【正文】 發(fā)展分子系統(tǒng)學(xué) ( Mo lecu lar Systemat ics)發(fā)展起來 , 它利用大量分子實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù) , 采用生物統(tǒng)計(jì)學(xué)方法來研究生基因間和物體間的進(jìn)化關(guān)系 , 事用來闡明植物系統(tǒng)進(jìn)化的一門新興的學(xué)科。 主要成分：種子含脂類達(dá) %，脂類中的脂肪酸為：棕櫚酸（ palmitic acid)，硬脂酸（ dtearic acid)，油酸（ oleic acid)，亞油酸（ linoleic acid)和亞麻酸（ linolenic acid)，及痕量的肉豆蔻酸（ myristic acid)，棕櫚油酸（ palmitoleic acid)和花生酸（ arachidic acid)。治黃水瘡。又用治麻 (疣 )子。 面上生癬，取草效莖揉軟，不時(shí)搓之。 凡赤眼拳毛倒睫者，翻轉(zhuǎn)目險(xiǎn)，以一、二莖 蘸水戛去惡血。治癰腫，瘡癬，赤眼。色素成分為萘醌衍生物， 有紫草素（紫草醌， Shikonin）、乙酰紫草素（ Acetylshikonin）、去氧紫草素第一章 引 言 7 （ Deoxyshikonin）、異丁基紫草素（ Isobutyshi konin）、異戊酰紫草素（ Isovalerylshikonin）、 β， β二甲基丙烯酰紫草素（ β， βDimethyla crylshikonin）、β羥基 異戊酰紫草素 （ βHydroxyisovalerylshikonin）、紫草烷（ Alkannan）、紫草紅（ Alkannin）、 α甲基 正 丁酰紫草素（ αMethylnbutyrylshikonin）、 3， 4二甲基戊烯 3?；喜蒗?Teracrylshikonin）． 新疆假紫草根含 β羥基異戊酰紫草醌、 3,4二甲基戊烯 3?；喜蒗舅嶂饕獮檐浿?、油酸及亞油酸等。 紫草還有美容功效，紫草具有顯著的祛痘和消炎的效果，有很大的美容價(jià)值，被荀草園的永樂坊、美體小鋪、瑞士 magic care魔法護(hù)理等眾多化妝品品牌列為化妝品功能性成分之一紫草 的美容機(jī)理：紫草主要功能為涼血，活血化瘀，解毒透疹，因此能加速痘印和疤痕的新陳代謝，加上其良好的殺菌消炎作用。藥材基源為紫草科植物紫草、新藏假紫草或滇紫草的根。清熱涼血，用于麻疹，熱病癍疹，濕疹，尿血，血淋，血痢，瘡瘍，丹 毒，燒傷，熱結(jié)便秘。作為中藥的功能主治涼血，活血，解毒透疹。尚含花色素 3丙二酰葡萄糖甙[cyanidin3O（ 6C malonylβDglucopyranoside]?，F(xiàn)代臨床醫(yī)學(xué)也證明，菊花可擴(kuò)張冠狀動(dòng)脈，增加血流量，降低血壓，對冠心病，高血壓，動(dòng)脈硬化、血清膽固醇過高癥都有很好的療效。中醫(yī)多用以主治目赤、咽喉腫疼、耳鳴、風(fēng)熱感冒、頭疼、高血壓、瘡療毒等病癥。對肝火旺、用眼過度導(dǎo)致的雙眼干澀也有較好的療效?！渡褶r(nóng)本草經(jīng)》認(rèn)為，白菊花茶能 “主諸風(fēng)頭眩、腫痛、目欲脫、皮膚死肌、惡風(fēng)濕痹，久服利氣，輕身耐勞延年。菊花有野菊和家菊之分，其中家菊清肝 明目，野菊祛毒散火，甘苦微寒 ,清熱解毒 ,對眼睛勞損、頭痛、高血壓等均有一定效用。主治感冒風(fēng)熱，頭痛病等。有散風(fēng)清熱、清肝明目和解毒消炎等作用。 菊花為菊科多年生草本植物，是我國傳統(tǒng)的常用中藥材之一，主要以頭狀花序供藥用。據(jù)說，河南開封人用菊花包餃子，其滋味清香爽口，引人食欲。廣東人以菊花為酒宴名貴配料?？梢允秤?、茶用 、藥用。待到稍長大一些，便拔節(jié)生出一根細(xì)長的穗來，結(jié)滿了千百顆籽粒，毛茸茸的搖曳在風(fēng)里，仿佛調(diào)皮的小狗在抖動(dòng)著尾巴。然而只需要一場微雨，便足以讓它蓬勃成燎原之勢。我國栽培菊花的歷史悠遠(yuǎn) ,長久以來人們在賞菊時(shí)形成了一定的品評標(biāo)準(zhǔn) ,一盆合格的獨(dú)本菊應(yīng)具備 :每盆一本 ,著花一朵 ,花大瓣重 ,色澤艷麗 ,葉色墨綠 ,葉片肥大不脫節(jié) ,莖干粗直 ,節(jié)間短密均勻 ,無病蟲害 ,高度約 45cm,能充分體現(xiàn)本品種的特點(diǎn)?；ü谙那镩g。圓錐花序緊密呈圓柱形，長 2～ 15厘米，微彎垂或直立，綠色 、黃色或變紫色；小穗橢圓形，先端鈍，長 2～ ；第一穎卵形，具 3脈，第二穎具 5脈；第一外稃與小穗等長，具 5～ 7脈，有一窄狹的內(nèi)稃?；ā⒐?510月。