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正文內(nèi)容

信息與通信]蛋白質(zhì)層析技術(shù)(編輯修改稿)

2025-02-15 03:32 本頁面
 

【文章內(nèi)容簡介】 不銹鋼材質(zhì),耐強有機溶劑,不耐酸,Cl , EDTA等螯合離子 , 鹽等蛋白純化試劑)。 ? 層析柱或?qū)游鼋橘|(zhì)是層析分離實現(xiàn)的場所,現(xiàn)代蛋白液性層析儀兼容所有蛋白層析介質(zhì),不存在所謂 “ 有利發(fā)揮介質(zhì)特性的層析儀 ” 。 ? 工藝移植和同一介質(zhì)的不同粒度有關(guān),一般和儀器無關(guān),除非儀器集成度不高,死體積太大。 ? 很多功能是競爭的產(chǎn)物,非必要,更非業(yè)界標(biāo)準(zhǔn)。 蛋白質(zhì)純化平臺 分子生物學(xué)實驗室的層析 姜韜 0 100 200 300 400 500 600Vo lum e( m l)OD280nm U V050100150200250HIC for FABPConductivity(mS/cm) C o n d u c tiv ity引言 ? 現(xiàn)代生物學(xué)研究的發(fā)展,為分子生物學(xué)實驗帶來新的課題和挑戰(zhàn)。目標(biāo)DNA的功能研究其中相當(dāng)?shù)墓ぷ餍枰蛛x純化表達(dá)了的基因產(chǎn)物-目的蛋白。研究其活性并制備抗體進(jìn)行更深入的功能探討。 ? 生物技術(shù)的發(fā)展,特別是以液相層析為核心的生化分離技術(shù)的日益成熟和完善為分子生物學(xué)實驗室提供了這種充分的條件。 ?生物技術(shù) (Biotechnology)有三大部分:生化分離技術(shù); DNA重組及基因轉(zhuǎn)移技術(shù);免疫檢測技術(shù)。其中生化分離技術(shù)是生物技術(shù)的基礎(chǔ)和支柱。 ?層析 (chromatography)是最有效的分離手段,也是最重要的蛋白質(zhì)純化工具。層析主要是物理方法,是混合熵減少的過程,必然消耗自由能。 ?基因工程下游的核心是層析。 ?層析技術(shù)的理論與實踐已高度發(fā)展和完善。 蛋白質(zhì)純化平臺將成為分子生物學(xué)實驗室的基本內(nèi)容 ? 分子生物學(xué)家運用的分離純化技術(shù)具有平臺的特征 生化學(xué)家分離未知蛋白 ? 規(guī)模較小,目標(biāo)蛋白含量往往極低; ? 各步驟用活性分析和蛋白分析嚴(yán)密監(jiān)控; ? 針對性強,過程復(fù)雜,不可移植; ? 產(chǎn)物純度要求高,往往用于測序。 基因工程下游分離已知蛋白 ? 規(guī)模較大,目標(biāo)產(chǎn)物含量較高; ? 重視純化過程的技術(shù)經(jīng)濟(jì)指標(biāo); ? 有較強的針對性,移植性很差; ? 產(chǎn)物純度要求高,通常有特殊要求: 無病毒,無 DNA,無內(nèi)毒素。 分子生物學(xué)實驗室需分離已知蛋白 ? 規(guī)模??; ? 目標(biāo)蛋白含量較高,往往是高表達(dá)的產(chǎn)物,往往大于 5%; ? 純度和回收率往往要求較低,電泳純; ? 步驟少,硬件結(jié)構(gòu)有通用性。 蛋白質(zhì)純化平臺的結(jié)構(gòu)和組成 ? 含量較高的蛋白質(zhì)純化,基本可以在三個層析步驟中實現(xiàn)。 ? 利用目標(biāo)蛋白的三個獨立的物理化學(xué)性質(zhì)進(jìn)行層析分離。 分離機制 ? 分子的大小 凝膠過濾 (sizeexclusion)(分子篩,分子排阻) ? 分子的電性 離子交換( IEC)陽離子交換、陰離子交換 ? 分子的表面疏水結(jié)構(gòu) 疏水層析( HIC) ? 其它:羥基磷灰石,反相,金屬螯合 (IMAC),親和,染料配基介質(zhì)層析 ? 精制( polishing):高分辨率層析 純化平臺的硬件結(jié)構(gòu) ? 