【文章內(nèi)容簡介】 rp， Met， Val， Gly 所占比例較高，而氨基酸 Ser，Phe， His 所占比例較低。這表明在各種相互作用中氨基酸 Trp， Met， Val， Gly 比較受歡迎，而氨基酸 Ser， Phe， His 不太受歡迎。另外，同是受歡迎的氨基酸在各種相互作用中受歡迎的程度卻是不同的，同樣地，不受歡迎的氨基酸在各種相互作用中不受歡迎的程度也是不同的。這可能與氨基酸的極性與非極性有關(guān)，氨基酸所帶的電荷、偶極矩以及側(cè)鏈體積都有可能影響它的結(jié)合頻率 。 圖 39 固有無序蛋白與其它離子結(jié)合位點的統(tǒng)計結(jié)果 德州學(xué)院 物電學(xué)院 20xx 屆 應(yīng)用物理學(xué)專業(yè) 畢業(yè)論文 13 4 結(jié)論 自從 20 世紀(jì) 90 年代固有無序蛋白質(zhì)被發(fā)現(xiàn)以來，短短的十幾年時間里，關(guān)于固有無序蛋白質(zhì)的研究，從當(dāng)初的萌芽期迅速發(fā)展成一個重要且富有活力的蛋白質(zhì)科學(xué)研究領(lǐng)域。 論文以 DisProt、 BCDP 數(shù)據(jù)庫中固有無序蛋白質(zhì) 結(jié)合位點 為研究對象， 利用編程軟件 對數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計得到新的數(shù)據(jù)，然后對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，得到以下結(jié)論： （ 1）去冗余后各種氨基酸的含量和去冗余前有所變化，這一結(jié)果也進(jìn)一步體現(xiàn)出去冗余的重要性 ， 為我們在后面分析數(shù)據(jù) 時 的處理提供了借鑒 。 （ 2） 在八種相互作用 中，固有無序蛋白與蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)合位點最多，表明固有無序蛋白在行駛功能時與蛋白質(zhì)結(jié)合具有明顯的偏好性。而固有無序蛋白中蛋白質(zhì)與ATP/GTP 相互作用的結(jié)合位點最少。 （ 3） 通過分析可以得知：在蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)的結(jié)合位點中，氨基酸 Trp， Met， Val，Arg 頻率較高，而氨基酸 Ser， Qln， His 頻率較低；在蛋白質(zhì)與 DNA 的結(jié)合位點中，氨基酸 Arg， Trp， Gly 頻率較高，氨基酸 Met， Ser， Fhe， Phe， Asp 頻 率較低，而氨基酸 His在無序區(qū)沒有出現(xiàn)；在蛋白質(zhì)與 RNA 的結(jié)合位點中氨基酸 Trp， Gly 頻率較高，氨基酸圖 310 所有相互作用類型中固有無序蛋白質(zhì)結(jié)合位點的統(tǒng)計結(jié)果 德州學(xué)院 物電學(xué)院 20xx 屆 應(yīng)用物理學(xué)專業(yè) 畢業(yè)論文 14 Met， Ser， Fhe， Pro， Asp， His 頻率較低；在蛋白質(zhì)與 ATP\AGP 的結(jié)合位點中，氨基酸中 Gly 的頻率較高，氨基酸 Al， Trp， Met， Val， Gln， Glu， Asp 也有出現(xiàn)，但頻率較低，其余氨基酸沒有出現(xiàn)；在蛋白質(zhì)與輔因子的結(jié)合位點中，氨基酸 Ala， Gln 頻率較高，而氨基 酸 The， Phe， Asn， Pro， His， Asp 沒有出現(xiàn)，其 余氨基酸雖有出現(xiàn)但頻率較低；在蛋白質(zhì)與配體的結(jié)合位點中， 氨基酸 Trp， His 頻率較高，而氨基酸 Ala， Ser， Lys， Arg，Phe， Pro， Asp 沒 有出現(xiàn) ,其余氨基酸雖有出現(xiàn)，但頻率較低；在蛋白質(zhì)與金屬結(jié)合位點中，氨基酸 Met， Gly， Gln， Lys 出現(xiàn)的頻率較高，氨基酸 Ala， Thr， Leu， Gly， Asn， Tyr，Asp 出現(xiàn)的頻率較低，其余氨基酸沒有出現(xiàn)；在無序組蛋白的其它結(jié)合位點中， 氨基酸Met， Gly， Cys 出現(xiàn)頻率較高，而氨基酸 Leu， Pro 沒有出現(xiàn)，氨基酸 Ser， Arg， Phe 出現(xiàn)的頻率較低。 固有無序蛋白質(zhì)是一類具有特殊序列、結(jié)構(gòu)特征，行使特殊功能的一類特殊蛋白質(zhì)，目前成為蛋白質(zhì)研究領(lǐng)域的熱點之一。以上關(guān)于固有無序蛋白質(zhì)中相互作用 位點的氨基酸偏好性分析將會為今后蛋白質(zhì)與其它分子結(jié)合位點預(yù)測工作提供新的思路和數(shù)據(jù)支持。隨著可得到的固有無序蛋白質(zhì)與 DNA、 RNA、蛋白質(zhì)復(fù)合物等結(jié)合物結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的不斷增多，我們可以從原子水平上發(fā)現(xiàn)更多的相互作用過程中的規(guī)律，以加深對這種相互作用機制的理解，從而在理論上為藥物的開發(fā)和疾病的治療提供可靠的幫助。 參考文獻(xiàn) [1] Uversky VN .Natively unfolded proteins: a point where biology waits for physics. 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