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轉馬鈴薯α淀粉酶基因工程酵母菌的構建畢業(yè)論文(編輯修改稿)

2025-07-19 08:48 本頁面
 

【文章內容簡介】 反應體系組成(25μL)成分 填加量Template cDNA5μL10mmol/LdNTPAmy P12μLAmy P210Buffer(MgCl2)Taq DNA Polymerase1μLdd H2O8μL(1)根據(jù)所需濃度(%),加入2mL 5TBE緩沖液 ,再加18ml蒸餾水放于電爐上使瓊脂糖溶解;(2)溶液冷至60℃時,加入5μLEB混勻;(3)將溶化的瓊脂糖倒入制膠模具。迅速在模具一端插上梳子,檢查有無氣泡;(4)室溫下放置30min45min后,待瓊脂糖溶液完全凝固,小心取出梳子,將凝膠放置于電泳槽中;(5)加入50mL 5TBE電泳緩沖液至電泳槽中,再加入450mL蒸餾水,讓液面高于膠面,這樣凝膠兩端的電壓與外加電壓相等,電泳效率高;(6)在DNA樣品中加入2μL的上樣緩沖液,混勻后,吸取10μL電泳樣品點樣;(7)點樣完畢后,接通電泳槽與電泳儀的電源,由于DNA在中性緩沖液中帶有負電荷,在電場中向正極泳動,所以靠近點樣孔一端接負極。打開電源在電壓100V下進行電泳,待指示劑泳出點樣槽后降低電壓至80V進行電泳;(8)根據(jù)指示劑遷移的位置來斷定是否終止電泳,當指示劑遷移到2/3處時,切斷電源,取出凝膠; (9)將凝膠放在凝膠成像系統(tǒng)儀上檢測電泳結果,進行照相。(1)在紫外燈下切下含有目的DNA的瓊脂糖凝膠,裝入離心管中。注意:盡量切除不含目的DNA部分的凝膠,盡量減少凝膠體積,提高回收率。(2)稱量出離心管中凝膠的質量,計算出膠塊體積,以1mg=1uL進行計算。 (3)向膠塊中加入3倍體積的膠塊融化液DRI Buffer。(4)均勻混合后在75℃加熱離心管610分鐘使膠塊融化,并要間斷振蕩混合,使膠塊充分融化。注意:膠塊一定要充分融化,否則將會嚴重影響DNA的回收率。(5)向上述膠塊融化液中加入DRI Buffer量的一半體積量的DRII Buffer,均勻混合。(6)將上述溶液轉移至已經安置好的Spin Column中,12000rpm,離心1分鐘,棄濾液。(7)重復上面步驟一次。(8)將500μl的Rinse A加入Spin Column中,12000rpm,離心1分鐘,棄濾液。(9)將700μl的Rinse B加入Spin Column中,12000rpm,離心1分鐘,棄濾液。(10)重復上述步驟。然后將Spin Column安置于新的離心管上,在Spin Column膜的中央處加入25μl的滅菌蒸餾水,室溫靜置1分鐘后,在12000rpm,離心1分鐘洗脫DNA。(1)感受態(tài)細胞制備:①從保藏的試管中(20℃)挑取大腸桿菌DH5α劃線于LB平板上,在37℃恒溫培養(yǎng)過夜。②挑取單菌落于50mL LB培養(yǎng)基中37℃、200 r/min培養(yǎng)34h,至出現(xiàn)薄霧狀菌懸液即可。③將培養(yǎng)液置于冰上預冷15min,并間斷輕輕搖動。④將冷卻的培養(yǎng)液倒入己在冰上預冷的50mL離心管中。⑤在冷凍離心機中離心,4℃ 3000r/min 5min。⑥棄上清、,輕輕旋轉,使細胞充分重新懸浮,冰上4℃3000r/min離心5min。⑧棄上清,輕輕旋轉,使細胞充分重新懸浮,5min后就可以用于轉化實驗,或添加保護劑,低溫或超低溫冷凍貯藏備用。(2)質粒轉化:①取出制備好的感受態(tài)細胞,迅速融化放在冰上。②將感受態(tài)細胞分裝成100μL/,質粒產物10μL,用微量移液器輕輕吸打均勻、在冰上放置30min。③熱擊 將離心管放置42℃水浴90s(勿動離心管) ④冰浴 快速將離心管轉移到冰上,放置l020min(時間不能太長)。⑤復蘇 每管加900μL,LB培養(yǎng)基,在37℃ 200r/min振蕩培養(yǎng)5060min,使細菌復蘇,抗性得以表達。⑥涂皿 取100μL 左右轉化液徐布在含有氨芐青霉素(Amp 50μg/mL)的平板上。