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基因敲除對黃酒酵母高級醇生成量的影響畢業(yè)論文(文件)

2025-07-11 04:30 上一頁面

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【正文】 的橡皮塞塞緊瓶口,置于30℃條件下靜置發(fā)酵,在黃酒發(fā)酵過程中每隔12 h稱重一次,稱重前充分晃動三角瓶中的發(fā)酵液以盡可能趕走瓶中CO2, 當發(fā)酵失重小于1 g/12 h時,表明黃酒發(fā)酵已經(jīng)基本結(jié)束。當量筒中蒸餾液滴至98 mL左右時停止蒸餾,然后再用蒸餾水補足至100 mL即可。(2)斐林試劑的標定分別吸取斐林試劑甲液和乙液各5 mL,并置于150 mL三角瓶中,然后準確地加入10 mL空白液(蒸餾水),%標準葡萄糖溶液,%標準葡萄糖溶液是在1 mL以內(nèi),搖勻。(1)色譜條件氣相色譜儀為Agilent 7890C,并且配置有Agilent G4512A自動進樣器,色譜柱為 HPINNOWAX Polyethylene Glyco 30 m320 μm μm ,檢測器為FID。升溫程序:起始柱溫設(shè)置為50℃,并以5℃ /min的升溫速度上升至80℃,然后再以10℃/min升溫升至150℃。然后再進酒樣進行檢測,就可以根據(jù)各物質(zhì)的保留時間初步定性酒樣中需要檢測的各物質(zhì)。(3)以培養(yǎng)時間為橫坐標,OD600為縱坐標,繪制菌株的生長曲線。根據(jù)質(zhì)粒pUG6序列設(shè)計一對引物KU和KD擴增KanMX基因,作為抗性篩選標記。在HOM2基因外部的上下游分別設(shè)計一對引物HAU和HAD及HBU和HBD,分別擴增HOM2基因兩側(cè)非編碼區(qū)的片段HA和HB,用于同源重組敲除HOM2基因。表24 PCR反應(yīng)引物Table 24 PCR primers used in this studyPrimer nameSequence (5′→3′)Restriction siteBAT1U5′ CATGTTGCAGAGACATTCCTTG3′NoneBAT1D5′ CATTAGTTCAAGTCGGCAACAG3′NoneBAU5′CCGGAATTCATACCGGCTGTCGCTATTATTACTG3′EcoRIBAD5′CGCGGATCCCAACTTCAAGGAATGTCTCTGCAAC 3′BamHIBBU5′CGCGGATCCGTAACTGGTCAAAAACTGTTGCCGA3′BamHIBBD5′TGCACTGCAGCAGCGAGATACCTTGGCAACTAAAT3′PstIBS5′GCATATCTGCTCAAGTAGACAAGG3′NoneKSBAT15′GGGCAATCAGGTGCGACAATCTA3′NoneKXBAT15′CAGCCAGTTTAGTCTGACCATCTC3′NoneBX5′CTGTATGCCACGATGATGGAAGG3′NoneHOM2U5′ TGGGTGCTACTGGTTCCGTTGGT3′NoneHOM2D5′ GGCAATCAAGACACCAGAACCAGC3′NoneHAU5′CCCAAGCTTGCAGCAGCCTTGCCCTTTTACAC3′Hind III HAD5′CGCGGATCC ACCAACGGAACCAGTAGCACCCA 3′BamHIHBU5′CGCGGATCC GGTTCTGGTGTCTTGATTGCCGAAATC3′BamHIHBD5′CGGGGTACCACAGTGCTATTGTGAGTGTATCCCAGC3′KpnIHS5′GCTAAACACGCCTGTGGTCATTC3′NoneKS15′CGGATAAAATGCTTGATGGTCGGA3′NoneKX15′CGGTTGCATTCGATTCCTGTTTGT3′NoneHX5′GGAAGGCACTACTGAGCCAAATG3′NoneHA1U5′CCCAAGCTTGCTGGTGTTTTGGGTGCTACTG3′Hind III HA1D5′CGCGGATCCCGATAGCGCCAGCATAGTCAGC 3′BamHIHB1U5′CGCGGATCCCAAGAACAGACCTGCTCCATCC 3′BamHIHB1D5′CCGGAATTCATCAAGACACCAGAACCAGCGG3′EcoRIKS25′GGGCAATCAGGTGCGACAATCTA3′NoneKX25′CAGCCAGTTTAGTCTGACCATCTC3′NoneKanU5′CGCGGATCCCAGCTGAAGC TTCGTACGC3′BamHIKanD5′CGCGGATCCGCATAGGCCACTAGTGGATCTG3′BamHIZeocinU5′ATCGTCGACCCCACACACCATAGCTTCA3′NoneZeocinD5′GCGGTCGACAGCTTGCAAATTAAAGCCTT3′None 各目的基因片段的獲得 酵母基因組DNA的提取采用solarbio酵母基因組DNA提取試劑盒提取。