【正文】 畢 業(yè) 設(shè) 計(jì)（論 文） 外 文 參 考 資 料 及 譯 文 譯文題目： 豬細(xì)環(huán)病毒 ORF1 全基因組的克 隆與序列分析 學(xué)生姓名： 蔣瑩 學(xué) 號(hào)： 0721115633 專 業(yè)： 動(dòng)物醫(yī)學(xué) 所在學(xué)院： 龍?bào)磳W(xué)院 指導(dǎo)教師： 張志成 職 稱： 講師 2022 年 3 月 7 日 接受手稿 標(biāo)題 :以完整基因組為依據(jù)的豬圓環(huán)病毒 1型（ Torque teno sus1 TTSuV1）和2型 （ Torque teno sus2 TTSuV2）的 遺傳變異和發(fā)展史 作者 Mart180。? Cortey, Lisa Macera, Joaquim Segal180。es, Tuija Kekarainen PII: S03781135(10)003858 DOI: doi:參考 : VETMIC 4993 出現(xiàn) VETMIC 收到日期 :2022426 修訂日期 :202298 接受日期 : 2022813 請(qǐng)?jiān)@篇文章 ： Cortey, M., Macera, L., Segal180。es, J., Kekarainen, T., Geic 以完整基因組為依據(jù)的豬圓環(huán)病毒 1型（ Torque teno sus1 TTSuV1）和 2型（ Torque teno sus2 TTSuV2）的 遺傳變異和發(fā)展史 ,獸醫(yī)微生物學(xué) (2022), doi:，未經(jīng)編輯的文稿PDF文件 作為我們的客戶服務(wù)，我們提供這一手稿的早期版本。這份手稿將進(jìn)行審稿，排版，以及由此產(chǎn)生的證據(jù)審查 在其 出版之前 的 最后的形式。請(qǐng)注意，在 出版 過程中 可能會(huì)被發(fā)現(xiàn)的錯(cuò)誤會(huì)影響其內(nèi)容 ， 并且所有的法律免責(zé)聲明都適用于該雜志的涉及部分。 以完整基因組為依據(jù)的豬圓 環(huán)病毒 1型（ Torque teno sus1 TTSuV1）和 2型（ Torque teno sus2 TTSuV2）的 遺傳變異和發(fā)展史 由 Mart237。 Cortey1, Lisa Macera1,2, Joaquim Segal233。s, Tuija Kekarainen， Centre de Recerca en Sanitat Animal Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA), UABIRTA, Campus de la Universitat ut242。noma de Barcelona, 08193 Bellaterra, Barcelona, Spain. Retrovirus Centre and Virology Section, Department of Experimental Pathology,University of Pisa, . AbetoneBrennero 2, 56127 Pisa, de Sanitat i Anatomia Animals, Universitat Aut242。noma de Barcelona,08193 Bellaterra, Barcelona, Spain提供 。 通訊作者 通訊地址 Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA), Universitat Aut242。noma 電話 23 + 34935814620 傳真 :+ 34935814490 Email: 運(yùn)行標(biāo)題 : 豬圓環(huán)病毒 1型 和 2型 的發(fā)展史 13株豬圓環(huán)病毒 1型（ Torque teno sus1 TTSuV1）和 2型 （ Torque teno sus2 TTSuV2） 檢查得到 了 樣化和演化的豬 TTVs。 盡管根據(jù)低核苷酸的報(bào)道，這種基因結(jié)構(gòu)和轉(zhuǎn)錄的剖面圖仍和 TTVs相似。對(duì)于 TTSuV1核苷酸多樣性高于 TTSuV2，及其相互之間的碼突變方式也不同 。 種系發(fā)生和基因分析支持 TTV分裂入二個(gè)種類 。 TTSuV1表明高變異水平 (30%)，三種不同類型（第三首次描述）可能會(huì)顯示一個(gè)地理結(jié)構(gòu) 。 與此相反， TTSuV2表明變異較低水平（ 15％），并沒有什么不同類型的可描述。為同義（ DS）的非同義（ DN）的堿基比例較大的值（ DS/DN）指向一個(gè) TTV 的基因組中一定程度的選擇性約束碼。 關(guān)鍵詞： 豬圓環(huán)病毒 , Anellovirus,DNA病毒，基因組 。 多樣性 。演化 。選擇 介紹 豬細(xì)環(huán)病毒（ TTV）是一種在 Anelloviridae 科中 分類連同 TTlike Mini Virus (TTMV), and TT Midi Virus(TTMDV)的 單股環(huán)狀 DNA 病毒。 TTVs 能夠感染幾種脊椎動(dòng)物 物種（ Ng et al., 2022。 岡本 ,49 2022） Anelloviruses 目前被認(rèn)為非致病性，雖然他們已經(jīng)最近在多個(gè)病理?xiàng)l件下使人類和豬被感染 (Learly et al., 1999。 Okamoto et al., 2022。 Kekarainen et al., 2022。 Brassard et al., 2022。 Ellis et al., 2022。 Krakowka et al., 2022) 病毒粒子呈二十面體并且無包膜據(jù)道 直徑 3032 nm。主機(jī)的物種病毒基因組的長(zhǎng)度從 kb的（貓）至 kb的（人），取決于主機(jī)的物種。 高遺傳的 P 距離內(nèi)（ 30％）之間（ 50％）的物種已報(bào)告出具體 TTVs（ Jelcic et al., 2022。 56 Biagini et al., 2022。 Huang et al., 2022).）。盡管他們的高遺傳變異，基因組組織和 anelloviruses轉(zhuǎn)錄剖面相似，主要包含一個(gè)編碼開放閱讀框（ ORF1基因），層巒疊碼區(qū)，和一個(gè)非編碼區(qū)（ UTR），其中包含一個(gè) GC豐富區(qū)（ Bendinelli et al., 2022。 Biagini, 2022） 豬 TTV基因組大概 ， 到今天為止，十段來自日本，巴西，加拿大，德國(guó)和美國(guó)的全長(zhǎng)基因組都已經(jīng)被公布。（岡本等人， 2022年 。尼爾等人， 2022年 。臂章等， 2022。 Gallei等人， 2022年。黃等人。， 2022）。 核苷酸序列分析報(bào)告的認(rèn)同程度低 。 其中，導(dǎo)致豬的兩個(gè)基因小組定義為： TTV1和 TTV2（岡本等人，2022年 。尼爾等人， 2022年）。 慮到四種核苷酸同源性菌株數(shù)量的美國(guó)，無論最近已建議上傳到物種地位的兩個(gè)內(nèi)部類，豬圓環(huán)病毒品種 1（ TTSuV1）和 2（ TTSuV2），為 TTSuV1和三個(gè)亞型為 TTSuV2（黃等人。， 2022）。 TTSuV1已被描述在不同國(guó)家（ Learyet人， 1999年 。岡本等人， 2022年 ?；痰?， 2022。 Bigarr233。72等， 2022。尼爾等人， 2022年 。 Kekarainen等， 2022。 Martelli等， 2022。Gallei等人， 2022年），以及越來越多的研究已經(jīng)專門為 TTSuV2搜查。（ Bigarr233。等， 2022。尼爾等人， 2022年 。 Kekarainen等， 2022。 Brassard等， 2022。Taira等， 2022。 Gallei等， 2022。 Huang等， 2022）。而且很可能到處存在在國(guó)內(nèi)豬和野豬的體內(nèi) (Kekarainen and Segal233。s, 2022).