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原核生物的轉(zhuǎn)錄及調(diào)控(編輯修改稿)

2025-02-09 14:43 本頁面

　

【文章內(nèi)容簡介】合力（ 100倍）； ? 導(dǎo)致 RNA鏈的延伸緩慢 Promoter與 σ factor 間的結(jié)合專效性 ● 決定了 strong promoter amp。 weak promoter； ★ 35 box, 10 box的差異影響啟動(dòng)子與 RNA pol 中 σ因子的結(jié)合能力； ★ 不同啟動(dòng)子的 35， 10 box間存在較為保守的標(biāo)準(zhǔn)序列（標(biāo)準(zhǔn)啟動(dòng)子）； ★ σ factor is responsible for recognition of consensus sequence of promoter and only required for initiation. RNA pol與啟動(dòng)子的結(jié)合 ? σ因子識別啟動(dòng)子上結(jié)合位點(diǎn)。 RNA pol全酶與 35 box結(jié)合 →封閉型啟動(dòng)復(fù)合物； ? 酶向 10 box移動(dòng)，并與之牢固結(jié)合，促使 10 box及起始位點(diǎn)處發(fā)生局部解鏈 →開放型啟動(dòng)復(fù)合物； ? DNA解螺旋擴(kuò)展到 10 box下游 17bp范圍。轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的決定 ? 酶與 10 box 的結(jié)合，決定了第一個(gè)起始堿基的選擇。 ? 第一個(gè)被轉(zhuǎn)錄的堿基離 10 box 的保守 T約6~9nts。 ? mRNA的起始位點(diǎn)多為 G，其次為 A ，很少為 U, 起始點(diǎn)核苷酸的兩側(cè)分別為 C 和 T。三元復(fù)合物的形成和 σ因子的解離 ? RNA合成一開始，就形成模板 RNA polRNA的三元復(fù)合物。 ? σ因子解離，核心酶與模板的親和性下降到非特異性結(jié)合的水平， RNA pol在 DNA鏈上變得容易移動(dòng)，為鏈的延伸創(chuàng)造了條件； ? 游離的 σ因子可以重新進(jìn)行功能循環(huán)。轉(zhuǎn)錄的起始 ? 核心酶在 σ因子幫助下特異性結(jié)合到 DNA上； ? RNA pol與啟動(dòng)子 35 box 結(jié)合，形成封閉型起始復(fù)合物； ? 酶滑動(dòng)到 10 box，轉(zhuǎn)變成為開放型起始復(fù)合物，啟動(dòng)子活化，雙鏈解開，模板鏈暴露，插入最初的 2個(gè)核苷酸； ? 酶繼續(xù)加上開頭的幾個(gè) NTP，形成三元起始復(fù)合物，在 RNA鏈合成了 8～ 9個(gè)堿基后， σ因子解離，轉(zhuǎn)錄開始。 Model of the interaction between E. coil RNA polymerase holoenzyme and a promoter DNA Incorporating the first few Nt 二、原核生物轉(zhuǎn)錄的延伸 ? RNA pol沿著模板鏈移動(dòng)， RNA鏈不斷延伸，并保持三元復(fù)合物的結(jié)構(gòu)； ? 轉(zhuǎn)錄泡中的 DNA螺旋前開、后合， RNA延長，不斷脫離 DNA； ? RNA鏈的延伸速度不是恒定的，在模板富含GC的區(qū)域，轉(zhuǎn)錄就會減慢 /停頓。 17bp 螺旋解開長度 12bp DNARNA復(fù)合體長度影響 RNA延伸速度的因素： ① RNA pol； ② 暫停信號：導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄速度突然出現(xiàn)變化的特殊序列。 ? GC富集區(qū) ：產(chǎn)物 RNA不易釋放； ? IR：產(chǎn)物形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)，妨礙上游的模板恢復(fù)雙鏈。 ③ 其他配基： ppNpp、 NusA蛋白。 NusA protein ： ★ 69 Kd, acid protein ★ RNApolattaching factor ★ Impel RNApol. pausing in terminator for 1’15’ and waiting for Rho factor to stop transcription of RNA ★ After initiation → substituting σ → NusA + core E antitermination N protein utilization substance NusA binds to polymerase, and N binds to both NusA and box B of the nut site region of the transcript, creating a loop in the growing RNA. This plex is relatively weak and can cause antitermi

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