支持向量回歸用于氨基酸描述符(編輯修改稿)
2025-06-12 05:28 本頁面
【文章內(nèi)容簡(jiǎn)介】 NDCQEGHILKMFPSTWYV………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….3 結(jié)果與討論在SVR模型中，通過依次去掉肽鏈中的每個(gè)氨基酸的zscales中的一個(gè)值，根據(jù)模型LOOCV法的PRESS值的大小可以判斷每個(gè)氨基酸對(duì)此類肽類似物生物活性的影響。為此，以每去掉一個(gè)zscales的模型（5個(gè)參數(shù)）的PRESS與原模型（6個(gè)參數(shù)）的PRESS的差值為縱坐標(biāo)，以依次去掉zscales中的一個(gè)值的順序?yàn)闄M坐標(biāo)作圖（圖圖圖6）。由于z1主要和氨基酸的親水性有關(guān)、z2同氨基酸的立體大小有關(guān)和z3主要氨基酸的電性參數(shù)有關(guān)[5]。所以，由圖2可知，PRESS在依次分別去掉第一、二位氨基酸的z1時(shí)升高很多，說明苦味二肽的活性主要與兩個(gè)位置的疏水性性質(zhì)有關(guān)，這與文獻(xiàn)相一致[4]；PRESS在依次分別去掉第一、二位氨基酸的z2時(shí)略有升高，苦味二肽的活性主要與兩個(gè)位置的立體大小性質(zhì)弱相關(guān)；去掉z3時(shí)幾乎沒有變化，表明與其電性性質(zhì)無關(guān)。圖2 48個(gè)苦味二肽PRESS差值與去掉氨基酸性質(zhì)位置Figure 1 Plot of △PRESS and removed amino acid property position of a set 48 bitter tasting dipeptides with zscales（圖題：中文用宋體五號(hào)、英文用Times New Roman五號(hào)、加粗，居中，序序后空1格，不用標(biāo)點(diǎn)符號(hào)）（英文圖題： Times New Roman五號(hào)、加粗，居中，圖序后空2格，不用標(biāo)點(diǎn)符
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