中心設(shè)備:中壓至高壓層析儀 ? 輔助設(shè)備:過濾裝置,超濾裝置,離心機,蛋白質(zhì)電泳等 層析柱 ?不同性能的層析柱; ?層析柱裝填:( 1)均勻;( 2)緊密 ?柱效評價:理論塔板 板高 ?不同粒度近似關(guān)系為: H?dp2 ?在裝填良好的情況下,通常:凝膠過濾 H ? 2dp; 離子交換、疏水 H? 3 dp N VW? ??????5 541 22./H LN?? 經(jīng)驗:具有 3000個理論塔板的凝膠過濾可近似地將分子量相當(dāng) 2倍的蛋白質(zhì)完全分開; 6000個理論塔板可分開相差 。 ? 通常, 3000個塔板如用 BioGel P(fine)或 BioGel A(fine),流速 20cm/h(參照產(chǎn)品說明書) 應(yīng)在 80cm以上至 120cm,上樣 5%,一般 12%。 ? Scope建議: 柱直徑: D=(M/10)1/3 D:cm; M:蛋白量( mg) 而 L=30D L: cm ?實驗室規(guī)模的層析應(yīng)采用不大于 50?m的離子交換或疏水介質(zhì),應(yīng)具有 10cm左右,則不少于 600個理論塔板。 ?精制:高效預(yù)裝柱 1 5ml, 10?m左右粒度,如 Mono系列; BioScale; TSK等。 平臺的操作(軟件:知識結(jié)構(gòu)) ? 樣品處理及準(zhǔn)備工作 ? 用 SDSPAGE監(jiān)測整個流程 ? 富含目標(biāo)蛋白的提取物的獲得:應(yīng)采用盡量低強度的抽提方法。通常 PBS或 TBS抽提能力過強,沒有必要 .低滲更有利于破碎,甚至可用水進(jìn)行抽提(如 1: 4左右)。 ? 無特殊理由, pH應(yīng)準(zhǔn)確控制在中性附近,盡量用酸性 buffer; ? 最好運用( NH4) 2SO4沉淀,縮小體積,便于保存。終止生化代謝反應(yīng),除糖、脂類。個別情形中會造成不可逆沉淀; ? ,沒有特殊原因不要使用超聲破碎法。 ? 0?C , 20%蔗糖, 10mM左右緩沖液,含 ? 高滲后,加入低滲液,迅速充分懸浮。如果必要,應(yīng)含 DTT至 2mM左右。 ? 均漿液組成原則:離子強度盡量低: ?50mM,有時需 DTT,不一定加 EDTA,可考慮加PMSF,但此時不宜用 Tris等胺類緩沖劑。 樣品通常特點及對后續(xù)純化的影響 ? 大多數(shù)蛋白將帶負(fù)電荷,樣品會含一定量核酸; ? ( NH4) 2SO4 沉淀,通常蛋白濃度 15 mg/ml ; ? 運行層析,則蛋白濃度不應(yīng)大于10mg/ml。 通常純化流程:選擇性、分辨率、載量 ?目標(biāo)蛋白為堿性蛋白,在中性附近運用陽離子交換,選擇性好,除核酸 多糖; ?目標(biāo)蛋白為酸性蛋白,則第一步層析采用分子篩,最好此前將溶液脫鹽,并在含0 .2 0 .4 M NaCl的緩沖液中運行,緩沖成分視下一步而定。如果介質(zhì)含聚丙烯酰胺,則應(yīng)含 Tris 等含氮的緩沖成分,減少 ??互相作用造成的吸附 . ?離子交換后,采用疏水層析,可省去緩沖液交換步驟( Buffer Exchange); ?如有必要,濃縮后, Buffer Exchange,進(jìn)行精制。 ?離子交換:平衡液應(yīng)采用盡量低的離子強度,上樣體積不限。 ?pH:陽離子通常低于 pI 一個 pH單位 陰離子通常高于 pI 一個 pH單位 ?Sticky protein:在某 pH附近,與陽離子和陰離子層析介質(zhì)都結(jié)合。 ?參數(shù)獲得 ?2 .5%上樣體積運行離子交換及疏水,樣品不需平衡。 實例及分析 ? 從陽離子交換入手 ── 凝膠過濾,疏水 ? 從凝膠過濾入手 ── 疏水,離子交換 ? 親和層析不一定必要 從凝膠過濾入手 ── 離子交換 ?hpag4蛋白分子量約 180kD, pI約 5,粗提物中含量約 5%; ?粗提物主要特性: I約 ; pH約 ;蛋
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