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正文內(nèi)容

華東理工大學(xué)-過程分子生物學(xué)(1)-資料下載頁

2025-08-04 14:49本頁面
  

【正文】 靶基因的表達 , 他對這個結(jié)果百思不得其解 。 直到 1998年 , 美國卡內(nèi)基研究所的Andrew Fire用 確鑿的實驗結(jié)果證明 , 在正義 RNA阻斷基因表達的實驗中 , 真正起作用的是小分子的雙鏈 RNA, 它們是體外轉(zhuǎn)錄正義 RNA時生成的 。 上述雙鏈 RNA對基因表達的阻斷作用稱為 RNA干擾 ( RNAi) 。隨后大量的研究發(fā)現(xiàn) , RNAi 現(xiàn)象廣泛存在于線蟲 、 果蠅 、 斑馬魚 、 真菌 、 植物等生物體內(nèi) , 它們借助于 RNAi 抵御病毒的感染 , 阻斷轉(zhuǎn)座子 的轉(zhuǎn)座作用 , 以維持其基因組的相對穩(wěn)定性 。 1F 真核生物 sRNA介導(dǎo)的 RNA干擾 a RNA干擾作用的發(fā)現(xiàn) RNA干擾 與先前所說的 轉(zhuǎn)錄后基因沉默 、 轉(zhuǎn)基因沉默 等術(shù)語都是一回事 , 但常與基因表達的 反義抑制 相混淆 。 反義抑制過程并不涉及 mRNA的催化降解 , 只是單鏈反義 RNA物理上與 mRNA結(jié)合并阻斷其翻譯 。Andrew Fire 和 Craig Mello因他們關(guān)于線蟲 RNA干擾的研究( 1998) 而分享 2022年的諾 貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎。 1F 真核生物 sRNA介導(dǎo)的 RNA干擾 b RNA干擾的作用機理 外源性的 雙鏈 RNA, 不管來自病毒 RNA基因組的感染還是人工的導(dǎo)入 , 均在細胞質(zhì)中被 Dicer酶 裁剪成 2025bp的 短小雙鏈片段 , 即 small interfering RNA( siRNA) , 其 3’ 端含有兩個凸出的堿基 ,負責(zé) siRNA的遷移和對靶序列的識別 。 在 RISC復(fù)合物的協(xié)助下 , 雙鏈 siRNA拆成單鏈 , 然后再與具有互補序列的靶 mRNA分子結(jié)合 , 形成局部雙鏈 。 后者或遭 RNase的降解 , 或直接阻斷靶 mRNA的翻譯 1F 真核生物 sRNA介導(dǎo)的 RNA干擾 c 細胞內(nèi)固有的 miRNA 前已述及 , siRNA是由 體外來源 的雙鏈 RNA經(jīng)細胞內(nèi)的 Dicer酶加工 的 sRNA被命名為: microRNA( miRNA)。 進一步的探索發(fā)現(xiàn): 在動物 、 植物 、 真菌的細胞核內(nèi) , 從結(jié)構(gòu)致密的 異染色質(zhì) 中心粒區(qū)域的 DNA重復(fù)序列上會轉(zhuǎn)錄出一些特殊的 RNA前體大分子 , 它們同樣在類似蛋白因子的作用下 , 形成長度為 2123個堿基的單鏈 sRNA分子 , 并發(fā)揮特殊的生物學(xué)功能 。 這種細胞內(nèi)編碼的固有 而成的。那么細胞內(nèi)是否也存在著固有的 RNA類似物呢? 抑制基因的表達 , 即類似于由 siRNA介導(dǎo)的 RNA干擾作用 關(guān)閉特定靶基因的轉(zhuǎn)錄 , 使之沉默 編輯 、 刪除 、 修飾含有靶基因的某些 DNA區(qū)域 控制染色質(zhì)的緊密程度 , 維持細胞的正常分裂 調(diào)節(jié)干細胞的定向分化 1F 真核生物 sRNA介導(dǎo)的 RNA干擾 c 細胞內(nèi)固有的 miRNA miRNA的生物功能 miRNA的形成 首先從異染色質(zhì)中心粒區(qū)域的 DNA重復(fù)序列上轉(zhuǎn)錄出大分子的非編碼型 RNA前體 ( primiRNA) , 后者在核內(nèi)被 微加工器復(fù)合物 ( 由 RNaseIII組成 ) 先切成大約 70個核苷酸的莖環(huán)結(jié)構(gòu) ( premiRNA) ,然后再被運輸?shù)郊毎|(zhì)中由 Dicer進一步裁剪 , 形成成熟的 miRNA分子 , 最后再由幾種因子裝配而成 。 1F 真核生物 sRNA介導(dǎo)的 RNA干擾 d RNA干擾原理的應(yīng)用 如果將外源的雙鏈 RNA導(dǎo)入細胞中 , 則雙鏈 RNA分子一方面在 Dicer的作用下裂解成 siRNA; 另一方面在以 RNA為模板的 RNA聚合酶 RdRP的作用下自身擴增 , 其擴增產(chǎn)物再被 Dicer裂解成 siRNA。 后者 解鏈并與 RISC復(fù)合物一起作用于靶 mRNA上 , 一方面使其降解 , 另一方面又以 siRNA作為引物 , mRNA為模板 , 在 RdRP催化下合成出mRNA的互補鏈 , 結(jié)果 mRNA也變成了雙鏈 RNA。 它在 Dicer的作用下也同樣被裂解成siRNA。 通過這種體內(nèi)的 RNA聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) , 細胞內(nèi)的 siRNA大大增加 , 顯著增加了對基因表達的抑制 。 