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核酸分離檢測ppt課件-資料下載頁

2025-05-02 18:41本頁面
  

【正文】 結(jié)果 取材 新鮮組織 、 細(xì)胞;盡快冷凍或固定 雜交前所有用具 RNase free 固定 ? 目的:保持細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu) , 最大限度地保存細(xì)胞內(nèi) RNA水平;使探針易于進(jìn)入細(xì)胞或組織 。 ? 最常用多聚甲醛 ( 4%) 固定組織 , 因其不會與蛋白質(zhì)產(chǎn)生廣泛的交叉連接 , 不會影響探針穿透入細(xì)胞或組織 。 ? 醋酸 、 酒精的混合液和 Bouin′s固定劑 包埋、切片 ? 石蠟切片:固定組織用 PBS沖洗后 , 經(jīng)梯度酒精脫水 、 二甲苯透明和浸蠟包埋切片 。 ? 冰凍切片:組織固定后 , 30%蔗糖處理過夜 , OCT包埋 、 切片 , 80 ℃ 保存?zhèn)溆?。 OCToptimum cutting temperature pound ?聚乙二醇和聚乙烯醇的水溶性混合物 ?在冰凍切片時支撐組織,以增加組織的連續(xù)性,減少皺折及碎裂。 ?漂片時可溶于水,不增加背景染色。 全自動脫水機( Tissue Prosessing) 石蠟組織包埋機( Embedding) 包埋用具 包埋后的組織蠟塊 石蠟切片機( Microtome) 展片機 冰凍切片機 ( Cyrostat) 探針的制備 ?特異性 cDNA探針: 制備困難 ?cRNA探針: 以 cDNA為模板,體外轉(zhuǎn)錄獲得,單鏈探針, cRNA- RNA雜交體穩(wěn)定; RNase敏感 ?人工合成寡核苷酸探針 : DNA合成儀合成,不需要純化,組織穿透性極好;長短控制,過長 ——錯配,過短 —— 特異性差 ?探針長度:< 500堿基 探針標(biāo)記方法 ?末端標(biāo)記法: 將標(biāo)記物導(dǎo)入線型 RNA的 5’端或 3’端,適用于合成寡核苷酸探針的標(biāo)記,一般攜帶的標(biāo)記分子較少。 ?體外轉(zhuǎn)錄法: 模板 —— 線性化質(zhì)粒 DNA/PCR產(chǎn)物(含 T T3或 SP6啟動子), RNA聚合酶, NTP(一種標(biāo)記帶標(biāo)記)所有的 RNA就被標(biāo)記。 末端標(biāo)記法 堿性磷酸酶 T4多聚核苷酸激酶 ? T4 多核苷酸激酶是一種磷酸化酶,可將 ATP 的 g磷酸基轉(zhuǎn)移至 DNA 或 RNA 的 539。 末端。 體外轉(zhuǎn)錄基因克隆載體 體外轉(zhuǎn)錄標(biāo)記 標(biāo)記物 ?同位素 ?非同位素標(biāo)記技術(shù)有生物素、地高辛、堿性磷酸酶、辣根過氧化酶和熒光素 —— 直接標(biāo)記、間接標(biāo)記 地高辛標(biāo)記技術(shù) ? Digoxigenin ( DIG),源于從洋地黃類植物中提取的類固醇。洋地黃花和葉片為 Digoxigenin在自然界中的唯一來源,抗 DIG的抗體不會與其他的生物物質(zhì)結(jié)合,高特異性。 ? 靈敏度高。 DIG檢測靈敏度接近同位素而無放射性危險、相比熒光則不需要特殊檢測設(shè)備,相比生物素則沒有樣本內(nèi)源干擾之苦。 地高辛的結(jié)構(gòu) Structure of Alkaliliable Digoxigenin(DIG)dUTP AP(堿性磷酸酶)標(biāo)記抗 DIG抗體檢測 堿性磷酸酶顯色試劑 ? BCIP/NBT ? BCIP (5Bromo4chloro3indolyl phosphate) 5溴 4氯 3吲哚基 磷酸鹽+ NBT (四唑硝基藍(lán) ) 是堿性磷酸酶最佳的底物組合之一。 ? 在堿性磷酸酶的催化下, BCIP會被水解而產(chǎn)生強反應(yīng)性的產(chǎn)物,該產(chǎn)物與 NBT發(fā)生反應(yīng),形成不溶性的深藍(lán)色至藍(lán)紫色化合物。 相關(guān)設(shè)備 雜交爐 雜交 ?脫蠟 :二甲苯脫蠟 ,逐級梯度酒精 (100%、 95%、90%、 80%、 70%)清洗,蒸餾水洗。 ?固定 ?通透 :蛋白酶(蛋白酶 K/proteinase K,鏈霉蛋白酶 /pronase和胃蛋白酶 /pepsin)消化包圍靶 RNA的蛋白質(zhì),促進(jìn)探針滲透,提高雜交信號。過度消化引起細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu)的破壞、靶核酸的減少、導(dǎo)致標(biāo)本從載玻片上的脫落。 ?再固定 ?酸酐處理:防止探針與組織中堿性蛋白之間的靜電結(jié)合,以降低背景 ?脫水 ?預(yù)雜交 :阻斷玻片和標(biāo)本與探針的非特異性結(jié)合減低背景 ?雜交:探針變性,過夜,溫度、濕度 ?洗滌: SSC緩沖液洗除未雜交探針 ?顯色:抗體( antidigap—— 堿性磷酸酶)孵育,底物顯色;復(fù)燃(蘇木精、快綠) ?脫水、封片
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