【正文】 Rice, C., Structure of the zincbinding domain of an essential ponent of the hepatitis C 。 therapeutics 2010, 32 (1), 1428.2. (a) Tellinghuisen, T.。 Sarrazin, C.。 (h) Sofia, M., Nucleotide prodrugs for HCV therapy. Antiviral Chem. Chemother 2011。 (g) Vermehren, J.。hler, S.。 Research Clinical Gastroenterology 2012, 26。 (e) Qiuwei, P.。 Neddermann, P.。 Vliegen, I.。 (d) Delang, L.。 (c) Manns, M.。 (b) Scheel, T.。我們根據(jù)專利報(bào)道以及文獻(xiàn)綜述，選擇下面兩個(gè)化合物：GS9620已經(jīng)進(jìn)入臨床Ⅰ期。如下圖所示：以上設(shè)計(jì)經(jīng)過Scifinder查重驗(yàn)證。之后被更廣泛的定義包含，此定義為雜環(huán)、取代雜環(huán)、雜芳環(huán)、取代雜芳環(huán)。在專利中，此處D被定義為苯基、二苯基、吡啶基，并且此處的苯基、二苯基、吡啶基為L2NR6R7取代（L為烷基鏈或共價(jià)鏈）。為此，我們對此處專利保護(hù)情況進(jìn)行了調(diào)研。三、 創(chuàng)新藥物設(shè)計(jì)以嘧啶并六元環(huán)為核心。其活性結(jié)果如下表所示：項(xiàng)目活性報(bào)告（EC50/μM）人TLR7 HEK29352437 52429人TLR8 HEK29352437 人TLR9 HEK29352437 5242952406 52409IFNα等 PBMCs對四個(gè)化合物都有反應(yīng)值得注意的是下述結(jié)構(gòu)為TLR7等的抑制劑（見專利WO2008152471A141）：而在專利US2009209524A142中，AstraZeneca公司披露了以下骨架：此類化合物是TLR7的激動(dòng)劑，給出結(jié)構(gòu)的100多個(gè)化合物在TLR7 HEK293細(xì)胞上的的活性（pEC50）。據(jù)此合成了以下幾個(gè)化合物（顯示部分）：編號結(jié)構(gòu)編號結(jié)構(gòu)3i73g89選擇化合物3i測試器TLR7活性，結(jié)果如下：項(xiàng)目活性報(bào)告TLR 三氮唑類（Triazole）在專利WO2009030996 A139中，Coley Pharmaceutical Group, ，它們是TLR7和TLR8的強(qiáng)效激動(dòng)劑。部分化合物結(jié)構(gòu)見下表：編號結(jié)構(gòu)編號結(jié)構(gòu)1234567而在專利US2012258928A136，US2012316327A137中，Gilead Science, ：此類化合物是HCV治療藥物的前藥，但在專利中并沒有提及機(jī)理是否是通過TLR途徑實(shí)現(xiàn)，然而鑒于其與上述Anadys化合物結(jié)構(gòu)的相似性，也將其進(jìn)展列出。然而由于最近Roche宣布收購了Anadys，此項(xiàng)目前途未卜。隨后，對ANA975配方的進(jìn)一步研究也被終止，由此分析，每日給藥的劑量無法達(dá)到足夠的治療指數(shù)。發(fā)現(xiàn)也具有良好的耐受性，并且能夠有效的產(chǎn)生艾沙托立賓。艾沙托立賓使病毒載量降低的幅度中等，考慮到相對較高的給藥劑量，反映出其在TLR7受體上較弱的藥理作用（primary pharmacology），還需要改進(jìn)出更強(qiáng)效的類似物。其中，艾沙托立賓進(jìn)入到治療HCV感染的Ⅱ期臨床實(shí)驗(yàn)。 而在專利US2011098294A130中，Dennis A. Carson公司披露了以下骨架：此類化合物是HCV治療藥物的前藥，但在專利中并沒有提及機(jī)理是否是通過TLR途徑實(shí)現(xiàn)，然而鑒于其與上述Anadys化合物結(jié)構(gòu)的相似性，也將其進(jìn)展列出。項(xiàng)目TLR7 活性報(bào)告HCVHEK293 AssayIFNPMBC Assay；部分化合物結(jié)構(gòu)見下表：編號結(jié)構(gòu)編號結(jié)構(gòu)12345678910111213141516Pfizer公司US2006264448A129專利披露了250個(gè)化合物結(jié)構(gòu)，骨架如下：部分活性結(jié)果與結(jié)構(gòu)見下表（活性結(jié)果ED50為TLR7激動(dòng)劑增加干擾素IFN釋放從而使PBL/HCV復(fù)制水平降低50%時(shí)的濃度）。