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基因芯片數(shù)據(jù)分析-閱讀頁

2025-01-08 08:29本頁面
  

【正文】 時,常用的類間度量方法(三 )k均值聚類基本思想(四 )自組織映射聚類基本思想:在不斷的學(xué)習(xí)過程中,輸出層的神經(jīng)元根據(jù)輸入樣本的特點進(jìn)行權(quán)重調(diào)整,最后拓樸結(jié)構(gòu)發(fā)生了改變 第五節(jié) 基因芯片數(shù)據(jù)的分類分析(Classification of Microarray Data )一、線性判別分類器二、 k近鄰分類法 基本思想三、決策樹(一 )基本思想n 決策樹又稱為多級分類器,利用決策樹分類可以把一個復(fù)雜的多類別分類問題轉(zhuǎn)化為若干個簡單的分類問題來解決n 決策樹的結(jié)構(gòu):一個樹性的結(jié)構(gòu),內(nèi)部節(jié)點上選用一個屬性進(jìn)行分割,每個分叉都是分割的一個部分,葉子節(jié)點表示一個分布(二 )分析步驟:提取分類規(guī)則,進(jìn)行分類預(yù)測n 在構(gòu)造決策樹的過程中最重要的一點是在每一個分裂節(jié)點確定用那個屬性來分類 (或分裂)n 這就涉及到關(guān)于使用什么準(zhǔn)則來衡量使用 A屬性比使用 B屬性更合理決策樹分類算法 output訓(xùn)練集 決策樹input(三 )衡量準(zhǔn)則n 信息增益 ——Information gainn 基尼指數(shù) ——Gini index第六節(jié) 常用的表達(dá)譜分析軟件(General Microarray Analysis Software )n ArrayTools n DChip( DNAChip Analyzer) n SAMn R語言和 BioConductor: affy、 marray、limma n Matlab: Bioinformatics Toolbox 謝謝觀看 /歡迎下載BY FAITH I MEAN A VISION OF GOOD ONE CHERISHES AND THE ENTHUSIASM THAT PUSHES ONE TO SEEK ITS FULFILLMENT REGARDLESS OF OBSTACLES. BY FAITH I BY FAI
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