(4)向上述沉淀中加入200 μL溶液A,并用槍頭吹吸以充分懸浮沉淀,然后向懸浮液中加入20 μL(10 mg/mL)的RNaseA,并充分顛倒混勻,于室溫放置10 min。(8)向吸附柱中加入700 μL的漂洗液(在使用之前應(yīng)先檢查是否已經(jīng)加入無水乙醇),12000 rpm離心1 min,棄掉廢液,將吸附柱重新放入收集管中。(12)將上述離心所得洗脫液再重新加入到吸附柱中,室溫靜置5 min,12000 rpm離心2 min,即得到高質(zhì)量的基因組DNA。mol/L) 1 μL模板 μL/基因組1 μLLATaq酶 μLddH2O Add to 20 μL(2)PCR反應(yīng)條件見表26。(2)將完全溶解的瓊脂糖倒入制膠模具,~ cm,然后迅速地在模具一端插上梳子,并檢查有無氣泡。(6)接通電泳槽與電泳儀的電源,然后將電壓降選擇1~5 V/cm。 (2)然后向EP管中加入4~5倍體積的Buffer CP,用移液槍充分吹吸混勻后,再將其轉(zhuǎn)移到藍色的回收柱中。 (6)將吸附柱開蓋敞于室溫放置20 min左右,去除殘留乙醇。3)將上述培養(yǎng)菌液按1%的比例轉(zhuǎn)接至裝有200 mL新鮮LB液體培養(yǎng)基的500 mL三角瓶中,37℃,220 rpm培養(yǎng)3h左右。7)向菌體沉淀中加入40 mL冰浴的 Solution B,輕輕晃動以懸浮菌體沉淀,禁止劇烈振蕩浮。2)加入連接產(chǎn)物10 μL,輕輕混勻,冰浴30 min。 質(zhì)粒提?。?)粗提1)從LB平板上挑取單菌落于裝有LB液體培養(yǎng)基的試管中,37℃,200 rpm過夜培養(yǎng)。5)12000 rpm離心5 min以上,取其上清,進行電泳驗證。3)向EP管中加入250 μL溶液II,并溫和地上下翻轉(zhuǎn)6~8次,從而使菌體充分裂解。7)再向吸附柱中加入500 μL的漂洗液,然后12000 rpm離心1 min,倒掉收集管中的廢液,并將吸附柱重新放進收集管中。11)離心管中的液體即為提取的質(zhì)粒,20℃保存?zhèn)溆?。將去磷酸化后的產(chǎn)物按照PCR產(chǎn)物純化回收的步驟進行回收,然后置于20℃保存。3)將菌液轉(zhuǎn)至50 mL無菌離心管中,5000 rpm離心5 min,棄除上清液,再用25 mL無菌水洗滌兩次,并棄去上清;4)用1 mL mol/L的LiAc緩沖液重新懸浮酵母菌體, mL的EP管中。4)30℃恒溫箱中保溫30 min。 G418抗性基因的去除本研究擬采用CreLoxP報告基因挽救系統(tǒng)[8081],來剔除報告基因KanMX。(2)一級種子培養(yǎng):取活化的斜面菌種一環(huán),接種于裝有5 mL麥汁培養(yǎng)基的試管中,30℃恒溫箱中靜置培養(yǎng)12 h。3 結(jié)果與討論 BAT1基因敲除對黃酒酵母高級醇生成量的影響 BAT1基因的驗證以提取的黃酒酵母基因組為模板,以BAT1U和BAT1D為引物,通過PCR擴增出基因片段,電泳結(jié)果顯示PCR擴增產(chǎn)物較單一,特異性條帶大小為1182 bp,與BATI基因大小一致,證明黃酒酵母基因組上存在完整的BAT1基因(圖31)。將純化后的BB片段用BamHI和PstI 進行雙酶切,與經(jīng)同樣酶切后的pUCBA連接,構(gòu)建重組質(zhì)粒pUCBAB。 圖34 重組質(zhì)粒pUCBA、pUCBAB和pUCBABK的酶切驗證 Restriction endonuclease analysis of rebinant plasmids pUCBA, pUCBAB and pUCBABKM:DL5000 DNA marker;1:pUCBA/EcoRIBamHI;2:pUCBAB/PstIBamHI;3:pUCBABK/BamHI BAT1基因敲除突變株的獲得及驗證 重組片段的獲得以構(gòu)建好的重組質(zhì)粒pUCBABK為模板,利用引物BAU和BBD擴增2207 bp的重組片段BAKanMXBB,電泳檢測目的片段,結(jié)果如圖35。若基因片段BAKanMXBB已整合到出發(fā)菌株的染色體中,則會在含有600 μg/ml G418抗性的YEPD平板上生長。