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生化與分子生物學(xué)技術(shù)原理-文庫吧資料

2025-01-22 10:44本頁面
  

【正文】 啶 pyrimidine Py 堿基三字符號 Ade Cyt Gua Thy Ura Ns單字符號 (d) A C G T U Ns, Nt, oligoNts 中均為 D戊糖 堿基可異構(gòu)化 異構(gòu)平衡僅 H 原子位置變化 UV,NMR分析 生理 pH 條件下 , 5種堿基 % 以氨基與酮式存在 。 酮式 烯醇式 氨基 亞胺 N糖苷鍵 C1 與嘧啶 N1 連接 C1 與嘌呤 N9 連接 oligo 表示法 poly U 均聚物 poly (dAdT) 交替排列 poly (dA2poly U 按 1:2結(jié)合成復(fù)合物 (三鏈 ) 抗生素 第二信使 嘌呤霉素 細(xì)胞激動(dòng)素 能源庫 輔酶 二 . 糖環(huán)的折疊形式 構(gòu)型 (configuration)共價(jià)化合物中 ,各個(gè)原子在空間的相對排列關(guān)系。 構(gòu)象的改變并不伴隨共價(jià)鍵的破壞 核酸中的核糖有多種構(gòu)象 核糖的五員環(huán)不處于一個(gè)平面, C1, , O,和 C4’ 三個(gè)原子在一個(gè)平面上, C2’ 或 /和 C3’ 偏離此平面,使核糖產(chǎn)生不同的構(gòu)象。 兩個(gè)原子偏離糖平面的程度可以相等或不等 C2’endoC3’exo C2’exoC3’endo 側(cè)視圖 ? 存在 溶液 : Nt , Ns C2’endo ~ C3’endo DNA : BDNA C2’endo ADNA(RNA) C3’endo ZDNA 胞苷 (C) C2’endo ( 反式) 鳥苷 (G) C3’endo(順式 ) (Bform double DNA) (Aform double DNA) 三 . 核苷的順反構(gòu)象 ( synanti 構(gòu)象 ) 核糖和堿基以 N糖苷鍵連接成核苷,核苷中堿基平面繞糖苷鍵旋轉(zhuǎn)形成核苷的順反構(gòu)象。 ]) 二聚體 NmpNp 3. 糖苷鍵不同 假尿苷 ψ (tRNA rRNA) C5C1’ 糖苷鍵 4. 修飾符號 m1A m7G Cm Ψm m2G m3 G 2 5. 分布 a. RNA ~70 ? mRNA ( hnRNA mRNA ) 5’Cap: m7G Nm 分子內(nèi) : m6A m5C ? rRNA 原核 m5C 真核 Nm mN Ψ 高度修飾成分 ( m1ncp3Ψ ) Hela cell 28S rRNA 65Nm ( 70 ) 18S rRNA 40Nm 6mN ? tRNA 60余種分布在環(huán)區(qū) anticodon loop 高度修飾 Q W ? SnRNA uRNA 5’end Cap m3 G ? 稀有堿基的形成 酶催化 CH3 堿基交換 Q tRNA鳥嘌呤 糖苷轉(zhuǎn)移酶 G34 (tRNA) Q34 (tRNA) Q Gua N 糖苷鍵打斷、重建 b. DNA ? ~10 種 甲基化 ? 形成 合成時(shí) om5dC參入 phage T 合成后甲基化 m5dC m6dA m4dC DNA 甲基化酶 S腺苷甲硫氨酸(甲基供體) a. 原核生物 DNA甲基化 ? 限制修飾系統(tǒng) ? DNA甲基化與復(fù)制 E. coli dam G *ATC dcm C *CA/TGG 完全甲基化 oriC 復(fù)制活性 半甲基化 oriC 抑制復(fù)制活性 oriC, dna 甲基化速度與復(fù)制循環(huán) 半甲基化 oriC 與膜結(jié)合抑制復(fù)制 (抑制劑 ) * dam– 半甲基化產(chǎn)物積累 DNA甲基化 ? 甲基化在兩條鏈上 , 對稱分布 真核生物 5’mCpG3’ 植物 5’mCNG3’ dC mdC 影響 DNA蛋白質(zhì) 相互作用 ? 甲基化格式具有組織專一性 pattern of methylation 格式變化 : 配子發(fā)生時(shí)期 , 胚胎發(fā)育早 期 ,病毒感染 格式維持 :DNA甲基化酶維持配子和體 細(xì)胞甲基化狀態(tài) 甲基化格式的維持 C*CGG CCGG CCGG 甲基化格式的限制性內(nèi)切酶分析 ?甲基化與基因表達(dá) 雞珠蛋白基因的組織特異性分析 (Mspl Hpall) CpG 表達(dá) (紅細(xì)胞) mCpG 不表達(dá)(腎、腦 …… ) 肌動(dòng)蛋白 ( actin gene)表達(dá) 高速率 轉(zhuǎn)錄 肌肉細(xì)胞 actin gene actin gene (CpG) (mCpG)
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