分子模擬的原理及應(yīng)用-陳正隆-資料下載頁
2025-02-21 10:58本頁面
【正文】 用軟件 Material Studios Accelry Inc.北京創(chuàng)騰公司代理 PorphyrinAppended Cholesterol DerivativesTsutomu et al. Langmuir (2022) 17 58252:1 Zn(II) porphyrin/[60]fullerene Sandwich ComplexGelation Ability[60]F/5 5a 5b 5c 5dSolvent (mol/mol) 20oC 5oC 20oC 5oC 20oC 5oC 20oC 5oCBenzene S G S S S S S S G G S S G G S SToluene S G S S S S S S G G S S pG G S Spxylene S G S S S S S S G G S S S S S SS: solution, G: gel。 pG = partial gelF: fullerene。 S: solution, G: gel。 pG = partial gelEnergy Minimized resultDiscover 3/insight II bentextendedAmideappended PorphyrinsMichihiro Shirakawa, et al. J. AM. CHEM. SOC. 2022, 125, 9902amide1b should assemble, in the presence of C60, into the onedimensional array. 1b dimerizes by the Hbonding interactions, can form a circular Hbonding array according to the ?sheet motif and the inner space is exactly parable with the size of C60 化合物 1b 的模式1b Aggregation ModeMM result of 6 1b + 3 C60自組裝超分子 (Selfassembly Supramolecule)蘑菇形聚集體 (MushroomShaped Aggregates)Stupp, S. I.,et al, SCIENCE 276, 384 (1997) 桿狀 線狀 分子 (rodcoil)蘑菇形聚集體的 MM 計算 MM 計算的適用性 n 分子最低能量構(gòu)形 , 構(gòu)形能n 生成焓 , 反應(yīng)熱 , … 熱力學(xué)性質(zhì)n 振動光譜n 適用于大量的有機化合物 , 醣類 , 生化分子 , …n 部份無機錯化合物n ◎ 單一分子 , 氣態(tài)分子 , 低濃度液態(tài)分子 , 規(guī)則性晶體分子 , 小團(tuán)簇體。 ? MM 計算的限制 (limitation of MM) n MM 計算忽略環(huán)境對分子的影響 , 因此不適合復(fù)雜的體系 , 如高濃度的液態(tài)系統(tǒng) , 非晶相聚合物系統(tǒng)。n 分子過大時 (原子數(shù) 1000 ), 往往不容易求得最低能量構(gòu)形。n MM 計算的能量為 0 K 時分子的能量 , 往往與實驗的條件不一致。n MM 計算僅能獲得靜態(tài)的信息 , 無動態(tài)或統(tǒng)計的信息。
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