而在專利US2011098248A127中，Gilead Science, ，披露了以下骨架：此類化合物是TLR7的激動(dòng)劑，給出結(jié)構(gòu)的59個(gè)化合物中多數(shù)化合物的活性（MEC）接近1nM。TLR7 活性報(bào)告HCVHEK293 AssayIFN PBMC Assay；Examples A,C,D,F,J,N,R,W,Y,AI,AJ,AQ,AS,AU,AY,AW,AZ,BE,BG,BH,and BM 的IFN ECmax 值小于5 nM。D公司披露了以下結(jié)構(gòu)骨架：此專利披露了約75個(gè)化合物結(jié)構(gòu)，部分活性結(jié)果見下表（MEC，活性結(jié)果為誘導(dǎo)INF所需最低濃度）。D公司對右側(cè)邊鏈末端為酯基的情況進(jìn)行了研究，披露了以下骨架：此類化合物是TLR7的激動(dòng)劑，給出了近70個(gè)化合物結(jié)構(gòu)。D公司對右側(cè)邊鏈長度以及形狀進(jìn)行了更深入的研究，披露了以下骨架：此類化合物是TLR7的激動(dòng)劑，給出了近20個(gè)化合物結(jié)構(gòu)。D公司披露了以下結(jié)構(gòu)骨架：此專利披露了7個(gè)化合物結(jié)構(gòu)，部分活性結(jié)果見下表（活性結(jié)果pEC50為TLR7激動(dòng)劑誘導(dǎo)SEAP（secreted alkaline phosphatase）產(chǎn)生達(dá)到此化合物最大水平一半時(shí)所需的濃度）。D公司披露了以下結(jié)構(gòu)骨架：此專利披露了10個(gè)化合物結(jié)構(gòu)，活性結(jié)果見下表（活性結(jié)果pEC50為TLR7激動(dòng)劑誘導(dǎo)SEAP（secreted alkaline phosphatase）產(chǎn)生達(dá)到此化合物最大水平一半時(shí)所需的濃度）。D）的專利，以及相同時(shí)期Gilead Sciences, ，最后還有少部分GlaxoSmithKline ，其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)為都具有相同的中心骨架。在C2位的功能團(tuán)化也得到TLR7強(qiáng)效激動(dòng)劑如SM360320，在干細(xì)胞中能夠抑制HCV復(fù)制。并且，在雪貂嘔吐模型中，以30mg/kg給藥SM276001，仍無嘔吐反應(yīng)，而瑞喹莫德在比Cmax低十倍劑量下仍然劇烈嘔吐，Dainippon Sumitomo研究人員猜測可能是由于后者更強(qiáng)的CNS透過能力。作為已披露的腺嘌呤衍生物的一個(gè)，在小鼠脾細(xì)胞體外實(shí)驗(yàn)以及小鼠體內(nèi)口服實(shí)驗(yàn)中都表現(xiàn)出強(qiáng)效的IFN誘導(dǎo)作用。17此類化合物是TLR7的強(qiáng)效激動(dòng)劑，并在結(jié)構(gòu)上和艾沙托立賓（isatoribine，后面會(huì)介紹）的堿性部分結(jié)構(gòu)相似。其中，活性較高的化合物11782結(jié)構(gòu)分別如下：編號結(jié)構(gòu)編號結(jié)構(gòu)1EC50=104nM2EC50=107nM3EC50=100nM4EC50=127nM專利US2011039884A115披露了10個(gè)化合物結(jié)構(gòu)，部分活性結(jié)果見下表（活性結(jié)果EC50為TLR7激動(dòng)劑增加干擾素IFN釋放從而使PBL/HCV復(fù)制水平降低50%時(shí)的濃度）。CompREC50，nMCompREC50，nM111213141516171819202122目前，相關(guān)專利中對此類化合物的涵蓋范圍如下：Pfizer公司的US2007197478A114 、US2011039884A11 US2012302598A116三篇專利。項(xiàng)目活性報(bào)告IFNα和TNFα PBMCs此專利公布約400化合物，代表性化合物結(jié)構(gòu)如下表所示：編號結(jié)構(gòu)編號結(jié)構(gòu)12 8氧去氮嘌呤（8oxodeazapurines）類/咪唑并吡啶酮類（Imidazopyridinones）Pfizer披露了一組強(qiáng)效的8氧去氮嘌呤類TLR7激動(dòng)劑，代表性化合物（PF4171455）結(jié)構(gòu)如下圖所示，被開發(fā)作為HCV治療藥物。目前，相關(guān)專利中對此類化合物的涵蓋范圍如下：在專利US2011245289A110中，4SC ：此系列化合物是TLR7選擇性激動(dòng)劑，用作腫瘤的治療。此化合物能夠計(jì)量依賴和給藥頻率依賴的誘導(dǎo)免疫生物標(biāo)記物和IFN反應(yīng)。9此化合物被Coley公司研發(fā)用作抗腫瘤，是TLR7的強(qiáng)效激動(dòng)劑。隨后對此類化合物進(jìn)行了構(gòu)效關(guān)系研究，得到了TLR8選擇性激動(dòng)劑，結(jié)構(gòu)如下圖所示：以及其它的TLR7/8激動(dòng)劑，結(jié)構(gòu)如下圖所示：2007年3M將絕大部分的TLR激動(dòng)劑產(chǎn)權(quán)打包出售給Coley Pharmaceutical Group，此公司隨后被Pfizer收購。