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生物化學(xué)復(fù)習(xí)資料(1)-在線瀏覽

2025-02-25 21:55本頁面
  

【正文】 質(zhì),按照分子大小電泳分離蛋白質(zhì)或其他分子混合物的一種技術(shù)。 雙向電泳:先按照等電點(diǎn)進(jìn)行等電聚焦電泳,然后在垂直方向按照分子大小再進(jìn)行 SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳,經(jīng)染色得到的電泳圖是二維分布的蛋白質(zhì)圖。 ?什么是凱氏定氮法? 元素組成特點(diǎn):由 CHONSPISe 等元素組成 :C( 50~55%)、 H( 6~8%)、 O( 20~23%)、 N( 15~18%)、 S( 0~4%)、 ?;氮元素含量平均約 16%。它們在結(jié)構(gòu)上有什么共同特點(diǎn) ? 結(jié)構(gòu)上共同特點(diǎn): Cα 結(jié)合( NH3)( Pro 除外)、( COOH)、 H 原子和各種側(cè)鏈( R); Cα是不對稱 C,具有手性( Gly除外),蛋白質(zhì)氨基酸都是 L型。 N末端分析: Sanger法、丹磺酰氯法(有很強(qiáng)熒光 ,靈敏度高)、 Edman法、氨肽酶法(外肽酶:肽鏈外切酶) C末端分析:羧肽酶法、與苯甲醛沉淀等。 還原法(含巰基 化合物使 S—S還原產(chǎn)生兩個(gè)半胱氨酸殘基( CysSH) ,烷化劑(如碘乙酸)修飾 SH,阻止二硫鍵再生成); 氧化法(過甲酸使 S—S氧化斷裂,生成半胱氨磺酸)。 酸水解法: 6mol/LHCl110℃ 加熱回流 16~24h,完全水解, Trp 被破壞, Gln,Asn酰胺基水解變成 Glu,Asp(Glx,Asx)近年來用甲基磺酸代替鹽酸。 ? 多肽鏈部分 斷裂,蛋白質(zhì)分解為小片段,肽段分離(至少兩套) 酶水解法:內(nèi)肽酶(肽鏈內(nèi)切酶) 胰蛋白酶法:水解 Lys或 Arg的羧基形成的肽鍵 糜蛋白酶(胰凝乳蛋白酶)法:水解 Phe、 Trp和 Tyr等疏水氨基酸的羧基形成的肽鍵 胃蛋白酶法:被斷裂鍵兩側(cè)的殘基都是疏水性氨基酸如: PhePhe 化學(xué)法 ——CNBr法:裂解由 Met羧基形成的肽鍵。 結(jié)構(gòu)有幾種基本類型 ?各有何特點(diǎn) ? 基本類型: α螺旋; β折疊片層; β轉(zhuǎn)角;不規(guī)則卷曲 特點(diǎn): α螺旋:右手螺旋, φ=- 57176。每個(gè)螺旋圈含 個(gè)氨基酸殘基,螺距 ,每個(gè)殘基沿軸旋轉(zhuǎn) 100176。 β折疊片層:肽鍵平面遇 Cα發(fā)生折疊 ,形成鋸齒狀結(jié)構(gòu), R 側(cè)鏈交錯(cuò)位于折疊片的上面和下面,兩個(gè)殘基形成一個(gè)重復(fù)單位;兩條 或多條肽鏈片段順向平行(平行)或反向平行(反平行)排列,形成片層結(jié)構(gòu);相鄰肽鏈上所有的羰基氧和氨基氫形成鏈間氫鍵。 ψ=+ 113176。 反平行 (Antiparallel): φ=- 140176。;重復(fù)單位 。的回折形成發(fā)夾形狀;一般四個(gè)氨基酸組成,常見氨基酸: Pro,Gly,Asp,Asn,Trp;第 1個(gè)氨基酸殘基的 C=O與第 4個(gè)殘基的 NH之間形成氫鍵。 ? 特點(diǎn):多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上高度折疊成緊密球形或橢球形結(jié)構(gòu);大多數(shù)可離子化的親水的氨基酸殘基都位于分子表面(表面也含有疏水的氨基酸殘基),疏水氨基酸殘基大部分埋藏在分子內(nèi)部(特別是一些疏水性強(qiáng)的氨基酸,如纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、苯丙氨酸和蛋氨酸,通常水分子被排除在蛋白內(nèi)部);三級結(jié)構(gòu)可將某些局部的二級結(jié)構(gòu)聚合在一起,形成特定的結(jié)構(gòu)區(qū)域,大多為口袋狀,核心多為疏水氨基酸,結(jié)合蛋白質(zhì)的輔基常位于其中,多為蛋白質(zhì)的活性中心;穩(wěn)定維系三級結(jié) 構(gòu)的作用力有:氫鍵、鹽鍵、疏水鍵、范德華力、二硫鍵和配位鍵。 