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蛋白質(zhì)iippt課件-在線瀏覽

2025-06-19 08:56本頁(yè)面
  

【正文】 類型。 ? Gly由于空間位阻小,構(gòu)象柔性大, 常形成 β轉(zhuǎn)角 ? ?折疊 (?pleated sheet) ? 結(jié)構(gòu)要點(diǎn) ? 兩條或多條幾乎完全伸展的多肽鏈側(cè)向聚集在一起,相鄰肽鏈上的- NH和 C= O之間形成有規(guī)則的氫鍵,這樣的多肽構(gòu)象就是 β-折疊。 ?= +113176。 ?= +135176。 ? 多肽主鏈為據(jù)齒狀折疊構(gòu)象,側(cè)鏈的 C?- C?鍵幾乎垂直于折疊片平面,側(cè)鏈 R基交替地分布在片層平面的兩側(cè) ? 纖維狀蛋白的 ?折疊主要在不同肽鏈間形成,而球狀蛋白則可以在肽鏈的不同片段間形成 ? 常出現(xiàn)在 ?折疊的 Aa: ? Ile、 Leu、 Tyr、 Val、 Phe、 Lys ? β轉(zhuǎn)角( βtrun) ? 結(jié)構(gòu)要點(diǎn) ? 三種類型: 每種類型都有 4個(gè) Aa殘基 ? 類型 I、類型 II,均為伸展彎折(無(wú)螺旋),差別在于中心肽單位相互之間有 180?的旋轉(zhuǎn)關(guān)系 ? 類型 III在第一和第三個(gè)氨基酸殘基之間形成一小段 310螺旋 ? 彎曲處的第一個(gè)殘基的 C=O和第四個(gè)殘基的 NH之間形成一個(gè) 4→1氫鍵。 ? 單條肽鏈構(gòu)成的蛋白質(zhì)所具有的最高級(jí)構(gòu)象 ? 蛋白質(zhì)表現(xiàn)完整生物活性的最低構(gòu)象要求,即只有具有了完整的三級(jí)結(jié)構(gòu),才能表現(xiàn)出蛋白質(zhì)的生物活性 ? 超二級(jí)結(jié)構(gòu)( supersecondary structure) ? 定義: ? 在蛋白質(zhì)中,特別是球狀蛋白質(zhì)中,若干相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)單元組合在一起。 ? 在結(jié)構(gòu)的組織層次上高于二級(jí)結(jié)構(gòu),但沒(méi)有構(gòu)成完整的結(jié)構(gòu)域 ? 常見(jiàn)的超二級(jí)結(jié)構(gòu) ? ??型 ? 由兩股或三股右手 ?- helix彼此纏繞而成的左手超螺旋,重復(fù)距離約為 14nm ? 是 ?-角蛋白、肌球蛋白、原肌球蛋白、纖維蛋白質(zhì)中的一種超二級(jí)結(jié)構(gòu) ? ?- helix的結(jié)構(gòu)作出相應(yīng)調(diào)整 ? 每圈螺旋為 3. 5個(gè)殘基,重復(fù)單位 0. 51nm ? 單個(gè)的 ?- helix每隔 7個(gè)殘基重復(fù)一次 ? 穩(wěn)定因素是非極性側(cè)鏈間的范德華力 ? ???型 ? 由二段平行式的 ?-鏈和一段連接鏈組成,此超二級(jí)結(jié)構(gòu)稱 β β-單位 ? 連接鏈 ?- helix或 無(wú)規(guī)則卷曲大體上反平行于 ?-鏈 ? 最常見(jiàn)的 β β組合是由三段平行式的 ?-鏈和二段 ?- helix鏈構(gòu)成,此超二級(jí)結(jié)構(gòu)稱 Rossmann折疊 ? 幾乎所有的實(shí)例(只有兩個(gè)例外)中連接都是以右手交叉連接方式處于 β-折疊的一側(cè) ? ???型 ? ?-曲折和回形拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)( ??? )組合的二種超二級(jí)結(jié)構(gòu) ? ?-曲折: 由在一級(jí)結(jié)構(gòu)上連續(xù),在 ?-折疊中相鄰的三條反平行式, ?-鏈通過(guò)緊湊的 ?-轉(zhuǎn)角連接而成, ?-曲折含有與 ?- helix相近數(shù)目的氫鍵。 ? 三級(jí)結(jié)構(gòu)的主要維系因素 ? 氫鍵、疏水鍵、離子鍵和范德華力等。 ? 蛋白結(jié)構(gòu)的實(shí)例 ? 球狀蛋白 ? 纖維狀蛋白 ? 角蛋白 ( Keratin) ? ?角蛋白 ? ? 角蛋白 ? 膠原蛋白 ? 定 義: ? 蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu) (Quaternary Structure)是指由多條各自具有一、二、三級(jí)結(jié)構(gòu)的肽鏈通過(guò)非共價(jià)鍵連接起來(lái)的結(jié)構(gòu)形式;各個(gè)亞基在這些蛋白質(zhì)中的空間排列方式及亞基之間的相互作用關(guān)系。