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生物化學(xué)與分子生物學(xué)復(fù)習(xí)歸納筆記-全文預(yù)覽

  

【正文】 血性貧血。 九、磷酸戊糖途徑的生理意義: 1. 是體內(nèi)生成 NADPH 的主要代謝途徑: NADPH在體內(nèi)可用于: ⑴ 作為供氫體,參與體內(nèi)的合成代謝:如參與合成脂肪酸、膽固醇等。 八、磷酸戊糖途徑: 磷酸戊糖途徑是指從 G6P脫氫反應(yīng)開始,經(jīng)一系列代謝反應(yīng)生成磷酸戊糖等中間代謝物,然后再重新進(jìn)入糖氧化分解代謝途徑的一條旁路代謝途徑。 七、有氧氧化的調(diào)節(jié)和巴斯德效應(yīng): 丙酮酸脫氫酶系受乙酰 CoA、 ATP和 NADH的變構(gòu)抑制,受 AMP、 ADP和 NAD+的變 構(gòu)激活。 ⑦ 三羧酸循環(huán)的關(guān)鍵酶是檸檬酸合酶、異檸檬酸脫氫酶和 α 酮戊二酸脫氫酶系,且 α 酮戊二酸脫氫酶系的結(jié)構(gòu)與丙酮酸脫氫酶系相似,輔助因子完全相同。 ③ 循環(huán)的中間產(chǎn)物既不能通過(guò)此循環(huán)反應(yīng)生成,也不被此循環(huán)反應(yīng)所消耗。這一循環(huán)反應(yīng)過(guò)程又稱為檸檬酸循環(huán)或 Krebs循環(huán)。丙酮酸脫氫酶系為關(guān)鍵酶,該酶由三種酶單體構(gòu)成,涉及六種輔助因子,即 NAD+、 FAD、 CoA、 TPP、硫辛酸和 Mg2+。 NADH在有氧條件下可進(jìn)入線粒體產(chǎn)能,共可得到 22 或 23 分子 ATP。絕大多數(shù)組織細(xì)胞通過(guò)糖的有氧氧化途徑獲得能量。己糖激酶的變構(gòu)抑制劑是 G6P;肝中的葡萄糖激酶是調(diào)節(jié)肝細(xì)胞對(duì)葡萄糖吸收的主要因素,受長(zhǎng)鏈脂酰 CoA的反饋抑制; 6磷酸果糖激酶 1是調(diào)節(jié)糖酵解代謝途徑流量的主要因素,受 ATP和檸檬酸的變構(gòu)抑制, AMP、 ADP、 1,6雙磷酸果糖和 2,6雙磷酸果糖的變構(gòu)激活;丙酮酸激酶受 1,6雙磷酸果糖的變構(gòu)激活,受 ATP的變構(gòu)抑制,肝中還受到丙氨酸的變構(gòu)抑制。丙酮酸激酶為關(guān)鍵酶。這一階段需消耗兩分子 ATP,己糖激酶(肝中為葡萄糖激酶)和 6磷酸果糖激酶 1是關(guān)鍵酶。 ④ 轉(zhuǎn)變?yōu)槠渌镔|(zhì):糖類可經(jīng)代謝而轉(zhuǎn)變?yōu)橹净虬被岬然衔铩? 2.酶的分類:根據(jù) 1961年國(guó)際酶學(xué)委員會(huì)( IEC)的分類法,將酶分為六大類: ① 氧化還原酶類:催化氧化還原反應(yīng); ② 轉(zhuǎn)移酶類:催化一個(gè)基團(tuán)從某種化合物至另一種化合物; ③ 水解酶類:催化化合物的水 解反應(yīng); ④ 裂合酶類:催化從雙鍵上去掉一個(gè)基團(tuán)或加上一個(gè)基團(tuán)至雙鍵上; ⑤異構(gòu)酶類:催化分子內(nèi)基團(tuán)重排; ⑥ 合成酶類:催化兩分子化合物的締合反應(yīng)。 乳酸脫氫酶同工酶( LDHs)為四聚體,在體內(nèi)共有五種分子形式,即 LDH1( H4), LDH2( H3M1),LDH3( H2M2), LDH4( H1M3)和 LDH5( M4)。 ⑵ 酶蛋白降 解的調(diào)節(jié):如饑餓時(shí),精氨酸酶降解減慢,故酶活性增高,有利于氨基酸的分解供能。