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第三章核酸技術(shù)-資料下載頁

2024-10-24 14:44本頁面

【導(dǎo)讀】核酸的分離和純化。DNA限制酶切反應(yīng)和限制酶譜繪制。分離總DNA分離細(xì)胞器分離總RNA. 感染或轉(zhuǎn)染細(xì)胞(病毒型)轉(zhuǎn)化細(xì)菌細(xì)胞(質(zhì)粒型)。分離病毒顆粒培養(yǎng)轉(zhuǎn)化細(xì)胞、收集菌體。2)光密度值測定。利用某些細(xì)胞壁裂解酶使細(xì)胞變?yōu)樵|(zhì)體,然后加去垢劑。使原生質(zhì)體裂解。2)酵母:蝸牛酶、Novozyme234、glusulase、zymolase等。足酶的最佳反應(yīng)條件。淀物用70%冷乙醇洗滌,干燥溶于緩沖液加入RNAase處理。CsCl法操作步驟少,分離DNA分子量大,耗財(cái)多,且需超速。苯酚法耗時(shí)少,不需昂貴儀器,但操作步驟多,易使DNA分。若小心操作,所獲DNA亦符合要求。分離線粒體DNase除去細(xì)胞器外DNA加入EDTA使。仍保持環(huán)狀結(jié)構(gòu),當(dāng)變性條件發(fā)生迅速變化時(shí),前者仍不能復(fù)性,變性條件可采用加熱煮沸法或堿變性法。上述方法亦可用于ss環(huán)狀病毒DNARF型的分離,質(zhì)粒DNA的氯霉。ii.核糖體大小分級(jí)分離,利用連續(xù)密度梯度分離特大和特小的。用高純度的抗體,不能發(fā)生交叉反應(yīng)和污染核酸酶。2)核酸序列分級(jí)分離

  

【正文】 個(gè)或多個(gè)交變電場 , 使 2003000 kb的 DNA分子發(fā)生分離 , 其電極排列可以是雙向非均勻 , 單向非均勻等 。 脈沖場凝膠電泳原理圖 北 南 脈沖場電泳 常規(guī)電泳 兩組電極,排列不均勻 。 一組電極,電場方向不變,電極排列均勻, 定時(shí)改變電場方向, DNA分子的凈 DNA移動(dòng)方向與電場方向相同。整個(gè)電泳 移動(dòng)方向與兩電場呈 45o,在電泳過 過程保持電壓穩(wěn)定。常規(guī)方法制備 DNA 程中,電壓有時(shí)可隨時(shí)間的增加而樣 品增加, 制備 DNA樣品與常規(guī)方法 不同 2. 場倒置凝膠電泳( FIGE) 利用常規(guī)電泳槽進(jìn)行電泳,但電場方向則是周期性地發(fā)生倒置,其正向和反向的脈沖時(shí)間長度之比為 3或其它比值。該法可使 15700 Kb或以上的 DNA分子發(fā)生分離。 為了克服同移動(dòng)現(xiàn)象產(chǎn)生(即不同大小 DNA分子一起移動(dòng)),可以采用 轉(zhuǎn)換時(shí)間遞增法 ( swichinginterval ramps) , 即由電泳開始時(shí)的短脈沖時(shí)間逐漸遞增到電泳結(jié)束時(shí)的長脈沖時(shí)間。如開始時(shí)為 60: 20,結(jié)束時(shí)可為 180: 60。 上述兩種方法也可聯(lián)合使用,使一些很難分開的大分子 DNA分離。 3. CHEF(ContourClamped Homogeneous Electric Fields) 動(dòng)態(tài)調(diào)控閉合均一電場電泳 場倒置電泳 CHEF(動(dòng)態(tài)調(diào)控閉合均一電場電泳 ) 各種脈沖場凝膠電泳技術(shù)的比較 方法 染色體帶 最大帶 最小帶 動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié) 直道 均勻電場 液體樣品 機(jī)械轉(zhuǎn)換 CHEF 15 12020kb 88 bp 是 是 是 是 不 OFAGE 13 9000kb 5000 bp 不 不 不 是 不 TAFE 13 9000kb 2020 bp 不 是 不 不 不 FIGE 11 2020kb 200 bp 不 是 是 是 不 RFGE 15 ? 202000 bp 不 是 是 不 是 三.影響染色體 DNA電泳的主要因素 1.染色體的結(jié)構(gòu) 2.電泳槽電極的構(gòu)型 3.電壓:它與脈沖時(shí)間成反比 4.脈沖時(shí)間 : 經(jīng)過實(shí)驗(yàn)選擇適合于某種生物染色體 DNA完 全分離的最佳脈沖時(shí)間 5.其它因素 :溫度,離子強(qiáng)度等 四.染色體 DNA樣品的制備 染色體 DNA電泳的關(guān)鍵之一是獲得完整的 DNA分子,其制備方法有: 1.固體塊法 細(xì)胞培養(yǎng),收集,洗滌,細(xì)胞懸液 與細(xì)胞壁裂解酶液和低熔點(diǎn)瓊脂糖凝膠混合 倒平板 復(fù)蓋裂解酶緩沖液 細(xì)胞壁裂解過夜 除去緩沖液 加入去污劑和蛋白酶 K 反應(yīng)過夜 換 , 4℃ 保存 2.微球法 制備細(xì)胞懸液 與石蠟油和低熔點(diǎn)瓊脂糖凝膠迅速混合,形成小球 冰浴迅速冷卻 離心,洗滌 加入原生質(zhì)體形成液, 37℃ 反應(yīng)至細(xì)胞壁裂解 加入裂解液 50℃ 1 h 離心,小球保存于 EDTA, 4℃ 3.加樣 切一小塊樣品凝膠塊或吸取適量微球,置于電泳用凝膠塊的樣品孔中,用少許低熔點(diǎn)瓊脂糖凝膠使樣品與整塊凝膠為一體,每一樣品孔應(yīng)含 DNA樣品 4. 限制酶切 加樣前取適量樣品 , 置于 EP管中 , 加限制酶緩沖液和限制酶進(jìn)行酶切 五.染色體 DNA電泳的用途 1. 測定染色體數(shù)目 :特別適合于低等真核生物 2. 測定基因連鎖關(guān)系 :結(jié)合 DNA雜交技術(shù),可適合于各種生物 3. 染色體 DNA重排分析 1)酵母細(xì)胞經(jīng) X射線照射,染色體發(fā)生斷裂,可得彌散型。 但讓其修復(fù)后,又可形成帶,但有的發(fā)生了重排,導(dǎo)致 帶型變化 2)非洲錐蟲:變異表面糖蛋白基因的表達(dá) 4. 疾病的診斷 引起某種皮膚病的原生動(dòng)物 Leishmania, 具有其特征性的染色體。 PFG便可用于診斷。
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