相關(guān)研究結(jié)果表明 , 從 2123個堿基的 siRNA到幾百堿基對的雙鏈 RNA都能誘發(fā) RNA干擾作用 , 但長的雙鏈 RNA阻斷基因表達的效果明顯優(yōu)于短的雙 鏈 RNA。 1F 真核生物 sRNA介導(dǎo)的 RNA干擾 d RNA干預(yù)原理的應(yīng)用 上述 RNA干擾原理在分子生物學(xué)研究領(lǐng)域中的用途包括: 通過基因表達的特異性阻斷作用,確定基因的功能 通過基因表達的特異性阻斷作用,實施基因治療 然而,如何將特定的雙鏈 RNA分子高效導(dǎo)入活細胞、活組織、活生物個體中,并維持其穩(wěn)定性,目前還是一個技術(shù)難題。 1G 真核 生物應(yīng)答元件的轉(zhuǎn)錄調(diào)控 a 真核 生物轉(zhuǎn)錄的應(yīng)答調(diào)控模型 結(jié)構(gòu)基因 應(yīng)答元件 轉(zhuǎn)錄起始子 啟動子 轉(zhuǎn)錄啟動 信號分子 轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子 真核生物應(yīng)答調(diào)控模型 金屬硫蛋白基因調(diào)控區(qū)的單基因多應(yīng)答元件模型: 熱休克蛋白基因調(diào)控區(qū)的多基因單應(yīng)答元件模型: E HSE P GENE A E HSE P GENE B 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 220 240 GRE BLE MRE MRE BLE TRE BLE MRE GC MRE TATA SR AP2 AP2 AP1 SP1 MTF1 RNA Pol 1G 真核 生物應(yīng)答元件的轉(zhuǎn)錄調(diào)控 b 真核 生物應(yīng)答元件的基本特征 DNA序列(順式元件) 含有較短的保守序列 位于啟動子或增強子的上游或在其內(nèi)部 與轉(zhuǎn)錄起始位點距離不固定,一般在 200bp內(nèi) 對相應(yīng)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子產(chǎn)生應(yīng)答反應(yīng) 真核生物細胞中常見的應(yīng)答元件 熱休克應(yīng)答元件 HSE CNNGAANNTCCNNG HSTF 腎上腺皮質(zhì)激素應(yīng)答元件 GRE TGGTACAAATGTTCT GR 佛波醇應(yīng)答元件 TRE TGACTCA AP1 血清應(yīng)答元件 SRE CCATATTAGG SRF 應(yīng)答元件 元件簡稱 保守序列 作用因子 金屬應(yīng)答元件 MRE TGCPuCNC MTF1 1G 真核 生物應(yīng)答元件的轉(zhuǎn)錄調(diào)控 c 轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的作用機制 與 DNA應(yīng)答元件結(jié)合 激活啟動子和 RNA聚合酶復(fù)合物 DNA 轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域 AD DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域 BD RNA Pol 復(fù)合物 轉(zhuǎn)錄起始位點 TATA BOX 與基因轉(zhuǎn)錄物結(jié)合 促進轉(zhuǎn)錄速度加快 DNA 轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域 AD RNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域 BD 轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物 轉(zhuǎn)錄起始位點 RNA 正在轉(zhuǎn)錄的 RNA聚合酶 1G 真核 生物應(yīng)答元件的轉(zhuǎn)錄調(diào)控 d 轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的激活方式 無蛋白 蛋白表達 異位同型蛋白 HB 脫磷酸化 磷酸化 熱休克轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子 HSTF 磷酸化 脫磷酸化 轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子 AP1 Jun/Fos 無配體 配體結(jié)合 甾體激素受體 GR 類別 無活條件 激活條件 轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子 抑制劑 去抑制劑 NFkB 抑制劑 IkB 構(gòu)象 A 構(gòu)象 B MyoD/ID 更換亞基 1 2 3 4 5 6
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