這是機(jī)體內(nèi)遲緩調(diào)節(jié)的重要方式。酶原的激活過(guò)程通常伴有酶蛋白一級(jí)結(jié)構(gòu)的改變。共價(jià)修飾調(diào)節(jié)一般與激素的調(diào)節(jié)相聯(lián)系,其調(diào)節(jié)方式為級(jí)聯(lián)反應(yīng)。變構(gòu)劑一般以反饋方式對(duì)代謝途徑的起始關(guān)鍵酶進(jìn)行調(diào)節(jié),常見(jiàn)的為負(fù)反饋調(diào)節(jié)。某些代謝物能與變構(gòu)酶分子上的變構(gòu)部位特異性結(jié)合,使酶的分子構(gòu)發(fā)生改變,從而改變酶的催化活性以及代謝反應(yīng)的速度,這種調(diào)節(jié)作用就稱為變構(gòu)調(diào) 節(jié)。 酶活性的調(diào)節(jié)可以通過(guò)改變其結(jié)構(gòu)而使其催化活性以生改變,也可以通過(guò)改變其含量來(lái)改變其催化活性,還可以通過(guò)以不同形式的酶在不同組織中的分布差異來(lái)調(diào)節(jié)代謝活動(dòng)。其特點(diǎn)為: ; 酶與底物的結(jié)合無(wú)影響,故底物濃度的改變對(duì)抑制程度無(wú)影響; : Km值不變, Vm 值降低。典型的例子是丙二酸對(duì)琥珀酸脫氫酶(底物為琥珀酸)的競(jìng)爭(zhēng)性抑制和磺胺類藥物(對(duì)氨基苯磺酰胺)對(duì)二氫葉酸合成酶(底物為對(duì)氨基苯甲酸)的競(jìng)爭(zhēng)性抑制。如果以 ν ~ [E]作圖,可得到一組隨抑制劑濃度增加而斜率降低的直線。 ⑴ 不可逆抑制作用: 抑制劑與酶分子的必需基團(tuán)共價(jià)結(jié)合引起酶活性的抑制,且不能采用透析等簡(jiǎn)單方法使酶活性恢復(fù)的抑制作用就是不可逆抑制作用。人體內(nèi)大多數(shù)酶的最適 pH在 ~ 之間。酶的最適溫度與實(shí)驗(yàn)條件有關(guān),因而它不是酶的特征性常數(shù)。 ⑷Km 和 Vmax的測(cè)定:主要采用 LineweaverBurk雙倒數(shù)作圖法和 Hanes作圖法。 ④Km 是酶的特征性常數(shù):在一定條件下,某種酶的 Km 值是恒定的,因而可以通過(guò)測(cè)定不同酶(特別是一組同工酶)的 Km值,來(lái)判斷是否為不同的酶。因此, Km 等于酶促反應(yīng)速度達(dá)最大值一半時(shí)的底物濃度。 ⑵ 米氏方程及米氏 常數(shù):根據(jù)上述實(shí)驗(yàn)結(jié)果, Michaelis amp。 2.與酶的高效率催化有關(guān)的因素: ① 趨近效應(yīng)與定向作用; ② 張力作用; ③ 酸堿催化作用; ④ 共價(jià)催化作用; ⑤ 酶活性中心的低介電區(qū)(表面效應(yīng))。 ⑶ 立體異構(gòu)特異性:一種酶只能作用于一種立體異構(gòu)體,或只能生成一種立體異構(gòu)體,稱為立體異構(gòu)特異性,如 L精氨酸酶。酶能與底物形成 ES 中間復(fù)合物,從而改變化學(xué)反應(yīng)的進(jìn)程,使反應(yīng)所需活化能閾大大降低,活化分子的數(shù)目大大增加,從而加速反應(yīng)進(jìn)行。 五、酶的活性中心: 酶分子上具有一定空間構(gòu)象的部位,該部位化學(xué)基團(tuán)集中,直接參與將底物轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物的反應(yīng)過(guò)程,這一部位就稱為酶的活性中心。