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第十章微生物分類及鑒定幫助你理清基本概念,規(guī)律-資料下載頁

2025-04-07 04:00本頁面
  

【正文】 借助各種信息對這個進化樹進行改進。 網(wǎng)狀樹,基因的水平轉移用橫向樹枝代表,樹的基部有幾個樹干代表幾個形成最初基因庫的原始細胞組,代替了一個單一的主樹干或相同的祖先。6. 化學分類特征: (1). CW組分分析(目前主要應用于放線菌): 根據(jù)放線菌細胞壁的化學組成和全細胞水解液糖型,將放線菌CW分為9型。(2). 磷酸類脂類分析:CM上的磷酸類脂5型PE 磷酯酰乙醇胺PME 磷酯酰甲基乙醇胺PC 磷酯酰膽堿PG 磷酯酰甘油Glu Nu 含葡萄糖胺未知結構的磷酸類脂(3). 枝菌酸分析:諾卡氏型放線菌(CW IV型)細胞抽提物中高分子脂肪酸 β α R1CHCHCOOH 231。 231。 OH R2Nocardia 50個碳原子 諾卡氏枝菌酸Mycobacterium 80個碳原子 分枝桿菌枝菌酸Corynebacterium 30個碳原子 棒狀桿菌枝菌酸(4). 醌型分析: 114個異戊烯單位不等, 多烯鏈上氫的飽和度不等甲基萘醌: MK9, MK9(H2), MK10(H4)三. 微生物的快速鑒定和自動化分析技術1. 微量多項試驗鑒定系統(tǒng)(簡易診檢技術,數(shù)碼分類鑒定法)針對微生物的生理生化特征,配制各種培養(yǎng)基、反應底物、試劑等,分別微量()加入各個分隔室中(或用小圓紙片吸收),冷凍干燥脫水或不干燥脫水,各分隔室在同一塑料條或板上構成檢測卡。試驗時加入待檢測的某一種菌液,培養(yǎng)248小時,觀察鑒定卡上各項反應,按判定表判定試驗結果,用此結果編碼,查檢索表(根據(jù)數(shù)碼分類鑒定的原理編制成),得到鑒定結果,或將編碼輸入計算機,用根據(jù)數(shù)碼分類鑒定原理編制的軟件鑒定,打印出結果。Microbial ID/Characterization(Carbon source metabolic fingerprints)The Biolog Systems can rapidly identify over 1,900 species of aerobic and anaerobic bacteria, yeasts, and fungi. 2. 數(shù)值分類(numerical taxonomy)(1). 數(shù)值分類法:通過廣泛比較分類單位的性狀特征,然后計算它們之間的相似性,再根據(jù)相似性的數(shù)值劃分類群的一種分類方法。取代等級分類中特征對于分類的不同水平,數(shù)值分類在對于所有的特征都等量處理的基礎上,進行生物之間的相似性的比較。 (2). 數(shù)值分類五個步驟:①確定分類單位和選擇分類特征。數(shù)值分類最低等級的分 類單位稱操作分類單位(OUT, operational taxonomic unit),OTU可以是菌株, 也可以是種或屬等。OTU確定后即選擇分類特征,數(shù)值分類要求特征函蓋面廣, 數(shù)目多(50100以上)。②進行特征測定或從文獻中收集有關OTU的各項特征的資料;③根據(jù)所編制的計算機程序要求,將特征資料進行編碼、標準化并輸入計算機;④由計算機計算各OTU之間的相似性并根據(jù)相似性的數(shù)值進行聚類分析、分群歸類;⑤輸出分類結果。樹狀譜圖法.(3) 數(shù)值分類的比較方法:匹配系數(shù)方法(matching coefficient method)相似系數(shù)方法(similarity coefficient method) 匹配系數(shù)對于2個比較菌株都是陽性或都是陰性的特征計算在內,而相似系數(shù)不計算2個比較菌株都是陰性的特征,該方法認為如果對于2個比較菌株而言,都是陰性的特征根本就是不合適的比較特征。大量的數(shù)值分類系統(tǒng)采用相似系數(shù)方法。(4).數(shù)值分類的優(yōu)點和局限:? 存貯、分析、處理極為錯綜復雜的龐大數(shù)據(jù)。? 自動輸出鑒定結果。? 工作效率高。? 奠定了微生物鑒定的快速、準確、自動化的基礎。? 局限: 計算機用于微生物鑒定嚴格說目前應是輔助鑒定,因為它不能代替人進行微生物特征的試驗,而取得原始數(shù)據(jù)資料。8 / 8
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