⑦倒置平板于37℃培養(yǎng)1618h,觀察實驗結果并記錄結果6. TA克隆、轉化及重組質粒的鑒定(1)連接反應體系成分填加量回收純化DNA3μLpGEMT載體1μL10連接緩沖液5μLT4DNA連接酶1μL(2)將連接混合液在16℃溫育4h(3)轉化及藍白斑篩選①取出制備好的感受態(tài)細胞,迅速融化放在冰上。②,將上述連接混合液取10μL產物,用微量移液槍輕輕吸打均勻、在冰上放置30min。③熱激 將離心管放置42℃水浴90s(勿動離心管)。④冰浴 快速將離心管轉移到冰上,放置l020min(時間不能太長)。⑤復蘇 每管加900μL,LB培養(yǎng)基,在37℃ 200r/min振蕩培養(yǎng)5060min。⑥涂皿 取100μL 左右轉化液徐布在含有4μL IPTG,40μL xga1和氨芐青霉素(Amp 50μg/mL)的平板上。⑦倒置平板于37℃過夜培養(yǎng)。(4)重組質粒的鑒定①酶切鑒定 挑取白色菌落進行培養(yǎng),提取質粒DNA,選取EcoRI進行酶切,通過瓊脂糖凝膠電泳進行鑒定。酶切體系:37℃ 3h成分填加量質粒DNA10μL10Buffer EcoRI酶dd H2O 2μL1μL7μL② PCR鑒定 挑取白色菌落進行培養(yǎng)擴增,提取質粒DNA,做PCR擴增反應,反應產物通過瓊脂糖凝膠電泳進行鑒定:PCR體系的反應條件:1)94℃ 1min 2)94℃ 30s55℃ 45s 30 cycles 72℃ 50s 3)72℃ 10min 4) 4℃ 10min 反應體系組成(25μL)成分加入量質粒DNA2μL10mmol/LdNTPAmy P12μLAmy P22μL10Buffer(Mg2+)Taq DNA Polymerase1μLdd H2O13μL③測序鑒定挑取白色菌落進行培養(yǎng)擴增,提取質粒DNA,由上海生工測序,然后進行序列比對。(5)經鑒定正確后得到馬鈴薯α淀粉酶的基因,并于4℃保存?zhèn)溆?。(五)畢赤酵母表達載體的選擇、構建、轉化及重組質粒的鑒定(1)引物設計根據(jù)引物設計的基本原則設計出帶有NotI位點的引物并由上海生工合成。pMPamyF:5'GCGGCCGCTAAGGAGATCATATTGCAGGCpMPamyR:5'GCGGCCGCTCTTCTGCCAGACTGCATAGC(2)引物稀釋將上游引物、下游引物的濃度分別稀釋到10pmol/μL,于20℃保存?zhèn)溆?3)PCR反應PCR體系的反應條件:①94℃ 1min ②94℃ 30s 55℃ 45s 30 cycles72℃ 50s ③72℃ 10min ④ 4℃ 10min 反應體系組成(25μL)成分填加量質粒DNA2μL10mmol/LdNTPpMPamyF2μLpMPamyR2μL10Buffer(含Mg2+)Taq DNA Polymerase1μLdd H2O13μL(4)反應結束后進行瓊脂糖凝膠電泳并在凝膠成像儀上照相。 (5)PCR擴增正確后回收DNA片段(6)TA克隆、轉化及重組質粒的鑒定①TA連接在一支離心管內,按照以下順序加入連接混合物成分填加量回收DNA3μLpGEMT載體1μL10連接緩沖液5μLT4 DNA連接酶1μL②將連接混合液在16℃溫育4h③把連接產物做轉化④鑒定重組質粒的正確性1) 酶切鑒定 挑取白色菌落進行培養(yǎng)擴增,提取質粒DNA,利用質粒多克隆位點內的EcoRI位點進行酶切,酶切產物通過瓊脂糖凝膠電泳進行鑒定。酶切體系:37℃ 3h成分填加量質粒DNA10μL10Buffer EcoRI酶dd H2O 2μL1μL7μL2) PCR鑒定 挑取白色菌落進行培養(yǎng)擴增,提取質粒DNA,做PCR擴增反應,反應產物通過瓊脂糖凝膠電泳進行鑒定:PCR體系的反應條件:(1)94℃ 1min(2)94℃ 30s55℃ 45s 30 cycles72℃ 50s(3)72℃ 10min (4) 4℃ 10min 反應體系組成(25μL)質粒DNA2μL10mmol/LdNTPpMPamyF2μLpMPamyR2μL10Buffer(MgCl2)Taq DNA Polymerase1μLdd H2O8μL⑤鑒定正確后把質粒用NotI酶進行酶切酶切體系:酶切條件:37℃ 16h成分填加量質粒DNA10μL10Buffer NotI酶dd H2O 2μL1μL7μL⑥酶切正確后回收酶切產物,得到了帶有NotI位點的馬鈴薯α淀粉酶基因2. 