿性 氨基酸 H2N C H CC H2O HOC H2C H2N HCN H2N H胍基 堿性氨基酸在 pH值 精氨酸 Arginine 賴氨酸 Lysine 組氨酸 Histidine 堿性 氨基酸 H2N C H CC H2O HOC H2C H2C H2N H2堿性氨基酸在 pH值 精氨酸 Arginine
高考資料相關(guān)推薦
鄂ICP備17016276號-1