一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 一級結(jié)構(gòu)不同 ,生物學(xué)功能各異:加壓素和催產(chǎn)素 一級結(jié)構(gòu)的關(guān)鍵部分相同,其功能也相同:同源蛋白 一級結(jié)構(gòu)的關(guān)鍵部分變化 ,生物學(xué)活性改變或喪失: ACTH(39肽 ),切去 C 端 15個(gè)氨基酸仍有活性 ,但 N端 24個(gè)氨基酸切去一個(gè)就會影響活性; 一級結(jié)構(gòu)變化,生物學(xué)活性改變或喪失:疾病鐮刀狀紅細(xì)胞性貧血 (Sicklecellanemia)Hbβ鏈 6位的 空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 酶原的激活:水解一個(gè)或幾個(gè)特定肽段致使酶分子構(gòu)象發(fā)生重塑 ——酶活性部位形成和暴露,表現(xiàn)出酶活性。 ? 組成和構(gòu)象特點(diǎn): 原 膠原蛋白分子頭尾相連,交錯(cuò)排列,分子間共價(jià)交連,形成特征性帶狀纖維束。膠原鏈:每一圈螺旋含 3 個(gè)氨基酸殘基,每一個(gè)氨基酸殘基軸向距離為,螺距為 ;常重復(fù)出現(xiàn)三聯(lián)體序列 GlyProHyp。 ?變性蛋白質(zhì)的性質(zhì)有哪些變化 ? 變性的因素:熱、紫外光、激烈的攪拌、強(qiáng)酸、強(qiáng)堿等。 2)理化性質(zhì)改變: ① 分子形狀改變,肽鏈松散伸展,反應(yīng)基團(tuán)增加,易被水解 ,易被酶消化。但若溶液 pH與蛋白質(zhì)的 pI差別較大 ,蛋白質(zhì)仍不易沉淀。 ?有什么生理意義 ? 可解離的基團(tuán): N端氨基、 C端羧基、側(cè)鏈氨基、羧基、羥基、巰基、咪唑基、胍基等。 14制備生物大分子的基本步驟是什么 ? 基本步驟 ① 確定制備生物大分子的目的和要求(科研、開發(fā)、發(fā)現(xiàn)新物質(zhì))。整個(gè)分離純化過程的 ―眼睛 ‖ 制備生物大分子的關(guān)鍵。 ⑥ 生物大分子制備物的純度鑒定:要求達(dá)到一維電泳一條帶,二維電泳一個(gè)點(diǎn),或 HPLC和毛細(xì)管電泳都是一個(gè)峰。 ? 破碎細(xì)胞方法: ① 機(jī)械法:研磨、組織搗碎器 ② 物理法:反復(fù)凍融法、超聲波、壓 榨法、冷熱交替法 ③ 化學(xué)與生物化學(xué)方法:自溶法、溶脹法、酶解法、有機(jī)溶劑處理法。 防止蛋白酶或核酸酶的降解:加入抑制劑或調(diào)節(jié)提取液 pH、離子強(qiáng)度或極性,使水解酶失活。 ?常用的有機(jī)溶劑有哪些 ? 難溶于水、稀鹽、稀酸、或稀堿的蛋白質(zhì)和酶;既溶于稀酸、稀堿,又溶于含有一定比例有機(jī)溶劑的水溶液的蛋白質(zhì)和酶 常用的有機(jī)溶劑:乙醇、丙酮、異丙醇、正丁醇等。 以溶解度的差異為依據(jù):鹽析、萃取、分配層析、選擇性沉淀和結(jié)晶等。 以生物學(xué)功能專一性為依據(jù):親和層析等 ,早期和晚期的分離純化方法有何不同 ? 分離純化流程中,早期和晚期分離純化方法的不同: ? 早期分離純化 :粗提取液(物質(zhì)成份復(fù)雜,物理化學(xué)性質(zhì)相近的物質(zhì)很多,目的產(chǎn)物濃度很?。?,所選方法要求快速、粗放;能較大地縮小體積;分辨力不必太高;負(fù)荷能力要大。吸附層析、 鹽析、凝膠過濾、離子交換層析、親和層析、等電聚焦制備電泳、制備 HPLC等。 