脫氧腺苷鈷胺素、甲基鈷胺素等。 7. FH4:由葉酸衍生而來(lái)。磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺可作為氨基轉(zhuǎn)移酶,氨 基酸脫羧酶,半胱氨酸脫硫酶等的輔酶。 FMN或 FAD通常作為脫氫酶的輔基,在酶促反應(yīng)中作為遞氫體(雙遞氫體)。 維生素可按其溶解性的不同分為脂溶性維生素和水溶性維生素兩大類。 三、輔酶與輔基的來(lái)源及其生理功用: 輔酶與輔基的生理功用主要是: ⑴ 運(yùn)載氫原子或電子,參與氧化還原反應(yīng)。 二、酶的分子組成: 酶分子可根 據(jù)其化學(xué)組成的不同,可分為單純酶和結(jié)合酶(全酶)兩類。凡能從多核苷酸鏈的末端開始水解核酸的酶稱為核酸外切酶,凡能從多核苷酸鏈中間開始水解核酸的酶稱為核酸內(nèi)切酶。不同來(lái)源的,具有大致相同互補(bǔ)堿基順序的核酸片段稱為同源順序。 Tm的高低與 DNA分子中 G+C的含量有關(guān), G+C 的含量越高,則 Tm越高。 十、 DNA的變性: 在理化因素作用下, DNA雙螺旋的兩條互補(bǔ)鏈松散而分開成為單鏈,從而導(dǎo)致 DNA的理化性質(zhì)及生物學(xué)性質(zhì)發(fā)生改變,這種現(xiàn)象稱為 DNA的變性。原核生物中的 rRNA有三種: 5S, 16S, 23S。 ③ 反密碼臂:其反密碼環(huán)中部的三個(gè)核苷酸組成三聯(lián)體,在蛋白質(zhì)生物合成中,可以用來(lái)識(shí)別 mRNA上相應(yīng)的密碼,故稱為反密碼( anticoden)。 mRNA分子中每三個(gè)相鄰的核苷酸組成一組,在蛋白質(zhì)翻譯合成時(shí)代表一個(gè)特定的氨基酸,這種核苷酸三聯(lián)體稱為遺傳密碼( coden)。 RNA通常以單鏈存在,但也可形成局部的雙螺旋結(jié)構(gòu)。 DNA分子中具有特定生物學(xué)功能的片段稱為基因( gene)。 絕大多數(shù)原核生物的 DNA都是共價(jià)封閉的環(huán)狀雙螺旋,其三級(jí)結(jié)構(gòu)呈麻花狀。 RNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)就是指 RNA分子中核糖核苷酸的種類、數(shù)目、排列順 序及連接方式。核酸具有方向性, 5’ 位上具有自由磷酸基的末端稱為 5’ 端, 3’ 位上具有自由羥基的末端稱為3’ 端。 此外,生物體內(nèi)還存在一些特殊的環(huán)核苷酸,常見(jiàn)的為環(huán)一磷酸腺苷( cAMP)和環(huán)一磷酸鳥苷( cGMP),它們通常是作為激素作用的第二信使。假尿苷( ψ )就是由 D核糖的 C1’ 與尿嘧啶的 C5相連而生成的核苷。 3.核苷:核苷是由戊糖與含氮堿基經(jīng)脫水縮合而生成的化合物。 第三章 核酸的結(jié)構(gòu)與功能 一、核酸的化學(xué)組成: 1.含氮堿:參與核酸和核苷酸構(gòu)成的含氮堿主要分為嘌呤堿和嘧啶堿兩大類。 5.超速離心:利用物質(zhì)密度的不同,經(jīng)超速離心后,分布于不同的液層而分離。電泳遷移率的大小主要取決于蛋白質(zhì)分子所帶電荷量以及分子大小。常用的中性鹽有:硫酸銨、氯化鈉、硫酸鈉等。 4.蛋白質(zhì)的變性:蛋白質(zhì)在某些理化因素的作用下,其特定的空間結(jié)構(gòu)被破壞而導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變及生物活性喪失 ,這種現(xiàn)象稱為蛋白質(zhì)的變性。