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pcr的定義、歷史與運(yùn)用-資料下載頁(yè)

2025-06-21 13:03本頁(yè)面
  

【正文】 增產(chǎn)物或重組質(zhì)粒污染。 (五)RSPCR法(RNAspecificPCR) 也稱為鏈特異性PCR,主要指用于 RNA模板的特異性PCR法,該法可明顯降低假陽(yáng)性而不影響PCR的敏感性。其關(guān)鍵在于設(shè)計(jì)引物,逆轉(zhuǎn)錄引物的3ˊ端(A區(qū))有20個(gè)核苷酸左右為模板的特異性互不序列,5ˊ端20個(gè)核苷酸(C區(qū))為附加修飾堿基。與mRNA逆轉(zhuǎn)錄后,經(jīng)超速離心使cDNA與多余引物分開(kāi),再用和第二引物(C)以第一鏈cDNA為模板合成第二鏈cDNA,以后的PCR循環(huán)中用逆轉(zhuǎn)錄引物的B區(qū)和引物C進(jìn)行擴(kuò)增加尾cDNA,而污染的DNA或質(zhì)粒DNA才不會(huì)被擴(kuò)增。 (六)抗污染引物法 該對(duì)引物擴(kuò)增時(shí)通過(guò)病毒DNA克隆如入質(zhì)粒的位點(diǎn)。這一區(qū)域只存在完整的原病毒中,在重組質(zhì)粒中,這一區(qū)域分成兩個(gè)區(qū)域與克隆位點(diǎn)被。如果重組質(zhì)粒污染了標(biāo)本,也不能擴(kuò)增出任何條帶,即使出現(xiàn)了擴(kuò)增帶,其大小也與預(yù)期的不同。只有原病毒DNA才能被引物擴(kuò)增,因此只要出現(xiàn)預(yù)期大小的擴(kuò)增帶就可以證明標(biāo)本是陽(yáng)性的,該法試用于環(huán)狀靶分子系列。 四.其它PCR檢測(cè)方法: (一)兩步法:是指在用套式 PCR方法擴(kuò)增某些含量低微的標(biāo)本時(shí),兩對(duì)引物在同一個(gè)管中以簡(jiǎn)化步驟,減少污染。通常第一步進(jìn)行2025個(gè)循環(huán),擴(kuò)增外引物片段;第二步再進(jìn)行10個(gè)循環(huán),擴(kuò)增內(nèi)引物片段。兩步法對(duì)內(nèi)外引物的Tm值有特殊要求,即內(nèi)外引物的退火溫度高(如68℃),在此溫度下內(nèi)引物不與模板退火,然后降低退火溫度(至 55℃)再擴(kuò)增內(nèi)引物片段,這樣,在操作過(guò)程中,僅打開(kāi)PCR反應(yīng)管一次,大大減少了污染的可能性。(二)熒光法:亦稱熒光PCR技術(shù)(fluoresencePCR,FPCR),是1995年由美國(guó)PE公司首先研制成功的,它融匯了 PCR的靈敏性、DNA雜交的特異性和光譜技術(shù)精確定量的優(yōu)點(diǎn),電腦同步跟蹤,數(shù)據(jù)自動(dòng)化處理,直接探測(cè)PCR過(guò)程中的變化以獲得定量的結(jié)果,不需要做 PCR后處理或檢測(cè),完全閉管操作。探針標(biāo)記除用TET和FAM外,還可用HEX、JOE作為報(bào)告熒光,3′端的淬滅基團(tuán)常用TAMRA。在探針保持完整時(shí),熒光報(bào)告基團(tuán)的熒光被熒光抑制基團(tuán)淬滅,而在探針被切斷后,熒光報(bào)告基團(tuán)才發(fā)出報(bào)告熒光,且熒光的強(qiáng)度與PCR產(chǎn)物的數(shù)量呈正比。熒光檢測(cè)儀器透過(guò) PCR管壁能直接檢測(cè)到熒光信號(hào)的波長(zhǎng)和長(zhǎng)度變化。 主要有以下優(yōu)點(diǎn): ,假陽(yáng)性率低; ,不需要 PCR后處理; ,HBV(102106Dane′sparticle/ml); 4. 閉管操作,PCR產(chǎn)物污染少; 。 主要方法有: 1..熒光探針?lè)ǎ哼M(jìn)行熒光PCR檢測(cè)時(shí),要求熒光探針必須完全與靶基因互補(bǔ),長(zhǎng)度以2030個(gè)堿基為宜,必要時(shí)3′端磷酸化封閉,以防在擴(kuò)增時(shí)作為引物延伸。該方法利用Taq酶的3′→5′聚合酶活性及5′→3′ 外切酶活性,可以在鏈延伸過(guò)程中實(shí)現(xiàn)鏈替換,并將被替換的探針切斷,故可進(jìn)行定性與定量檢測(cè)。 熒光探針5′端標(biāo)記的TAMRA,在480nm 激發(fā)下產(chǎn)生530nm的紅色熒光;3′端標(biāo)記的FAM,激發(fā)后產(chǎn)生綠色熒光。PE公司推出的TaqMan系統(tǒng),即采用雙熒光探針,如配合使用PCR擴(kuò)增與熒光檢測(cè)合二為一的儀器,可進(jìn)行實(shí)時(shí)(realtime)定量檢測(cè)。 2.分子信標(biāo)法:分子信標(biāo)(molecularbeacon)是一個(gè)發(fā)夾樣結(jié)構(gòu)的特異探針,其環(huán)狀部分與靶序列互補(bǔ)。在室溫時(shí),分子信標(biāo)的發(fā)夾緊閉,熒光淬滅。PCR擴(kuò)增時(shí),隨著溫度升高,發(fā)夾松開(kāi),與單鏈模板特異結(jié)合,發(fā)出熒光。熒光強(qiáng)度與模板呈正比,故可用于PCR產(chǎn)物的定性及定量。 總之,人類在邁入廿一世紀(jì)中即將出現(xiàn)若干的突破,生物醫(yī)學(xué)便是其中重要的一項(xiàng)。在過(guò)去三、四十年耒,像PCR這樣影響深遠(yuǎn)的技術(shù)實(shí)在很難找到。它的震撼,除了眾多的得獎(jiǎng)外(包括諾貝爾獎(jiǎng)),更在于它的可塑性、修飾性及全方位的運(yùn)用。未來(lái)的生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中,它也必定繼續(xù)扮演舉足輕重的角色。7 /
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