瑞喹莫德是TLR7/8的激動(dòng)劑，作為HCV的治療藥物進(jìn)入臨床Ⅱa階段。瑞喹莫德（Resiquimod）作為第二代藥物研發(fā)，但2003年開發(fā)終止，原因是其缺乏足夠的藥效?；衔锓诸愐罁?jù)其核心結(jié)構(gòu)特點(diǎn)進(jìn)行。 Schinazi, R., Synthesis and evaluation of novel potent HCV NS5A inhibitors. Bioorganic amp。 Whitaker, T.。 McBrayer, T.。 Bobeck, D.。 Amblard, F.。 medicinal chemistry letters 2012, 22 (10), 34883491.6. Zhang, H.。 Coats, S.。 Tharnish, P.。 Bondada, L.。 Zhang, H.。 Amblard, F.。 Min, G., Characterizations of HCV NS5A replication plex inhibitors. Virology 2013.5. Shi, J.。 Nicholas, A. M.。 Michael, .。 Van, N. N.。 Jeffrey, L. R.。 Robert, A. F.。 Peter, T. N.。 medicinal chemistry letters 2013, 23 (15), 44284435.4. Donald, R. O. B., II。 Meanwell, N.。 Gao, M.。 Fridell, R.。 Sun, .。 O39。 Nower, P.。 Qiu, Y.。 St Laurent, D.。 (e) Belema, M.。 Nicholas, A. M.。 Fukang, Y.。 JinHua, S.。 Jeffrey, L. R.。 Donald, R. O. B.。 Van, N. N.。 Mengping, L.。 Rudolph, G. K.。 Min, G.。 Min, D.。 Michael, H. .。 Medicinal Chemistry Letters 2013, 23。 Nicholas, A. M.。 Min, G.。 Robert, A. F.。 Donald, R. O. B.。 Lourdes, V.。 Amy, S. R.。 Fukang, Y.。 Michael, H. .。 Denis, R. S. L.。 (c) Omar, D. L.。 Lawrence, B. S., HCV NS5A replication plex inhibitors. Part 2: Investigation of stilbene prolinamides. Bioorganic amp。 Xuejie, Y.。 Lourdes, V.。 Michael, H. .。 Yuping, Q.。 Peter, T. N.。 Omar, D. L.。 Julie, A. L.。 Ramesh, K.。 Min, G.。 (b) Denis, R. S. L.。 Nicholas, A. M.。 Xiaohua, H.。 JinHua, S.。 Donald, R. O. B.。 Fukang, Y.。 Scott, W. M.。 Denis, R. S. L.。 Wells, P.。 Brodsky, O.。 Rice, C., Structure of the zincbinding domain of an essential ponent of the hepatitis C virus replicase. Nature 2005。 therapeutics 2010, 32 (1), 1428.2. (a) Tellinghuisen, T.。 Sarrazin, C.。 (h) Sofia, M., Nucleotide prodrugs for HCV therapy. Antiviral Chem. Chemother 2011。 (g) Vermehren, J.。hler, S.。 Research Clinical Gastroenterology 2012, 26。 (e) Qiuwei, P.。 Neddermann, P.。 Vliegen, I.。 (d) Delang, L.。 (c) Manns, M.。 (b) Scheel, T.。五、創(chuàng)新藥物設(shè)計(jì)綜合相關(guān)文獻(xiàn)專利，此類化合物的基本形狀是γ扭曲形結(jié)構(gòu)，Linker/Core為柱狀結(jié)構(gòu)，兩邊為氨基酸，其γ扭曲通過環(huán)實(shí)現(xiàn)，如下圖所示：此類化合物的Linker/Core的芳環(huán)結(jié)構(gòu)給我們留下很大改動(dòng)余地。雖然化合物30的獲得是一個(gè)里程碑式進(jìn)步，但其類藥性卻存在問題，比如其sp