蛋白質(zhì)分子所帶正、負(fù)電荷相等時(shí)溶液的 pH值稱為蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。其維系鍵主要是非共價(jià)鍵(次級(jí)鍵):氫鍵、疏水鍵、范德華力、離子鍵等,也可涉及二硫鍵。 ⑶β 轉(zhuǎn)角:多肽鏈 180176。 2.二級(jí)結(jié)構(gòu):指多肽鏈主鏈骨架盤繞折疊而形成的構(gòu)象,借氫鍵維系。 四、蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu): 蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)可人為分為一級(jí)、二級(jí)、三級(jí)和四級(jí)結(jié)構(gòu)等層次。 二、 肽鍵與肽鏈: 肽鍵 (peptide bond)是指由一分子氨基酸的 α 羧基與另一分子氨基酸的 α 氨基經(jīng)脫水而形成的共價(jià)鍵 (CONH)。 5.遺傳與繁殖:對(duì)生物體遺傳與繁殖的分子機(jī)制的研究,也是現(xiàn)代生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究的一個(gè)重要內(nèi)容。 2.物質(zhì)代謝:物質(zhì)代謝的基本過(guò)程主要包括三大步驟:消化、吸收 → 中間代謝 → 排泄。 2.動(dòng)態(tài)生物化學(xué)階段:是生物化學(xué)蓬勃發(fā) 展的時(shí)期。 二、生物化學(xué)的發(fā)展: 1.?dāng)⑹錾锘瘜W(xué)階段:是生物化學(xué)發(fā)展的萌芽階段,其主要的工作是分析和研究生物體的組成成分以及生物體的分泌物和排泄物。 三、生物化學(xué)研究的主要方面: 1.生物體的物質(zhì)組成:高等生物體主要由蛋白質(zhì)、核酸、糖類、脂類以及水、無(wú)機(jī)鹽等組成,此外還含有一些低分子物質(zhì)。 4.生物分子的結(jié)構(gòu)與功能:通過(guò)對(duì)生物大分子結(jié)構(gòu)的理解,揭示結(jié)構(gòu)與功能之間的關(guān)系。 2.分類:根據(jù)氨基酸的 R基團(tuán)的極性大小可將氨基酸分為四類: ① 非極性中性氨基酸 (8 種 );② 極性中性氨基酸 (7 種 ); ③ 酸性氨基酸 (Glu和 Asp); ④ 堿性氨基酸 (Lys、 Arg和 His)。 三、肽鍵平面 (肽單位 ): 肽鍵具有部分雙鍵的性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn);組成肽鍵的四個(gè)原子及其相鄰的兩個(gè) α 碳原子處在同一個(gè)平面上,為剛性平面結(jié)構(gòu),稱為肽鍵平面。蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)決定其空間結(jié)構(gòu)。 ⑵β 折疊:其結(jié)構(gòu)特征為: ① 若干條肽鏈或肽段平行或反平行排列成片; ② 所有肽鍵的 C=O和N— H形成鏈間氫 鍵; ③ 側(cè)鏈基團(tuán)分別交替位于片層的上、下方。 3.三級(jí)結(jié)構(gòu):指多肽鏈所有原子的空間排布。 五、 蛋白質(zhì)的理化性質(zhì): 1.兩性解離與等電 點(diǎn):蛋白質(zhì)分子中仍然存在游離的氨基和游離的羧基,因此蛋白質(zhì)與氨基酸一樣具有兩性解離的性質(zhì)。 