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dna與rna提取方法及原理與提取方法及原理dna提取專題dna提取專題第一部分-在線瀏覽

2025-07-25 13:32本頁(yè)面
  

【正文】 的5M NaCl,高鹽可溶解多糖。 用多糖水解酶將多糖降解。 代替乙醇沉淀DNA DNA: DNA液中加入 用PEG8000代替乙醇沉淀DNA:在500μL DNA液中加入 冰浴20min 20min。 核酸分離、 核酸分離、純化多酚的去除: 多酚的去除:在抽提液中加入防止酚類氧化的試劑: 在抽提液中加入防止酚類氧化的試劑:β巰基乙醇、 巰基乙醇、 抗壞血酸、半胱氨酸、二硫蘇糖醇等 抗壞血酸、半胱氨酸、 加入易與酚類結(jié)合的試劑:如PVP、PEG(聚乙二醇),它 加入易與酚類結(jié)合的試劑: PVP、PEG(聚乙二醇) 聚乙二醇 們與酚類有較強(qiáng)的親和力,可防止酚類與DNA DNA的結(jié)合 們與酚類有較強(qiáng)的親和力,可防止酚類與DNA的結(jié)合 鹽離子的去除: 鹽離子的去除: 70% 70%的乙醇洗滌 核酸沉淀、 核酸沉淀、溶解基因組DNA的提取 基因組DNA的提取 DNA 質(zhì)粒DNA的提取 質(zhì)粒DNA的提取 DNA 當(dāng)沉淀時(shí)間有限時(shí),用預(yù)冷的乙醇或異丙醇沉淀, 當(dāng)沉淀時(shí)間有限時(shí),用預(yù)冷的乙醇或異丙醇沉淀, 沉淀會(huì)更充分 沉淀時(shí)加入1/10體積的 體積的NaOAc(,3M),有 ),有 沉淀時(shí)加入 體積的 ( , ), 利于充分沉淀 沉淀后應(yīng)用70%的乙醇洗滌, 沉淀后應(yīng)用 %的乙醇洗滌,以除去鹽離子等 晾干DNA,讓乙醇充分揮發(fā)(不要過(guò)分干燥) ,讓乙醇充分揮發(fā)(不要過(guò)分干燥) 晾干 若長(zhǎng)期儲(chǔ)存建議使用TE緩沖液溶解 若長(zhǎng)期儲(chǔ)存建議使用 緩沖液溶解 ? ? TE中的 中的EDTA能螯和 2+或Mn2+離子,抑制 能螯和Mg 離子,抑制DNase 中的 能螯和 pH值為 ,可防止 ,可防止DNA發(fā)生酸解 值為 發(fā)生酸解 基因組DNA的檢測(cè) 基因組DNA的檢測(cè)提取的基因組DNA片段在 片段在20kb-30kb之間 提取的基因組 片段在 - 之間 高質(zhì)量的基因組DNA帶型 單一無(wú)拖尾現(xiàn)象 帶型 高質(zhì)量的基因組 DNA濃度及純度的檢測(cè) A260=1 約 50 ?g/ mL 雙鏈 濃度及純度的檢測(cè) 雙鏈DNA; ; A260/280 約為 DNA提取常見(jiàn)問(wèn)題 DNA提取常見(jiàn)問(wèn)題問(wèn)題一:DNA樣品不純 抑制后續(xù)酶解和PCR反應(yīng)。 原因 1. 2. 3. 4. DNA中含有蛋白、多 DNA中含有蛋白、 中含有蛋白 糖、多酚類雜質(zhì) DNA在溶解前 在溶解前, DNA在溶解前,有酒 精殘留, 精殘留,酒精抑制 后續(xù)酶解反應(yīng) DNA中殘留有金屬離 DNA中殘留有金屬離 子 RNA的存留 有RNA的存留 1. 對(duì) 策 2. 3. 4. 