圓錐花序緊密呈圓柱狀或基部稍疏離，直方或稍彎垂，主軸被較長柔毛，長 215cm，寬 413mm（除剛毛外），剛毛長 412mm，粗糙，直或稍扭曲，通常綠色或褐黃到紫紅或紫色；小穗 25個(gè)簇生于主軸 上或更多的小穗著生在短小枝上，橢圓形，先端鈍，長，鉛綠色；第 1穎卵形，長約為小穗的 1/3，具 3脈，第 2穎幾與小穗等長，橢圓形，具 57脈；第 1外稃與小穗等長，具 57脈，先端鈍，其內(nèi)稃短小狹窄，第 2外稃橢圓形，具細(xì)點(diǎn)狀皺紋，邊緣內(nèi)卷，狹窄；鱗被楔形，先端微凹；花柱基分離。稈直立或基部膝曲，高 10100cm，基部徑達(dá) 37mm。生于農(nóng)田、路邊、荒地。種子經(jīng)越冬休眠后萌發(fā)。一株可結(jié)數(shù)千至上萬粒種子。中國北方 4~5月出苗 ,以后隨澆水或降雨還會(huì)出現(xiàn)出苗高峰 。 種子發(fā)芽適宜溫度為 15~30℃ 。 狗尾草屬是禾本科，約 140種，分布溫帶和熱帶地區(qū)，我國約 17種，分布甚廣，其中最常見的有狗尾草 S. viridis （ L.） Beauv.，金色狗尾草 （ L. ）Beauv. 和粽葉狗尾草 S. palmifolia（ Willd. ） Stapf等，莖葉可作飼料；粟（小米）S. italica（ L. ） Beauv. 為我國很早就栽培的一種糧食作物，有很多品種和品系。一年生或多年生草本或亞灌木；葉互生，全緣；花白色、黃色或青紫色，組成穗狀花序或總狀花序；萼通常分裂，裂片 5，線形；花冠管狀或高腳碟狀，裂片 5，覆瓦狀排列，喉部有時(shí)有附屬體或有毛；雄蕊 5。為短日照植物，在每天，每天 12小時(shí)以上的黑暗與 10℃ 的夜溫適于花芽發(fā)育。在微酸性至微堿性土壤中皆能生長。 為多年生草植物。菊花品種遍布全國各城鎮(zhèn)與農(nóng)村，尤以北京、 南京、上海、杭州、青島、天津、開封、武漢、成都、長沙、湘潭、西安、沈陽、廣州、中山市小 欖鎮(zhèn)等為盛。頭狀花序上盤花和邊花同時(shí)存在或缺邊花。栽培種的頭狀花序較野生種大得多。 第一章 引 言 3 菊屬、紫草屬、狗尾草植物 菊屬、紫草屬、狗尾草屬植物的概況 菊屬是菊科 (Asteraceae)的一屬。目前研究計(jì)劃的一些代表是：檢測和分析基因組織，重復(fù)序列形式，蛋白 domain和結(jié)構(gòu)單元，建立人類基因組的基因圖譜， HIV感染的動(dòng)力學(xué)數(shù)學(xué)模型，數(shù)據(jù)庫搜索中的序列錯(cuò)誤影 響的分析，開發(fā)新的數(shù)據(jù)庫搜索和多重序列對齊算法，建立非冗余序列數(shù)據(jù)庫，序列相似性的統(tǒng)計(jì)顯著性評估的數(shù)學(xué)模型和文本檢索的矢量模型。他們一起用數(shù)學(xué)和計(jì)算的方法研究在分子水平上的基本的生物醫(yī)學(xué)問題。 NCBI通過下面的計(jì)劃來實(shí)現(xiàn)它的四項(xiàng)目的： NCBI有一個(gè)多學(xué)科的研究小組包括計(jì)算機(jī)科學(xué)家，分子生物學(xué)家，數(shù)學(xué)家，生物化學(xué)家，實(shí)驗(yàn)物理學(xué)家，和結(jié)構(gòu)生物學(xué)家，集中于計(jì)算分子生物學(xué)的基本的和應(yīng)用的研究。挑戰(zhàn)在于發(fā)現(xiàn)新的手段去處理這些數(shù)據(jù)的容量和復(fù)雜性，并且為研究人員提供更好的便利來獲得分析和計(jì)算的工具，以便推動(dòng)對我們遺傳之物和其在健康和疾病中角色的理解。闡明和使用這些字母來組成新的 “單詞和短語 ”是分子生物學(xué)領(lǐng)域的中心焦點(diǎn)。 NCBI(美國國立生物技術(shù)信息中心 )理解自然無聲但精妙的關(guān)于生命細(xì)胞的語言是現(xiàn)代分子生物學(xué)的要求。 GenBank數(shù)據(jù)庫中的序列信息量大 , 來源物種豐富、涵蓋廣泛 , 盡管尚有一定不足 , 但仍可用于篩選植物候選 DNA條形碼。每條紀(jì)錄都有編碼區(qū)（ CDS）特征的注釋，還包括氨基酸的翻譯。近年 , DNA條形碼技術(shù)受到了各國科學(xué)家的高度重視 , 已應(yīng)用于分類學(xué)、分子系統(tǒng)學(xué)、種群遺傳學(xué)的研究。 隱存種的發(fā)現(xiàn)、識別及形成機(jī)制是分類學(xué)研究的一個(gè)難點(diǎn)。紫草科有著名藥用植物紫草、早春野花斑種草、附地菜等，并且有與紫草具有同樣藥效的軟紫草、滇紫草等；有飼料植物聚合草；有觀賞植物基及樹（福建茶）、牛舌草；有油料植物破布木。禾本科是種子植物中最有經(jīng)濟(jì)價(jià)值的大科。 