原核生物的轉錄及調控-全文預覽
【正文】 轉錄繼續(xù)進行； ? Trp多 → tRNATrp多 →核糖體順利通過 2個相鄰的Trp密碼子 → 4區(qū)被轉錄之前，核糖體就達到 2區(qū)→ 34區(qū)配對形成富含 GC的莖環(huán)結構 →轉錄停止→ trp操縱子中的結構基因被關閉，不再合成 Trp 衰減作用的重要性 ? 衰減作用（ 10倍）與阻遏作用（ 70倍）協(xié)調作用能大大增強對 Trp操縱子的調節(jié)作用（ 700倍）。 。 ? 自然界中也存在著不同類型的合成體系，如 His操縱子 ，擁有在功能上與 trp操縱子完全相同的衰減子（能夠形成一個 3個堿基配對的區(qū)域）。這個假設的多肽被稱為前導肽。 ?β半乳糖苷乙?；D移酶 ：乙酰 CoA+β半乳糖苷 →乙酰半乳糖。 ? 包括 ： ① 結構基因：編碼控制某一代謝途徑的相關的酶； ② 調控元件 ： 是調節(jié)結構基因轉錄的一段 DNA序列，包括啟動子和操縱基因； ③ 調節(jié)基因：其產物（調節(jié)蛋白）能夠識別并結合操縱基因，決定結構基因的轉錄與否。 （三 ） 正調控和負調控 ? 正調控 ：調節(jié)蛋白與操縱子結合后 促進轉錄的進行。如培養(yǎng)基中 Trp的存在 抑制 了 Trp的 合成 ； （二）調控的效應物 ?調節(jié)蛋白 + 小分子物質 → 原核操縱子的誘導 /阻遏。能夠利用水解 ATP釋放的能量使 RNA從三元復合物中釋放出來； ? 結構 ：仍然具有莖環(huán)結構，但 GC堿基對含量較少，下游也缺乏 polyU結構。 ? GC富集區(qū) ：產物 RNA不易釋放； ? IR： 產物形成莖環(huán)結構，妨礙上游的模板恢復雙鏈。 ? σ因子解離，核心酶與模板的親和性下降到非特異性結合的水平， RNA pol在 DNA鏈上變得容易移動，為鏈的延伸創(chuàng)造了條件； ? 游離的 σ因子可以重新進行功能循環(huán)。 轉錄起始位點的決定 ? 酶與 10 box 的結合，決定了第一個起始堿基的選擇。 RNA pol. firmly binding site（ B site） Initiation site ： +1 site。 第三節(jié) 原核生物轉錄的過程 ? RNA的轉錄包括 promotion， elongation， termination 三過程； ? 從 promoter到 terminator稱為 transcriptional unit； ? 原核生物中的轉錄單位多為 polycistron ； ? 轉錄起始點記為 +1，其上游記為 負值 ，下游記為 正值 。 RNA聚合酶的基本性質 亞基 基因 全酶中的數量 分子量（ da l t ） 部位 可能功能 α rpo A 2 40000*2 多樣 β rpo B 1 155000 結合核苷酸 β ’ rpo C 1 160000 核心酶 結合模板 σ rpo D 1 85000 σ因子 起始識別因子 RNA polymerase in prok. σ β α α β’ Core Enzyme Holo Enzyme for elongation for initiation 依靠靜電作用力 依靠空間結構 非專一性與非特異 DNA 結合 專一性與 特異 DNA結合 半衰期； 60’ 半衰期；數小時 cover60bp σ β α α β’ Richard Burgess and Andrew Travers (1969) 150 kD 160 kD 70 kD 40 kD Cartoon illustrating separation of the subunits of E. coli RNA polymerase by SDSPAGE 核心酶：催化磷酸二酯鍵的形成 ? α亞基 ： 2個，功能多樣（核心酶的組建因子、促進雙鏈的解開和重新聚合、啟動子識別、促進 RNA pol與 DNA 模板鏈上游轉錄因子結合） ? β亞基 ： 1個，結合核苷酸底物，催化磷酸二酯鍵的形成； ? β’ 亞基 ：堿性強，與模板鏈結合； 二、 RNA聚合酶各亞基的功能 σ因子 ： ? Reusable； ? 修飾 RNA pol 的構型； ?
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