蛋白質工具rasmol使用簡介(編輯修改稿)
2024-10-31 06:13 本頁面
【文章內容簡介】 局部原子之后，其它的操作都只作用預這一局部 原子上面。Expression也就是rasmol的原子表達式,例如 Select all Select cys,第二十二頁，共三十三頁。,Atom Expressions RasMol 的 atom expressions 表示分子中的一組原子. 原子表達式包括: 根本(jīběn)表達式( primitive expressions) 預設集〔 predefined sets 〕 比較操作〔comparison operators〕 ‘within’ 表達式 logical (boolean) 運算符,第二十三頁，共三十三頁。,根本表達式: 1.殘基編號或者用殘基的編號范圍 例如: select 5,6,7,8 select 58 2.三字符氨基酸名{殘基編號}{肽鏈編號}{.原子名} 例如: SER70A SER70:1 SER70.CA 肽鏈編號如果也是數(shù)字的話，要用:隔開(ɡ233。 kāi) *可以匹配多個字符，？匹配單個字符,第二十四頁，共三十三頁。,Select 可選的預設(y249。 sh232。)集,核酸(h233。 suān) Nucleic AT CG Purine Pyrimidine 蛋白 Protein Helix Sheet Turn Buried Surface 氨基酸 Acidic Basic Neutral Charged Polar Hydrophobic Acyclic Cyclic Aliphatic Aromatic Backbone Sidechain Alpha Large Medium Small Cystine,第二十五頁，共三十三頁。,比較運算符 = != = 可以用比較運算符進行選擇(xuǎnz233。)的性質有: Atomno 原子編號 Elemno 原子序數(shù)(周期表) Resno 殘基編號 Radius 原子半徑 Temperature PDB的溫度系數(shù) Examples: resno = 900 atomno == 487,第二十六頁，共三十三頁。,Within(距離, 原子表達式) 如果“距離〞使整數(shù)(zhěng
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