酵母表達載體的構建、表達及重組質粒的鑒定 (1)pPIC9K的構建①從以保存pPIC9K菌落平皿上挑取菌落進行培養(yǎng)擴增,提取質粒DNA,并電泳檢測所提取的質粒DNA。②用NotI酶進行酶切提取的正確的質粒DNA。③酶切反應結束后對產物進行磷酸化處理,防止自身的環(huán)化而影響和目的基因的連接。酶切體系:37℃ 16h成分填加量質粒DNA10μL10Buffer NotI酶dd H2O 2μL1μL7μL ④用1%的瓊脂糖凝膠電泳進行鑒定。⑤回收鑒定正確的酶切產物,并在20℃保存?zhèn)溆谩?2)pPIC9K載體和帶有NotI位點的馬鈴薯α淀粉酶基因的重組連接體系:(20μL)成分填加量pPIC9K質粒DNA5μL馬鈴薯α淀粉酶質粒5μL10連接緩沖液5μLT4 DNA連接酶2μLdd H2O至20μL連接條件:16℃ 24h(3)pPIC9K—αamylase重組質粒轉化(4)挑取單菌落進行培養(yǎng)擴增,提取重組質粒DNA.(5)重組質粒的鑒定① 酶切鑒定挑取單菌落進行培養(yǎng)擴增,提取質粒DNA進行鑒定。其余步驟由于時間原因還未完成。三、結果與分析(一)引物稀釋結果(1)Amy P1與Amy P2按照說明書分別加入96μL和106μL的DEPC處理水稀釋后,用紫外分光光度計測得的結果是:Amy P1 OD260 =Amy P2 OD260 =利用公式:引物濃度= OD260稀釋倍數(shù)Ug per OD103106 /分子量pmol/μL,Amy P1濃度=1000103106/=Amy P1濃度=1000103106/= Eppondorf管中稀釋成10pmol/μL的終引物濃度。(2)pMPamyF與pMPamyR按照說明書分別加入96μL和106μL的DEPC處理水稀釋后,用紫外分光光度計測得的結果是:pMPamyR OD260 =pMPamyF OD260 =利用公式:引物濃度= OD260稀釋倍數(shù)Ug per OD103106 /分子量pmol/μLpMPamyF濃度=100033103106/=pMPamyR濃度=100033103106/= Eppondorf管中稀釋成10pmol/μL的終引物濃度。(二)RNA提取結果與分析RNA經過凝膠電泳后得到的圖片如圖1: 1 228S18S5S 圖1:TotalRNA 凝膠電泳圖像在TotalRNA中含有mRNA、rRNA和tRNA,其中rRNA最多。在電泳圖中可以清楚看到28SrRNA與18SrRNA兩條帶,5SrRNA的條帶不太亮,說明5SrRNA有點降解。28SrRNA帶比18SrRNA帶稍亮。(三)RTPCR結果與分析PCR凝膠電泳圖片如圖2: M 12000bp1000bp目的產物圖2:PCR凝膠電泳圖像由圖2可以看出在PCR時沒有出現(xiàn)特異性條帶,說明PCR擴增出了專一性的目的片段。(四)馬鈴薯α淀粉酶基因克隆的結果與分析—αamylase連接結果轉化產物凝膠電泳圖片如圖3: 1 2空載的未重組質粒陽性重組質粒 圖3:連接產物質粒凝膠電泳圖像在圖4中條帶1是提取白色菌落的質粒,條帶2是提取藍色菌落的質粒。通過對比確定陽性重組質粒。用EcoRI酶進行酶切鑒定的凝膠電泳圖片如圖4: 1 2圖4:酶切產物凝膠電泳圖像在圖5中條帶1是轉化后的連接質粒DNA,條帶2是酶切后的產物。從圖中可以看出連接質粒DNA被酶切開了,并且結果是正確的,所以也可以說把T載體和α淀粉酶基因連接在一起,可以進行下一步實驗。PCR凝膠電泳圖片如圖5: M PCRPCR產物XHANWU2000bp1000bp750bp500bp 圖5:PCR鑒定凝膠電泳圖像圖6說明了所擴增出的片段比1000bp稍大,符合要求克隆基因的大小,所以可以說此質粒是正確的連接產物,可以進行下一步實驗。(見附錄二、三)通過對測序報告單的分析及與GenBank中收錄的馬鈴薯α淀粉酶基因序列的比對分析,初步證明所克隆的基因是馬鈴薯α淀粉酶基因,但是部
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