圖37 BAT1基因敲除突變株的PCR驗證 PCR confirmation of mutant strain RY1a1?bat1M.:DL5000 DNA marker;1:以RY1a1的基因組為模板,以BS和KSBAT1為引物進行PCR擴增的產(chǎn)物;2:以RY1a1?bat1的基因組為模板,以BS和KSBAT1為引物進行PCR擴增的產(chǎn)物;3:以RY1a1的基因組為模板,以BX和KXBAT1為引物進行PCR擴增的產(chǎn)物;4:以RY1a1?bat1的基因組為模板,以BX和KXBAT1為引物進行PCR擴增的產(chǎn)物 BAT1基因敲除對黃酒酵母高級醇生成量的影響 BAT1基因敲除突變株與出發(fā)菌株基本發(fā)酵性能的比較將構(gòu)建好的BAT1基因敲除突變株RY1a1?batRY1α3?bat1與出發(fā)菌株同時進行黃酒發(fā)酵實驗,發(fā)酵過程中記錄CO2失重情況,發(fā)酵結(jié)束后測量發(fā)酵液中的殘?zhí)呛?,蒸餾發(fā)酵液并測量其酒精含量,結(jié)果見表31所示。表32 BAT1基因敲除突變株與出發(fā)菌株高級醇生成量比較Table 32 Higher alcohols production of BAT1 mutant strains and parent strains菌株正丙醇(mg/L)異丁醇(mg/L)異戊醇(mg/L)RY1a1RY1α3RY1a1?bat1RY1α3?bat1從表中可以看出,出發(fā)菌株RY1a1產(chǎn)正丙醇、 mg/L、 mg/ mg/L,突變株RY1a1?bat1產(chǎn)正丙醇、 mg/L、 mg/。發(fā)酵結(jié)果說明敲除BAT1基因?qū)S酒酵母基本發(fā)酵性能無明顯影響。根據(jù)釀酒酵母基因組上重組位點兩端的基因序列和插入片段的序列,分別設(shè)計兩組上下游引物BS和KSBATKXBAT1和BX用以驗證轉(zhuǎn)化子。 圖35重組片段BAKanMXBB的PCR產(chǎn)物 PCR rebinant fragment BAKanMXBBM:DL5000 DNA Marker;1:BAKanMXBB 突變株的獲得及驗證將重組片段BAKanMXBB的PCR產(chǎn)物回收,然后通過醋酸鋰轉(zhuǎn)化法將重組片段分別導(dǎo)入黃酒酵母單倍體RY1a1與RY1α3,通過BA片段和BB片段與酵母染色體上BAT1基因兩側(cè)的同源序列同時發(fā)生同源重組(圖36),從而整合到酵母染色體上并隨其一起復(fù)制,重組過程實現(xiàn)了BAT1基因被KanMX基因完全替換,從而實現(xiàn)BAT1基因的敲除,KanMX基因的引入使突變株產(chǎn)生G418抗性,可以作為篩選標記。 圖32 BA、BB和KanMX基因片段的PCR產(chǎn)物 PCR product of BA, BB and KanMX fragmentM:DL5000 DNA Marker;1:BA;2:BB;3:KanMX圖33 重組質(zhì)粒pUCBABK的構(gòu)建流程圖 Construction of rebinant plasmid pUCBABK 重組質(zhì)粒的驗證根據(jù)重組質(zhì)粒pUCBABK的構(gòu)建流程,分別將重組質(zhì)粒pUCBA、pUCBAB和pUCBABK進行酶切驗證,電泳結(jié)果如圖34。擴增出的DNA片段均與預(yù)期大小一致(BA:277 bp;BB:317 bp;KanMX:1613 bp),說明PCR擴增結(jié)果都正確。 黃酒發(fā)酵將30 ml二級種子液接種到加有100 g 大米(煮熟并攤涼)、10 g麥曲、45 mL米漿水和60 mL清水的500 mL直口三角瓶內(nèi),塞上插有針孔的橡膠塞,置于30℃培養(yǎng)箱中發(fā)酵6 d。待培養(yǎng)出單菌落之后,將單菌落對應(yīng)點接到無抗性的YEPD平板和含有G418抗性的YEPD平板上,置于30℃恒溫條件下培養(yǎng)2~4 d,挑取在無抗性YEPD平板上生長而在含G418抗性平板上不生長的菌落進行PCR擴增,然后進行瓊脂糖凝膠電泳,驗證轉(zhuǎn)化子的KanMX基因是否去除。6)13000 rpm離心30 s,去除上層轉(zhuǎn)化液,然后加入1 ml YEPD重新懸浮菌體,30℃100 rpm振蕩培養(yǎng)4 h。(2)轉(zhuǎn)化1)將1 mL鮭魚精DNA煮沸5 m
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