常見(jiàn)的生物信息學(xué)軟件的介紹和文獻(xiàn)依據(jù)-資料下載頁(yè)
2025-04-07 03:26本頁(yè)面
【正文】 y2使用Python方便地調(diào)用Bioconductor處理注釋數(shù)據(jù)，微陣列數(shù)據(jù)和下一代測(cè)序數(shù)據(jù)21210978RseqFlowRNASeq數(shù)據(jù)分析流程21795323Ruffus一個(gè)輕量級(jí)的計(jì)算流程繪制Python庫(kù)20847218SMART一個(gè)輔助RNAseq數(shù)據(jù)分析軟件工具箱21998740SAMStat下一代測(cè)序比對(duì)SAM文件結(jié)果統(tǒng)計(jì)，監(jiān)測(cè)下一代測(cè)序數(shù)據(jù)中的偏差21088025SAMtools處理序列比對(duì)結(jié)果SAM格式的軟件19505943SBML2LaTeX將SBML文件轉(zhuǎn)換為人類(lèi)可讀的報(bào)告19307240segemehl重亞硫酸鹽處理的測(cè)序數(shù)據(jù)的快速且敏感的比對(duì)22581174Sequence to Structure從序列到結(jié)構(gòu)顯示、操作和互相連接RNA數(shù)據(jù)15905274Sfixem用Java進(jìn)行圖形化序列特征展示15087316ShortRead一個(gè)對(duì)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行輸入，質(zhì)量評(píng)估和瀏覽的Bioconductor包19654119SICER一種識(shí)別來(lái)自組蛋白修飾ChIPSeq數(shù)據(jù)富集區(qū)域的聚類(lèi)方法19505939sigterms鏈接基因表達(dá)譜結(jié)果和microRNA靶點(diǎn)預(yù)測(cè)公共數(shù)據(jù)庫(kù)18812437Simrank快速且敏感的通用kmer搜索工具21524302SOAP短寡核苷酸比對(duì)程序18227114SOAP2一個(gè)改進(jìn)的超快的短片段比對(duì)工具（SOAP改進(jìn)版），更快，更少內(nèi)存使用19497933SOAP3超快的基于GPU的短片段并行比對(duì)工具22285832SpotXplore在基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中進(jìn)行熱點(diǎn)（差異表達(dá)子網(wǎng)絡(luò)）表達(dá)的可視化探索20861033StampyIllumina測(cè)序片段的敏感且快速比對(duì)20980556STE瀏覽系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)和進(jìn)化枝的交互式可視化軟件18263642STEM一個(gè)短時(shí)間序列基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析工具16597342STELLAR快速且準(zhǔn)確的局部比對(duì)22151882SVA序列變異分析器：注釋和可視化測(cè)序的人類(lèi)基因組21624899TPIC基于形狀的ChIPSeq峰識(shí)別21226895tacg一個(gè)適用于DNA的模式匹配軟件11882250Tabix從通用TAB分割的文件中快速檢索序列特征21208982Tablet下一代序列裝配可視化工具19965881TabSQL基于MySQL的應(yīng)用工具，查看、過(guò)濾和查詢(xún)多行數(shù)據(jù)文件，并連接到公共數(shù)據(jù)庫(kù)20573251TileQC基于tile的Solexa數(shù)據(jù)質(zhì)控系統(tǒng)18507856TileShuffle嵌合陣列數(shù)據(jù)中差異表達(dá)片段的檢測(cè)22492638TimeClust一個(gè)基因表達(dá)時(shí)間序列分析聚類(lèi)工具18065427TimeView高效比較和可視化來(lái)自微陣列實(shí)驗(yàn)的多個(gè)時(shí)間數(shù)據(jù)集（MATLAB)16539536Tmod整合12種motif發(fā)現(xiàn)程序?yàn)橐惑w的motif發(fā)現(xiàn)工具箱20007740TreeViewJ一個(gè)查看和分析系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)的應(yīng)用程序17974028Treevolution進(jìn)化樹(shù)的可視化分析19470585UMLSQuery查詢(xún)UMLS（統(tǒng)一醫(yī)學(xué)語(yǔ)言系統(tǒng)）的一個(gè)perl模塊18998805Unipro UGENE一個(gè)協(xié)助分子生物學(xué)家管理、分析和可視化數(shù)據(jù)的統(tǒng)一生物信息學(xué)工具包22368248uShuffle一個(gè)洗牌生物序列而保留klet計(jì)數(shù)的有用工具18405375VANTED一個(gè)在生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)背景中進(jìn)行高級(jí)數(shù)據(jù)分析和可視化的系統(tǒng)16519817VARNARNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的交互式繪制和編輯19398448VennDiagram一個(gè)高度可定制的文氏圖和歐拉圖生成R包21269502Velvet操作de Bruijn圖進(jìn)行從頭短序列基因組裝配18349386VennMaster廣義的文氏圖，一種可視化復(fù)雜遺傳集合關(guān)系的新方法15572472ViTO蛋白質(zhì)序列結(jié)構(gòu)比對(duì)精化工具15271783WordCloud一個(gè)創(chuàng)建網(wǎng)絡(luò)可視化語(yǔ)義概要的Cytoscape插件21473782XYLab一個(gè)混合多元數(shù)據(jù)觀(guān)察和解釋的交互式繪圖工具18795112Zerg一個(gè)非?？焖俚腂LAST解析器庫(kù)12761068ZFIQZFIQ（斑馬魚(yú)影像定量器）：一個(gè)斑馬魚(yú)生物學(xué)軟件包18089619ZOOM快速比對(duì)大量短片段到參考基因組18684737
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