轉(zhuǎn)錄組rnaseq術(shù)語解釋-文庫(kù)吧
2025-03-24 04:52 本頁(yè)面
【正文】 構(gòu)優(yōu)化。13. 基因間區(qū)(intergenic)指基因與基因之間的間隔序列，不屬于基因結(jié)構(gòu)，不直接決定氨基酸，可能通過轉(zhuǎn)錄后調(diào)控影響性狀的區(qū)域。14. UTR:(UntranslateRegions)非翻譯區(qū)域。是信使 RNA（mRNA）分子兩端的非編碼片段。539。UTR從mRNA起點(diǎn)的甲基化鳥嘌呤核苷酸帽延伸至 AUG 起始密碼子，339。UTR從編碼區(qū)末端的終止密碼子延伸至多聚 A 尾巴（PolyA）的前端。15. ORF（open reading frame）開放閱讀框或開放讀碼框。是結(jié)構(gòu)基因的正常核苷酸序列，從起始密碼子到終止密碼子的閱讀框可編碼完整的多肽鏈，其間不存在使翻譯中斷的終止密碼子。16. CDS（Coding sequence）是編碼一段蛋白產(chǎn)物的序列，是結(jié)構(gòu)基因組學(xué)術(shù)語。DNA轉(zhuǎn)錄成mRNA，mRNA經(jīng)剪接等加工后翻譯出蛋白質(zhì)，所謂CDS就是與蛋白質(zhì)序列一一對(duì)應(yīng)的DNA序列，且該序列中間不含其它非該蛋白質(zhì)對(duì)應(yīng)的序列，不考慮mRNA加工等過程中的序列變化，總之，就是與蛋白質(zhì)的密碼子完全對(duì)應(yīng)。17. 插入片段大小（insert size）通過檢測(cè)雙端序列在基因組上的起止位置，可以得到插入片段的實(shí)際長(zhǎng)度，決定了測(cè)序的長(zhǎng)度，是信息分析的重要參數(shù)。18. 分子標(biāo)記是遺傳標(biāo)記的一種，直接在DNA分子上檢測(cè)遺傳變異。分子標(biāo)記能對(duì)不同發(fā)育時(shí)期的個(gè)體、組織器官甚至細(xì)胞作檢測(cè)，數(shù)量極多，遍及整個(gè)基因組，多態(tài)性高，遺傳穩(wěn)定，不受環(huán)境及基因表達(dá)與否的影響。目前常見分子標(biāo)記主要有SNP、InDel、SSR 等。19. SNP（Single Nucleotide Polymorphism）即單核苷酸多態(tài)性，主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。SNP所表現(xiàn)的多態(tài)性只涉及到單個(gè)堿基的變異，這種變異可由單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換(transition)或顛換(transversion)所引起，也可由堿基的插入或缺失所致。但通常所說的SNP并不包括后兩種情況。20. SSR（Simple Sequence Repeat，SSR）即簡(jiǎn)單重復(fù)序列，又叫微衛(wèi)星序列，指的是基因組中由16個(gè)核苷酸組成的基本單位重復(fù)多次構(gòu)成的一段DNA，廣泛分布于基因組的不同位置，長(zhǎng)度一般在200bp以下。21. 轉(zhuǎn)換(transition)同類型（嘌呤和嘌呤，或嘧啶和嘧啶）堿基之間的相互替換稱為轉(zhuǎn)換。22. 顛換(transversion)不同類型（嘌呤和嘧啶）堿基之間的相互替換稱為顛換。23. RNA編輯（RNA editing）是指在mRNA水平上改變遺傳信息的過程。具體來說，指基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的mRNA分子中，由于核苷酸的缺失，插入或置換，基因轉(zhuǎn)錄物的序列不與編碼序列互補(bǔ)，使翻譯生成的蛋白質(zhì)的氨基酸組成，不同于基因序列中的編碼信息現(xiàn)象。24. 差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄本（DifferentiallyExpresse
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