蛋白質(zhì)和酶制成品: SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳和等電聚焦電泳(再用高效液相色譜( HPLC)和毛細(xì)管電泳( CE)進(jìn)行聯(lián)合鑒定則更為理想,必要時(shí)再做 N-末端氨基酸殘基的分析鑒定)。 核酸通常采用:瓊脂糖凝膠電泳和聚丙 烯酰胺凝膠電泳,最方便是紫外吸收法。 溫度:每種生物大分子都有其穩(wěn)定的溫度范圍,低溫抑制氧化、水解等化學(xué)反應(yīng)和微生物。 光線:光化作用 ——受光催化發(fā)生變色、氧化和分解等;吸收光,分子活化不利于保存,紫外線能量大,對制品影響最大。 三.計(jì)算與推論題 計(jì)算 ① 谷氨酸、 ② 精氨酸、 ③ 丙氨酸的等電點(diǎn)。 ② 精氨酸和甲硫氨酸: pH7. 0精氨酸凈電荷+ 甲硫氨酸凈電荷接近零,甲硫氨酸先洗脫。 ④ 甘氨酸和亮氨酸: pH7. 0 甘氨酸、亮氨酸凈電荷接近零,亮氨酸非極性大,甘氨酸先洗脫。 下面的數(shù)據(jù)是從一個(gè)八肽降解和分析得到的,其組成是: Ala、 Gly Lys、Met、 Ser、 Thr、 Tyr。用胰蛋白酶處理得到 ① Ala、 Gly; ② Gly、 Lys、 Met、 Ser、 Thr、Tyr。與DNFB反應(yīng)可產(chǎn)生 DNPGly。請確定該肽的氨基酸順序。 輔基:與酶蛋白以共價(jià)緊密結(jié)合 ,不容易被透析或超濾法除去,如黃素和生物素等。 誘導(dǎo)契合學(xué)說: 1958, Koshland,酶活性中心結(jié)構(gòu)是柔性的,當(dāng)?shù)孜铮せ顒┗蛞种苿┡c酶分子結(jié)合時(shí),底物分子誘導(dǎo)酶蛋白構(gòu)象發(fā)生有利于與底物結(jié)合的變化,使反應(yīng)所需催化基團(tuán)和結(jié)合基團(tuán)正確排列和定向,轉(zhuǎn)入有效的作用位置,使酶與底物完全吻合,契合形成中間產(chǎn)物酶-底物復(fù)合物。 酶的最適 pH:表現(xiàn)出酶最大活性的 pH值。 酶的最適溫度:酶活性最高時(shí)的溫度 ,也即酶促反應(yīng)速度最大時(shí)的溫度。 不可逆抑制:與酶的必需基團(tuán)共價(jià)結(jié)合 ,使酶喪失活性 ,不能用透析超濾等物理方法除去抑制劑使酶恢復(fù)活性。 可逆抑制:與酶以非共價(jià)鍵疏松結(jié)合使酶活性降低或喪失 ,能夠通過透析、超濾等物理方法除去抑制劑使酶恢復(fù)活性。 競爭性抑制作用:抑制劑結(jié)構(gòu)與底物結(jié)構(gòu)相似,與底物競爭同一種酶的活性中心,從而影響 E與 S的結(jié)合,使酶活性降低。 非競爭性抑制作用:抑制劑與酶分子活性中心以外的其它部位結(jié)合而抑制酶活性, I和 S與酶結(jié)合不存在競爭關(guān)系。 反競爭性抑制作用:抑制劑( I)僅與酶 —底物中間復(fù)合物( ES)結(jié)合而抑制酶活性。 酶原:在細(xì)胞內(nèi)合成或初分泌時(shí)無活性的酶的前體。 共價(jià)調(diào)節(jié)酶:能通過可逆共價(jià)修飾調(diào)節(jié)活性的酶。 寡聚酶:兩個(gè)或兩個(gè)以上亞基以非共價(jià)鍵結(jié)合蛋白質(zhì)酶。 多酶復(fù)合體:功能相關(guān),不同種類的酶非共價(jià)彼此鑲嵌形成的復(fù)合體 酶的回收率:(每次總活力 ∕第一次總活力) 100 酶的提純倍數(shù): 每次比活力 ∕第一次比活力 比活力:每毫克蛋白所含有的酶活力單位數(shù)。 別構(gòu)效應(yīng):變構(gòu)劑與酶的別構(gòu)部位結(jié)合,引起酶活性部位的構(gòu)象改變從而改變酶的活性。 區(qū)別:高效性:顯著降低化學(xué)反應(yīng)的活化能,提高反應(yīng)速度 107 —1013倍(非酶催化劑)或 108—1
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