重新純化DNA, 重新純化DNA,過(guò)吸附 DNA 柱去除蛋白、多糖、 柱去除蛋白、多糖、 多酚等雜質(zhì) 重新沉淀DNA DNA, 重新沉淀DNA,讓酒精 充分揮發(fā) 增加70 70% 增加70%乙醇洗滌的 次數(shù)( 次數(shù)(23次) 加入RNase降解RNA RNase降解 加入RNase降解RNA DNA提取常見(jiàn)問(wèn)題 DNA提取常見(jiàn)問(wèn)題問(wèn)題二:DNA降解 降解。 原 因 1. 2. 3. 4. 5. 1. 2. 3. 材料不新鮮或反復(fù)凍 融 未很好抑制內(nèi)源核酸 對(duì) 酶的活性 提取過(guò)程操作過(guò)于劇 策 DNA被機(jī)械打斷 烈,DNA被機(jī)械打斷 外源核酸酶污染 反復(fù)凍融 4. 5. 盡量取新鮮材料, 盡量取新鮮材料,低溫保存材料避 免反復(fù)凍融 液氮研磨或勻漿組織后, 液氮研磨或勻漿組織后,應(yīng)在解凍 前加入裂解緩沖液 在提取內(nèi)源核酸酶含量豐富的材料 DNA時(shí) 的DNA時(shí),可增加裂解液中螯合劑 的含量, 的含量,細(xì)胞裂解后的后續(xù)操作應(yīng) 盡量輕柔 所有試劑用無(wú)菌水配制, 所有試劑用無(wú)菌水配制,耗材經(jīng)高 溫滅菌 DNA分裝保存于緩沖液中 分裝保存于緩沖液中, 將DNA分裝保存于緩沖液中,避免 反復(fù)凍融 DNA提取常見(jiàn)問(wèn)題 DNA提取常見(jiàn)問(wèn)題問(wèn)題三:DNA提取量少 提取量少。 原 因 1. 2. 3. 4. 1. 2. 實(shí)驗(yàn)材料不佳或量少 破壁或裂解不充分 吸附或沉淀不完全 洗滌時(shí)DNA丟失 洗滌時(shí)DNA丟失 DNA 對(duì) 策 3. 4. 盡量選用新鮮(幼嫩)的材 盡量選用新鮮(幼嫩) 料 動(dòng)植物要?jiǎng)驖{研磨充分; 動(dòng)植物要?jiǎng)驖{研磨充分;G+ 菌、酵母裂解前先用生物酶 或機(jī)械方式破壁。高溫裂解 時(shí),時(shí)間適當(dāng)延長(zhǎng)(對(duì)于動(dòng) 時(shí)間適當(dāng)延長(zhǎng)( 物細(xì)胞、細(xì)菌可增加PK PK的用 物細(xì)胞、細(xì)菌可增加PK的用 量)。 經(jīng)常更換新手套。 ,會(huì)導(dǎo)致 污染。 使用滅過(guò)菌的塑料制品和槍頭避免交叉污染。玻璃器皿可在 應(yīng)使用不含 的塑料和玻璃器皿。 。 酶抑制劑 異硫氰酸胍:目前是最有效的 酶抑制劑, 異硫氰酸胍:目前是最有效的RNA酶抑制劑,裂解組織的同時(shí)也使 酶抑制劑 RNA酶失活。既可破壞細(xì)胞結(jié)構(gòu)使核酸從核蛋白中解離出來(lái), 酶失活 RNA酶有強(qiáng)烈的變性作用。 酶有強(qiáng)烈的變性作用 氧釩核糖核苷復(fù)合物:由氧化釩離子和核苷形成的復(fù)合物, 氧釩核糖核苷復(fù)合物:由氧化釩離子和核苷形成的復(fù)合物,它和 RNA酶結(jié)合形成過(guò)渡態(tài)類物質(zhì),幾乎能完全抑制RNA酶的活性。 酶結(jié)合形成過(guò)渡態(tài)類物質(zhì) 酶的活性 RNA酶的蛋白抑制劑(RN
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