這種同位效應(yīng)稱正協(xié)同效應(yīng) ? 負(fù)協(xié)同效應(yīng) : 第一個(gè)配基的結(jié)合導(dǎo)致第二個(gè),第三個(gè) … 配基更難結(jié)合,這種同位效應(yīng)稱負(fù)協(xié)同效應(yīng) ? 異位效應(yīng): 如果蛋白質(zhì)分子中,相互之間發(fā)生作用的部位是不同的,也即活性部位上所發(fā)生的反應(yīng)將受到調(diào)節(jié)部位與效應(yīng)物結(jié)合的影響,稱 異位效應(yīng) ? 血紅蛋白的結(jié)構(gòu)與功能 ? 組成: 4個(gè)亞基組成 , 成年人紅細(xì)胞由 ?、 ?兩種亞基各兩條構(gòu)成 ? 每條肽鏈都卷曲成球狀, 都有一個(gè)空隙容納一個(gè)血紅素,它們都能與氧氣結(jié)合。而是有 4個(gè)不同的平衡常數(shù), Hb與最后一個(gè)氧氣結(jié)合時(shí)其結(jié)合力最大 ? Hb與氧氣結(jié)合將影響其四級(jí)結(jié)構(gòu),即亞基與亞基之間的相對(duì)位置發(fā)生變動(dòng),這種變化增強(qiáng)了 Hb和 O2的親和力 ? 蛋白質(zhì)各級(jí)結(jié)構(gòu)之間的相互關(guān)系 ? 各級(jí)結(jié)構(gòu)之間的遞進(jìn) ? 一級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)高級(jí)結(jié)構(gòu)的指導(dǎo)作用 ? 一級(jí)結(jié)構(gòu)是高級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ) ? 高級(jí)結(jié)構(gòu)由一級(jí)結(jié)構(gòu)和其他構(gòu)象指導(dǎo)因素共同決定 ? 最低勢(shì)能原則 :分子的穩(wěn)定構(gòu)象往往是該分子內(nèi)結(jié)構(gòu)勢(shì)能最低的狀態(tài) ? 微環(huán)境和折疊輔助因子的影響 ? 高級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)低級(jí)結(jié)構(gòu)的影響 residue C- N鍵長(zhǎng): C= N鍵長(zhǎng): C N鍵長(zhǎng): 一種四肽的結(jié)構(gòu) C C N C C N C C N C C N CC H 2 C H C H 2 C H 2 C H 2C O OO H C O 2 H C H 2C O N H 2O HC H 3H 3 N+O O O OH H H H HH H H HS er V al T y r A s p G l nC H 3N 端 C 端肽鍵SerValTyr Asp Gln 上面結(jié)構(gòu)為全部質(zhì)子化的離子形式 溶液的 pH 功能團(tuán)解離(帶電)狀況 占優(yōu)勢(shì)離子的凈電荷 αCOOH COOH αNH2 εNH2 < - COOH - COOH - + N H3 - + N H3 +2 - - COO- - COOH - + N H3 - + N H3 +1 - - COO- - COO- - + N H3 - + N H3 0 - - COO- - COO- - NH2 - + N H3 1 > - COO- - COO- - NH2 - NH2 2 +NH3 GluGluGluCOO COO COO COO pK‘?NH2=, Pk’?COOH =, pK’R = 因?yàn)樵撾淖疃鄮б粋€(gè)正電荷;而最多可以帶四個(gè)負(fù)電荷;所以等電點(diǎn)時(shí),應(yīng)該是三個(gè)側(cè)鏈基團(tuán)不離解,而末端 COOH離解, pI=1/2( pK’R+ pK’?COOH ) +NH3 LysLysLysCOO +NH3 +NH3 +NH3 pK‘?NH2 =, Pk’?COOH =, pK’R = 該肽最多可有四個(gè)正電荷、一個(gè)負(fù)電荷,所以等電點(diǎn)時(shí),應(yīng)該是末端+NH3離解,而三個(gè)側(cè)鏈基團(tuán),有兩個(gè)離解,因此 pI= pK’R+lg( 2/1) NHCOC H2N H COC H N H COC H3C HC HO HC H2O HC HH N C N H C H C N H C H2CC OC HNHH OC H2N HN HC H C HC H3C H2C
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