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基因工程原理與技術(shù)-全文預(yù)覽

  

【正文】 庫(kù)克隆數(shù)少,能保持基因組特定序列的完整性,有利于制作物理圖譜。 黏粒載體主要用于真核生物的基因組文庫(kù)構(gòu)建。 ②在連接反應(yīng)中,酶切的基因組 DNA片段 (特別是較小的 DNA 片段 )往往會(huì)出現(xiàn)兩個(gè)或數(shù)個(gè)片段隨機(jī)再連接,串聯(lián)地插入到載體上,其連接順序并不符合基因組中排列順序。如pWE1 pWE16等。如 pWE1 pWE16。 ④具有與同源序列的質(zhì)粒進(jìn)行重組的能力。當(dāng)然黏粒載體本身不能在體外被包裝,只有在克隆了合適長(zhǎng)度的外源 DNA片段,才能被包裝成噬菌體顆粒,這是對(duì)重組子的正選擇。如基因 克隆、基因定點(diǎn)突變、 DNA測(cè)序、體外轉(zhuǎn)錄等 在多克隆位點(diǎn)的兩側(cè)具有 T7噬菌體啟動(dòng)子 ,可進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄。 噬菌粒載體的優(yōu)點(diǎn) : ①分子量較小,約為 3kb,可克隆 10kb的外源 DNA片段。 四、 M13噬菌體載體的缺點(diǎn) ①插入的外源 DNA片段不穩(wěn)定,片段越大,越容易發(fā)生缺失或重排。 M13mp2 是利用點(diǎn)突變把 M13mp1的 ?肽的第 5個(gè)氨基酸密碼子中的鳥嘌呤轉(zhuǎn)換成腺嘌呤,從而引入了一個(gè) EcoRI限制酶切位點(diǎn)。 一、 M13噬菌體的一般生物學(xué)特性 M13噬菌體的基因組結(jié)構(gòu) 基因 VIII和基因 III、基因 II和基因 IV之間的間隔區(qū)較長(zhǎng),其他基因間隔區(qū)只有數(shù)個(gè)核苷酸。②制備單鏈 DNA分子,用于基因定點(diǎn)突變、基因測(cè)序、雜交探針制備等。 λZAP插入型載體 在 λZAP中,含有一個(gè) pBluescript噬菌粒的 DNA片段 (見下圖 ),位于 J基因和 cI基因之間,兩側(cè)是 f1復(fù)制起始子和終止子 ,在輔助噬菌體 M13或 f1存在下,能獲得帶外源 DNA的噬菌粒,用于測(cè)序和限制圖譜構(gòu)建等 (其它 λ載體的缺陷 )。其 MCS含有 EcoRI、 SacI、 SmaI、 XbaI、 SalI、 PstI、 HindIII、BamHI λEMBL系列 取代型載體 如: λEMBL λEMBL λEMBL3A等。如Charon 4A是在晚期基因 A、 B中引入了琥珀突變 。 包裝限制是對(duì)重組體的一種正選擇 (見下圖 )。 克隆容量較小 ,一般在 10kb以內(nèi),用于cDNA及小片段 DNA的克隆 。例如, 將 λ噬菌體在 EcoRI限制 修飾的宿主和 EcoRI限制 修飾缺陷型宿主之間反復(fù)地循環(huán)生長(zhǎng),篩選到完全失去了EcoRI酶切位點(diǎn)的 λ噬菌體。 第二節(jié) λ噬菌體載體 一、 λ噬菌體載體的生物學(xué)特性 λ噬菌體的生活周期 λ噬菌體的基因組結(jié)構(gòu)和功能 cos位點(diǎn) (cohesiveend site): λDNA環(huán)化時(shí)其粘性末端形成的雙鏈區(qū)段 . 左側(cè)區(qū): A~J,約 20kb 右側(cè)區(qū): N~R,約 12kb 中間區(qū): J~N,約 18kb, 為非必須區(qū)段 cI 基因控制溶源過程,阻遏溶菌周期所有基因的表達(dá) λ噬菌體的 DNA復(fù)制 裂解周期的早期 : θ型雙向復(fù)制 ,產(chǎn)生 環(huán)狀 DNA分子 ; 裂解周期的晚期 : σ型滾環(huán)復(fù)制 ,產(chǎn)生 線性多聚體 DNA分子 。 親和層析法純化外源蛋白 。 