【正文】 p analysis. First, from the GenBank database screening plant sequences, the sequence using the software according to the correlation analysis, geic distance and molecular phylogeic analysis of ndhF fragment length parison, research and analysis of geic relationship of orchids Key words: ndhF geic, molecular systematics , GenBank database, relationship analysis 目 錄 III 目 錄 中文摘要 .................................................................................................... I ABSTRACT .............................................................................................. II 目 錄 ..................................................................................................... III 第一章 引 言 ..................................................................................... 1 課題背景和意義 ................................................................................................................................ 1 GenBank數(shù)據(jù)庫和 NCBI ................................................................................................................ 1 菊屬、紫草屬、狗尾草植物 ........................................................................................................... 3 菊屬、紫草屬、狗尾草屬植物的概況 ................................................................................... 3 菊屬、紫草屬、狗尾草屬植物的觀賞價(jià)值 ........................................................................... 5 菊屬、紫草屬、狗尾草屬植物的藥用價(jià)值及其有效成分 .................................................. 5 DNA 序列分析在植物分子系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用和難題 ............................................................ 7 分子系統(tǒng)學(xué) .................................................................................................................................. 7 DNA 序列分析在植物分子系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用 ................................................................. 8 DNA序列在植物分子系統(tǒng)學(xué)研究中的發(fā)展 .......................................................................... 8 由 DNA單一序列分析向多序列分析發(fā)展 ..................................................................... 8 由常用 DNA片段分析向低拷貝核基因分析發(fā)展 ......................................................... 9 在植物分子系統(tǒng)學(xué)研究中常見的難題 ................................................................................... 9 系統(tǒng)分析結(jié)果存在沖突 ...................................................................................................... 9 系統(tǒng)關(guān)系無法得到解決 .................................................................................................. 10 DNA條形碼 .............................................................................................................................. 11 第二章 實(shí)驗(yàn)方法 ................................................................................. 14 材料與方法 ...................................................................................................................................... 14 主要軟件 ................................................................................................................................... 14 數(shù)據(jù)來源 .................................................................................................................................. 14 材料 ........................................................................................................................................... 14 數(shù)據(jù)分析 .................................................................................................................................. 17 第三章 結(jié)果與討論 ............................................................................ 18 目 錄 IV 結(jié)果分析 .......................................................................................................................................... 18 ndhF 序列長度和 C+G 百分含量 ........................................................................................... 18 遺傳距離分析 .......................................................................................................................... 18 聚類分析 .................................................................................................................................. 20 討論 .................................................................................................................................................. 20 ndhF 作為候選 DNA條形碼的優(yōu)勢(shì) ...................................................................................... 20 通過 GenBank查尋 DNA條形碼研究植物遺傳關(guān)系的可行性 ....................................... 23 結(jié) 論 ................................................................................................ 23 參考文獻(xiàn) ............................................................................................. 24 致 謝 ................................................................................................ 26 第一章 引 言 1 第一章 引 言 課題背景和意義 菊科是 菊糖完全代替了淀粉作為多聚糖貯存。近年 , DNA條形碼技術(shù)受到了各國科學(xué)家的高度重視 , 已應(yīng)用于分類學(xué)、分子系統(tǒng)學(xué)、種群遺傳學(xué)的研究。闡明和使用這些字母來組成新的 “單詞和短語 ”是分子生物學(xué)領(lǐng)域的中心焦點(diǎn)。目前研究計(jì)劃的一些代表是：檢測(cè)和分析基因組織，重復(fù)序列形式，蛋白 domain和結(jié)構(gòu)單元，建立人類基因組的基因圖譜， HIV感染的動(dòng)力學(xué)數(shù)學(xué)模型，數(shù)據(jù)庫搜索中的序列錯(cuò)誤影 響的分析，開發(fā)新的數(shù)據(jù)庫搜索和多重序列對(duì)齊算法，建立非冗余序列數(shù)據(jù)庫，序列相似性的統(tǒng)計(jì)顯著性評(píng)估的數(shù)學(xué)模型和文本檢索的矢量模型。菊花品種遍布全國各城鎮(zhèn)與農(nóng)村，尤以北京、 南京、上海、杭州、青島、天津、開封、武漢、成都、長沙、湘潭、西安、沈陽、廣州、中山市小 欖鎮(zhèn)等為盛。一年生或多年生草本或亞灌木；葉互生，全緣；花白色、黃色或青紫色，組成穗狀花序或總狀花序；萼通常分裂，裂片 5，線形；花冠管狀或高腳碟狀，裂片 5，覆瓦狀排列，喉部有時(shí)有附屬體或有毛；雄蕊 5。一株可結(jié)數(shù)千至上萬粒種子。圓錐花序緊密呈圓柱狀或基部稍疏離，直方或稍彎垂，主軸被較長柔毛，長 215cm，寬 413mm（除剛毛外），剛毛長 412mm，粗糙，直或稍扭曲，通常綠色或褐黃到紫紅或紫色；小穗 25個(gè)簇生于主軸 上或更多的小穗著生在短小枝上，橢圓形，先端鈍，長，鉛綠色；第 1穎卵形，長約為小穗的 1/3，具 3脈，第 2穎幾與小穗等長，橢圓形，具 57脈；第 1外稃與小穗等長，具 57脈，先端鈍，其內(nèi)稃短小狹窄，第 2外稃橢圓形，具細(xì)點(diǎn)狀皺紋，邊緣內(nèi)卷，狹窄；鱗被楔形，先端微凹；花柱基分離。我國栽培菊花的歷史悠遠(yuǎn) ,長久以來人們?cè)谫p菊時(shí)形成了一定的品評(píng)標(biāo)準(zhǔn) ,一盆合格的獨(dú)本菊應(yīng)具備 :每盆一本 ,著花一朵 ,花大瓣重 ,色澤艷麗 ,葉色墨綠 ,葉片肥大不脫節(jié) ,莖干粗直 ,節(jié)間短密均勻 ,無病蟲害 ,高度約 45cm,能充分體現(xiàn)本品種的特點(diǎn)。廣東人以菊花為酒宴名貴配料。主治感冒風(fēng)熱，頭痛病等。中醫(yī)多用以主治目赤、咽喉腫疼、耳鳴、風(fēng)熱感冒、頭疼、高血壓、瘡療毒等病癥。清熱涼血，用于麻疹，熱病癍疹，濕疹，尿血，血淋，血痢，瘡瘍，丹 毒，燒傷，熱結(jié)便秘。治癰腫，瘡癬，赤眼。治黃水瘡。分子系統(tǒng)學(xué)主要的內(nèi)容包括分類學(xué)研究、系統(tǒng)發(fā)育重建和分子進(jìn)化和