3.蛋白質(zhì)的紫外吸收:蛋白質(zhì)分子中的色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸殘基對(duì)紫外光有吸收,以色氨酸吸收最強(qiáng),最大吸收峰為 280nm。 六、蛋白質(zhì)的分離與純化: 1.鹽析與有機(jī)溶劑沉淀:在蛋白質(zhì)溶液中加入大量中性鹽,以破壞蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì),使蛋白質(zhì)從溶液中沉淀析出,稱為鹽析。 2.電泳:蛋白質(zhì)分子在高于或低于其 pI的溶液中帶凈的負(fù)或正電荷,因此在電場(chǎng)中可以移動(dòng)。主要有離子交換層析,凝膠層析,吸附層析及親和層析等,其中凝膠層析可用于測(cè)定蛋白質(zhì)的分子量。一般采用 Edman降解法,用異硫氰酸苯酯進(jìn)行反應(yīng),將氨基酸 降解后,逐一進(jìn)行測(cè)定; 7. 至少用兩種不同的方法處理蛋白質(zhì),分別得到其肽段的氨基酸順序; 8. 將兩套不同肽段的氨基酸順序進(jìn)行比較,以獲得完整的蛋白質(zhì)分子的氨基酸順序。 2.戊糖:核苷酸中 的戊糖主要有兩種,即 β D核糖與 β D2脫氧核糖,由此構(gòu)成的核苷酸也分為核糖核苷酸與脫氧核糖核酸兩大類。由 “ 稀有堿基 ” 所生成的核苷稱為 “ 稀有核苷 ” 。 5’ 核苷酸又可按其在 5’ 位縮合的磷酸基的多少,分為一磷酸核苷(核苷酸)、二磷酸核苷和三磷酸核苷。 三、核酸的一級(jí)結(jié)構(gòu): 核苷酸通過(guò) 3’,5’ 磷酸二酯鍵連接起來(lái)形成的不含側(cè)鏈的多核苷酸長(zhǎng)鏈化合物就稱為核酸。 RNA由 AMP, GMP, CMP, UMP四種核糖核苷酸組成。 五、 DNA的超螺旋結(jié)構(gòu): 雙螺旋的 DNA分子進(jìn)一步盤旋形成的超螺旋結(jié)構(gòu)稱為 DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)。 六、 DNA的功能: DNA的 基本功能是作為遺傳信息的載體,為生物遺傳信息復(fù)制以及基因信息的轉(zhuǎn)錄提供模板。 七、 RNA的空間結(jié)構(gòu)與功能: RNA分子的種類較多,分子大小變化較大,功能多樣化。 mRNA的功能是為蛋白質(zhì)的合成提供模板,分子中帶有遺傳密碼。 ②DHU 臂:含有二氫尿嘧啶核苷,與氨基酰 tRNA合成酶的結(jié)合有關(guān)。 3. rRNA的結(jié)構(gòu)與功能: rRNA是細(xì)胞中含量最多的 RNA,可與蛋白質(zhì)一起構(gòu)成核蛋白體,作為蛋白質(zhì)生物合 成的場(chǎng)所。 九、核酸的一般理化性質(zhì): 核酸具有酸性;粘度大;能吸收紫外光,最大吸收峰為 260nm。 加熱 DNA溶液,使其對(duì) 260nm紫外光的吸收度突然增加,達(dá)到其最大值一半時(shí)的溫度,就是 DNA的變性溫度(融解溫度, Tm)。核酸雜交可以是 DNADNA,也可以是 DNARNA雜交。 十二、核酸酶: 凡是能水解核酸的酶都稱為核酸酶。酶按照其分子結(jié)構(gòu)可分為單體酶、寡聚酶和多酶體系(多酶復(fù)合體和多功能酶)三大類。與酶蛋白牢固結(jié)合并與酶的催化活性有關(guān)的耐熱低分子有機(jī)化合物稱為輔基。 維生
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