微生物的分類鑒定及命名-資料下載頁
2025-01-18 01:29本頁面
【正文】 NA的堿基 組成的比較和進(jìn)行核酸分子雜交是直接比較不同微 生物之間 基因組 的差異，因此結(jié)果更加可信。 (1) DNA的堿基組成 (G+Cmol%) DNA堿基因組成是各種生物一個穩(wěn)定的特征，即使個別基因突變，堿基組成也不會發(fā)生明顯變化。 分類學(xué)上，用 “ G+C”占全部堿基物質(zhì)的摩爾百分?jǐn)?shù)(G+Cmol%)來表示各類生物的 DNA堿基因組成特征。 ◆ 每個生物種都有特定的 GC%范圍，因此后者可以作為分類鑒定的指標(biāo)。細(xì)菌的 GC%范圍為 2575%，變化范圍最大，因此更適合于細(xì)菌的分類鑒定。 ◆ GC%測定主要用于對表型特征難區(qū)分的細(xì)菌作出鑒定，并可檢驗表型特征分類的合理性，從分子水平上判斷物種的親緣關(guān)系。 使用原則： 每一種生物都有一定的堿基組成，親緣關(guān)系近的生物，它們應(yīng)該具有相似的 GC%含量；若不同生物之間 GC%含量差別很大，表明它們親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。 但具有相似 GC%含量的生物，卻并不一定表明它們之間具有近的親緣關(guān)系。 在疑難菌株鑒定、新種命名、建立一個新的分類單位時， GC%含量是一項重要的、必不可少的鑒定指標(biāo)。 同一個種內(nèi) 的不同菌株 GC%含量差別應(yīng)在 4～ 5%以下 ；同屬 不同種的差別應(yīng)低于 10～ 15%； GC%含量已經(jīng)作為建立新的微生物分類單元的一項基本特征指標(biāo)，它對于種、屬甚至科的分類鑒定有重要意義。 若 2個在形態(tài)及生理生化特性方面極其相似的菌株， 如果其 GC%含量的 差別大于 5%，則肯定不是同一個種，大于 15%則肯定不是同一個屬。 其分類學(xué)意義主要是作為建立新分類單元的一項基本特征和把那些 GC%含量差別大的種類排除出某一分類單元。 G+C%含量的比較主要用于分類鑒定中的 “ 否定 ” (2) 核酸的分子雜交 不同生物 DNA堿基排列順序的異同直接反映生物之間親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近，堿基排列順序差異越小，它們之間的親緣關(guān)系就越近，反之亦然。 核酸分子雜交 (hybridization)—— 間接比較不同微生物 DNA堿基排列順序 的相似性 a） DNADNA雜交； （親緣關(guān)系相對近的微生物之間的親緣關(guān)系比較 ） b） DNArRNA雜交； （親緣關(guān)系相對遠(yuǎn)的微生物之間的親緣關(guān)系比較） c）核酸探針； （利用特異性的探針，用于細(xì)菌等的快速鑒定） (3) 16SrRNA或 18SrRNA的核酸序列分析 16SrRNA被普遍公認(rèn)為是一把好的譜系分析的 “ 分子尺 ” ： 16SrRNA的序列高度保守，可精確指示細(xì)菌之間的親緣關(guān)系 16SrRNA的大小為 1540bp左右，所含信息能反映生物界進(jìn)化關(guān)系，易操作，適用于各級分類單元 目前常用的是建立在 PCR技術(shù)基礎(chǔ)上的 16SrRNA基因的直接測序法，方便快捷。 菌種鑒定工作三部曲 獲得該微生物的純培養(yǎng) 測定一系列必要的鑒定指標(biāo) 查找權(quán)威性鑒定手冊 微生物分類系統(tǒng) 《 伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊 》 (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology) 美國賓夕法尼亞大學(xué)的細(xì)菌學(xué)教授伯杰 ()(18601937) 1957年第七版后，由于越來越廣泛地吸收了國際上細(xì)菌分類學(xué)家參加編寫 (如 1974年第八版，撰稿人多達(dá) 130多位，涉及 15個國家；現(xiàn)行版本撰稿人多達(dá) 300多人，涉及近 20個國家 )，所以它的近代版本反映了出版年代細(xì)菌分類學(xué)的最新成果，因而逐漸確立了在國際上對細(xì)菌進(jìn)行全面分類的權(quán)威地位。 細(xì)菌分類系統(tǒng) 《 伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊 》 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology) 伯杰氏手冊是目前進(jìn)行細(xì)菌分類、鑒定的最重要依據(jù)，其特點(diǎn)是描述非常詳細(xì)，包括對細(xì)菌各個屬種的特征及進(jìn)行鑒定所需做的實驗的具體方法。 （ 20世紀(jì) 80年代末期） 真菌分類系統(tǒng) 真菌界分類系統(tǒng)很多，各國采用不同的系統(tǒng)，比較混亂。近年來為較多人接受的是 Ainsworth的綱要。
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