表達(dá)載體 (根據(jù)受體細(xì)胞 ) 原核細(xì)胞表達(dá)載體 真核細(xì)胞表達(dá)載體 表達(dá)載體 (根據(jù)表達(dá)蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn) ) 分泌型表達(dá)載體 非分泌型表達(dá)載體 表達(dá)載體 (根據(jù)表達(dá)蛋白的組成 ) 融合型表達(dá)載體 非融合型表達(dá)載體 pBV221 rrnB 大腸桿菌表達(dá)載體的特征 (與克隆載體相比 ): ①?gòu)?qiáng)啟動(dòng)子;如 Lac、 Trp、 Tac、 PL、 PR、 T7啟動(dòng)子 。 藍(lán)白斑篩選 (α篩選 ):是指利用外源基因插入載體上lacZ’5’端的多克隆位點(diǎn)而破壞 α互補(bǔ)、不能催化平板培養(yǎng)基中 5溴 4氯 3吲哚 βD半乳糖苷 (Xgal) 形成藍(lán)色產(chǎn)物、致使形成白色的重組菌落而篩選出重組子的方法。 pAT153 ② 引入帶單一 EcoRI的選擇標(biāo)記;如 pBR324(,具有大腸桿菌素 E1基因和免疫 imm基因 )、 pBR325(氯霉素抗性基因 )。 三、質(zhì)粒載體的構(gòu)建 載體構(gòu)建的基本原則 ①根據(jù)基因操作的工作需要; ②符合理想載體的必備條件; ③ 選擇適合的親本質(zhì)粒提供載體元件 ; ④盡量簡(jiǎn)化構(gòu)建程序。 質(zhì)粒 接合型質(zhì)粒 (自我轉(zhuǎn)移質(zhì)粒 ):多屬于嚴(yán)緊型 非接合型質(zhì)粒 (不能自我轉(zhuǎn)移質(zhì)粒 ):多屬于松弛型 質(zhì)粒的遷移作用 是指非接合型質(zhì)粒在接合型質(zhì)粒共存時(shí)可發(fā)生轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象。 氯霉素、或鏈霉素等存在可使質(zhì)粒的拷貝數(shù)達(dá)到幾千個(gè)。 質(zhì)粒的分子特性 雙鏈環(huán)形 DNA(絕大多數(shù) )、雙鏈線形DNA、 RNA(酵母的殺傷質(zhì)粒 )。 根據(jù) 受體細(xì)胞 不同載體分為 原核生物載體 (大腸桿菌載體 )、真核生物載體 (酵母載體、植物載體、動(dòng)物載體 )。第三章 基因工程載體 載體 (vector)是指基因工程中攜帶外源基因進(jìn)入受體細(xì)胞的“運(yùn)載工具”,其本質(zhì)是 DNA復(fù)制子。 根據(jù) 功能和用途 不同載體可分為 克隆載體 、 表達(dá)載體 (標(biāo)簽載體、分泌載體 )、 測(cè)序載體 、 轉(zhuǎn)化載體 、 多功能載體 等。存在于 細(xì)菌 (最廣泛 )、放線菌、真菌以及一些動(dòng)植物細(xì)胞中。 大多數(shù)質(zhì)粒載體的復(fù)制起始區(qū)都來源于 pMB1質(zhì)粒 ,正常情況下在宿主細(xì)胞中可維持至少 15個(gè)拷貝。 質(zhì)粒的轉(zhuǎn)移性 質(zhì)粒的轉(zhuǎn)移性 是指質(zhì)粒從一個(gè)細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)胞的特性。 ③具有兩種以上的選擇標(biāo)記基因; ④缺失 mob基因或 nic位點(diǎn); ⑤插入外源基因的重組質(zhì)粒較易導(dǎo)入宿主細(xì)胞并復(fù)制和表達(dá)。 優(yōu)點(diǎn): a、失去了 pBR322的HaeII的兩個(gè)片段,分子量更小,拷貝數(shù)高 pBR322的~3倍; b、失去了 nic位點(diǎn),更安全。 α互補(bǔ) :是指載體表達(dá)的 α肽與宿主菌中 F′因子的lacZ’△ M15基因的突變產(chǎn)物結(jié)合 (α肽與突變 β半乳糖苷酶的 C端片段結(jié)合 )形成具有酶活性的功能蛋白質(zhì)的現(xiàn)象。 E c o S ac Kp n S m a B am X b a S al P s t S p h Hi nRI I I I HI I I I I d I I IpU C 1 8pU C 1 9Hi n S p h P s t S al Xba B am S m a K p n S ac E c od I I I
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