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正文內(nèi)容

分子遺傳學(xué)基因組及基因組學(xué)-wenkub

2023-05-14 05:05:26 本頁面
 

【正文】 ana) 119 25,498 水稻 ( Oryza sativa) 466 ~ 40,000 黑腹果蠅 ( Drosophila melanogaster) 165 13,601 秀 麗線蟲 ( Caenorhabditis elegans) 97 18,424 人( Homo sapiens) 3,300 20,00025,000 楊樹 (Populus trichocarpa) 485177。 生物體的單倍體基因組所含 DNA的總量稱為 C值( 單位為: DNA pg或 bp或 Kb或 Mb/某個單倍體基因組 ) 。內(nèi)含子中還有另一段識別剪接邊界必不可少的序列稱為分枝點 (branch site),位于 3?端剪接位的上游,具有特征性序列組成: YNCURAY, 緊接在分枝點的下游有一段多嘧啶序列,也是參與剪接事件蛋白接合的位置。研究真核生物 mRNA的內(nèi)含子后發(fā)現(xiàn),其兩側(cè)邊界均有一對保守順序,即 5?端為 GU, 3?端為 AG,這類稱為 GUAG的內(nèi)含子均以相同方式剪切。這是因為該噬菌體僅能整合在供體菌染色體 DNA 的特定位置(半乳糖基因 與生物素基因)上。誤將宿主細胞殘留的 DNA片段裝入噬菌體的外殼蛋白中,成為一個轉(zhuǎn)導(dǎo)性的噬菌體。 轉(zhuǎn)化 也稱遺傳轉(zhuǎn)化( geic transformation)是指同源或異源的游離 DNA分子(質(zhì)粒和染色體 DNA)被自然或人工感受態(tài)細胞攝取,并得到表達的基因轉(zhuǎn)移過程 轉(zhuǎn)導(dǎo) 是通過噬菌體感染將 DNA或 RNA轉(zhuǎn)入宿主細菌細胞并產(chǎn)生新性狀的過程。第二章 基因和基因組 2. 病毒基因組 病毒基因組的結(jié)構(gòu)多樣性 ( 1)雙鏈 DNA病毒基因組 ( 2) 單鏈 DNA病毒基因組 ( 3) 正鏈 RNA病毒基因組 ( 4) 負鏈 RNA病毒基因組 ( 5) 雙鏈 RNA病毒基因組 ( 6) 反轉(zhuǎn)錄病毒基因組 反轉(zhuǎn)錄病毒基因組的結(jié)構(gòu)與功能 重疊基因 黏性末端 末端豐余 循環(huán)排列 回文序列 末端反向重復(fù)序列 分段基因組 帽子和 poly(A)結(jié)構(gòu) 原核生物基因組 大腸桿菌基因組 coli 基因組大小為 106bp DNA分子,擬核結(jié)構(gòu); , K12 MG1655有 2584個操縱子 , 2192個操縱子中, 73%僅有 1個基因, %有 2個, %有 3個, 6%有 4個或更多個基因。 普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo) ( generalized transduction) 普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)是通過噬菌體將給體菌的任何一種遺傳標記轉(zhuǎn)入受體菌的過程。該轉(zhuǎn)導(dǎo)性噬菌體吸附到受體細菌上,并注入其內(nèi)含物,通過同源重組形成轉(zhuǎn)導(dǎo)子。在解離過程中偶然發(fā)生錯誤 就會形成攜帶 gal或 bio基因的缺陷 噬菌體,在感染受體菌后就能高效轉(zhuǎn)移這兩種基因。 在不同的真核生物中,內(nèi)含子的一致順序有不少變化。 類 型 分 布 內(nèi)含子性質(zhì)和剪接機制 轉(zhuǎn)酯內(nèi)含子 內(nèi)含子中的剪接識別位點 GU— AG內(nèi)含子 真核細胞核前體mRNA 結(jié)構(gòu)變化,自由羥基的起始供體由內(nèi)部分支點腺嘌呤提供,剪接體進行剪接,形成套索結(jié)構(gòu) AU- AC內(nèi)含子 真核細胞核前體mRNA Ⅰ 型內(nèi)含子 真核細胞核前體mRNA,細胞器 RNA,少數(shù)細菌 RNA 二級結(jié)構(gòu)保守,鳥核苷酸輔助因子是自由羥基供體,自我剪接,無套索結(jié)構(gòu)形成 Ⅱ 型內(nèi)含子 細胞器 RNA, 某些原核 RNA 二級結(jié)構(gòu)保守 ,內(nèi)部腺嘌呤是自由羥基供體,形成套索結(jié)構(gòu)中間體,自身催化剪接 Ⅲ 型內(nèi)含子 細胞器 RNA 與 Ⅱ 型內(nèi)含子類似,但較?。?100- 200bp),包含數(shù)量有限的結(jié)構(gòu)域 孿生內(nèi)含子 細胞器 RNA 多嵌合自我剪接內(nèi)含子,常為 Ⅱ型或 Ⅱ 型和 Ⅲ 型混合,經(jīng)常以特定的順序剪接 非轉(zhuǎn)酯內(nèi)含子 剪接識別涉及外顯子結(jié)構(gòu) 細胞核 tRNA內(nèi)含子 真核生物細胞核前體 tRNA 剪接機制類似于 tRNA的成熟 ——涉及剪切后的連接;沒有中間體形成 —— 內(nèi)含子以線性片段切除;需要機制核酸酶進行加工。 基因組的大小大致上與進化的復(fù)雜性有關(guān) 。 10 Mb 45,555 蜜蜂 (Apis mellifera) 262177。 復(fù)性動力學(xué)提供真核基因組序列信息 原核生物基因組 DNA多為單一序列,真核生物基因組 DNA有重復(fù)序列。 輕度重復(fù)序列 (slightly repetitive sequence) 一般在一個基因組內(nèi)有 2~ 10份拷貝,但有時 2~ 3份拷貝的 DNA序列也被視作非重復(fù)序列。真核生物基因組中來源相同、結(jié)構(gòu)相似、功能相關(guān)的一組基因稱為一個基因家族 (gene family)。 也稱為短串聯(lián)重復(fù)( short tandem repeat,STR)是由 2~ 6個核苷酸組成的重復(fù)單元串聯(lián)重復(fù)( 10~ 60次)而成的簡單重復(fù)序列,如和等,三核苷酸和四核苷酸重復(fù)相對較少。 LINEs長約 6- 7kb,在哺乳動物基因組中有 2萬~5萬個拷貝,它們組成 L1家族,主要含有反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子。真核生物核糖體( rRNA)基因簇是典型的簡單的多基因家族 ,有 18S、 、28S和 5S 等 4種 rRNA基因,前 3種主體 rRNA,與后一種5S rRNA基因分開位于不同的染色體或相同染色體的不同位置。 5bp。每個重復(fù)單元中的組蛋白基因,被轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)序列隔開,它們可以以相同的方向轉(zhuǎn)錄如海膽組蛋白基因,也可以按不同反向轉(zhuǎn)錄如果蠅組蛋白基因,但共同特點之一是這些組蛋白基因內(nèi)都無內(nèi)含子。人類 α珠蛋白基因和 β珠蛋白基因分別位于第 16號染色體和第 11號染色體上,每個基因家族都包括有功能的基因和假基因。 根據(jù)起源和結(jié)構(gòu)的不同 , 假基因一般分為兩類: 未加工的假基因 (nonprocess pseudogenes)和加工的假基因(processed pseudogenes)。因此,它們在基因組中經(jīng)常是分散的。 超基因與超基因家族 超基因 ( supergene)
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