關(guān)鍵字 ： ndhF， 分子系統(tǒng)學(xué) ， 遺傳關(guān)系分析， GenBank數(shù)據(jù)庫ABSTRACT Ⅱ Abstract With the development of molecular biology and bioinformatics of rapid development, based on a variety of molecular data analysis has bee the main means of plant systematics research, of which DNA parative sequence analysis is most widely used. The plant has 3 sets of genome, according to the evolutionary rate from fast to slow in the nuclear genome, chloroplast genome ( nDNA ) ( cpDNA ) and mitochondrial genome ( mtDNA ) ( Wolfe et al.,1987). Each genome within different regions of nucleotide evolution rate, for each taxon of the system science research provides a rich source of variation. ndhF is a function of chloroplast gene, the gene contains 21 edit sites, and these 21loci are part of editing. Bioinformatics analysis and other species than the results show that, ndhF C290editors may influence the protein is correctly folded. Further use of monoclonal enzyme digestion method for the determination of the different stress treatments on ndhF C290editing efficiency Based on the ndhF sequence of several plant performed a geic relationship analysis. First, from the GenBank database screening plant sequences, the sequence using the software according to the correlation analysis, geic distance and molecular phylogeic analysis of ndhF fragment length parison, research and analysis of geic relationship of orchids Key words: ndhF geic, molecular systematics , GenBank database, relationship analysis 目 錄 III 目 錄 中文摘要 .................................................................................................... I ABSTRACT .............................................................................................. II 目 錄 ..................................................................................................... III 第一章 引 言 ..................................................................................... 1 課題背景和意義 ................................................................................................................................ 1 GenBank數(shù)據(jù)庫和 NCBI ................................................................................................................ 1 菊屬、紫草屬、狗尾草植物 ........................................................................................................