高通量測(cè)序在生物學(xué)的應(yīng)用-資料下載頁(yè)
2025-01-07 22:14本頁(yè)面
【正文】 ? 檢測(cè)到 28個(gè)煙酰胺乙酰膽堿受體相關(guān)的序列，分析共鑒定 9個(gè)不同的受體序列 從頭分析白粉虱轉(zhuǎn)錄組 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序生物信息學(xué)分析內(nèi)容 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果無(wú)參考序列 有參考序列數(shù)據(jù)產(chǎn)出及質(zhì)量評(píng)估 數(shù)據(jù)產(chǎn)出及與參考序列比對(duì)結(jié)果概述Co nti g 長(zhǎng)度分布Un i ge ne 注釋和 GO 分析蛋白功能預(yù)測(cè)及分類(lèi)Un i ge ne 代謝通路分析測(cè)序深度、覆蓋度及隨機(jī)性評(píng)估基因結(jié)構(gòu)、可變剪切及表達(dá)差異分析新基因預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果無(wú)參考序列 有參考序列數(shù)據(jù)產(chǎn)出及質(zhì)量評(píng)估 數(shù)據(jù)產(chǎn)出及與參考序列比對(duì)結(jié)果概述蛋白功能預(yù)測(cè)及分類(lèi)測(cè)序深度、覆蓋度及隨機(jī)性評(píng)估基因結(jié)構(gòu)、可變剪切及表達(dá)差異分析新基因預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序應(yīng)用領(lǐng)域 ?轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)研究： UTR鑒定、 Intron邊界鑒定、可變剪切研究、 Start codon鑒定等 ?基因轉(zhuǎn)錄水平研究 ?全新轉(zhuǎn)錄區(qū)域研究 ?Noncoding RNA研究 主要報(bào)告內(nèi)容 ?高通量測(cè)序簡(jiǎn)介 ?從頭測(cè)序及其應(yīng)用 ?重測(cè)序及其應(yīng)用 ?轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及其應(yīng)用 ?Small RNA測(cè)序及其應(yīng)用 miRNA是調(diào)控基因表達(dá)的一種普遍方式 ? 俄克拉荷馬州立大學(xué) ，生物化學(xué)與分子生物學(xué)系 ? 對(duì)逆境條件 干旱 、高鹽和正常條件下的水稻 4周幼苗進(jìn)行 miRNA測(cè)序 ? 三種處理分別得到 102,87 54,016 和 174,530 測(cè)序序列 ( 430080990和 58781個(gè) miRNAs) 利用高通量測(cè)序鑒定水稻 miRNA ? 目前水稻中公布的 miRNA家族為53個(gè)，鑒定了 23種新的 miRNA ? 6種新的 miRNA為單子葉植物特有的 miRNA ? 預(yù)測(cè)了 40個(gè)候選 miRNA 利用高通量測(cè)序技術(shù)鑒定水稻 miRNA 單子葉植物特有的 miRNA ? 預(yù)測(cè)了 9種新發(fā)現(xiàn) miRNA的 20個(gè)靶點(diǎn) ? 分析 miRNA的表達(dá)模式，發(fā)現(xiàn)特異性表達(dá)的 miRNA，而保守的 miRNA是最容易檢測(cè)到的 利用高通量測(cè)序技術(shù)鑒定水稻 miRNA ?山東農(nóng)科院 ?對(duì)正常培養(yǎng)兩周的花生苗的根、莖、葉進(jìn)行 small RNA分析 ?測(cè)序共獲得 6005941條測(cè)序序列 利用高通量測(cè)序技術(shù)鑒定花生 miRNA ?small RNA的長(zhǎng)度主要為24bp ?鑒定了 14個(gè)花生特有的新的 miRNA和 75個(gè)預(yù)測(cè)的miRNA ?特有的 miRNA表達(dá)量低于保守 miRNA，其表達(dá)具有組織特異性或者只在特定的發(fā)育階段表達(dá)。 利用高通量測(cè)序技術(shù)鑒定花生 miRNA Small RNA長(zhǎng)度分布 保守的 miRNA家族 Small RNA的生物信息學(xué)分析和應(yīng)用領(lǐng)域 ?分類(lèi)鑒定： miRNA, siRNA和piRNA和其它 ?Small RNA注釋 ?新的 miRNA預(yù)測(cè) ?miRNA表達(dá)模式分析 ?共有和特有 Small RNA分析 ?miRNA的表達(dá)模式聚類(lèi)分析 ?miRNA靶基因預(yù)測(cè) ?已知 miRNA的家族分析 ? Small RNA的系統(tǒng)識(shí)別和鑒定 ? Small RNA的進(jìn)化分析 ? Small RNA參與細(xì)胞分化和發(fā)育的功能分析 ? Small RNA藥物、 biomarker及藥物靶點(diǎn)的研究 ? Small RNA參與生命調(diào)節(jié)的研究 ? Small RNA與疾病發(fā)生的關(guān)系 高通量測(cè)序在組學(xué)中的應(yīng)用 從頭測(cè)序 基因組重測(cè)序 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 Small RNA測(cè)序 Lister et al. Current Opinion in Plant Biology (2022) 12:107 感謝您的選擇與支持
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