【正文】
tero 8, 12, 16, 2028 arg, his, lys,第二十八頁,共三十三頁。 sh232。 hou),命令給選定的原子上色,當(dāng)翻開一個(gè)(yī ɡ232。 s232。nɡ)的顏色是做圖中最有用的功能之一,當(dāng)沒有(m233。 xi224。. 如果加了小數(shù)點(diǎn),那么表示的是埃 例如,命令 ‘spacefill 1.2’ 設(shè)定的外接圓半徑為 1.2 197。,鼠標(biāo)控制(k242。,PDB File,PDB 文件的每一行記錄(j236。nji224。,對于RasMol來說,它所涉及的PDB文件內(nèi)容只包括ATOM 和 HETATM記錄. ATOM/HETATM records contain standard 原子名,殘基名, 肽鏈標(biāo)記, 三維坐標(biāo), 熱動力學(xué)參數(shù)(cānsh249。,RasMol 的尺度 在RASMOL里,分子的尺度,例如距離,半徑等,可以有兩種坐標(biāo)表示, ‘RasMol 單位’ 或者標(biāo)準(zhǔn)的〞埃〞 (197。,Translate 語法(yǔfǎ): translate ,Translate x 20,x,y,第十頁,共三十三頁。,Space fill,Surface,第十三頁,共三十三頁。 me)程序內(nèi)置有一些預(yù)設(shè)的著色方案,第十六頁,共三十三頁。 s232。Expression也就是rasmol的原子表達(dá)式,例如 Select all Select cys,第二十二頁,共三十三頁。,比較運(yùn)算符 = != = 可以用比較運(yùn)算符進(jìn)行選擇(xuǎnz233。,cys.sg Sulphur atoms in cysteine residues ser70.c? Carbon atoms in serine70 hem*p.fe Iron atoms in the Heme groups of chain P *.*。39。source39。如果RasMol接受的距離數(shù)值不帶小數(shù)點(diǎn)的話,默認(rèn)它是用的RasMoL單位。腳本,第三十三頁,共三十三頁。所以上色命令作用在所有的原子上。,內(nèi)容(n232。write script39。 command allows an arbitrary formatted text string to be associated with each currently selected atom.,Set fontsize Colour label,%a Atom